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北京工商大學 分子生物學復習資料

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1、 1.證明DNA是主要的遺傳物質(zhì)的兩個實驗 一個是肺炎雙球菌的轉(zhuǎn)化實驗,另一個是噬菌體侵染細菌的實驗 ①肺炎雙球菌轉(zhuǎn)化實驗:研究者從有莢膜、菌落光滑的S型肺炎雙球菌細胞中提取DNA,加入到無莢膜、菌落粗糙的R型細菌培養(yǎng)物中,發(fā)現(xiàn)DNA能使部分R型細胞獲得合成S型細胞特有的莢膜多糖的能力。而蛋白質(zhì)及多糖類物質(zhì)沒有這種轉(zhuǎn)化能力,若將DNA事先用脫氧核糖核酸酶降解,則失去轉(zhuǎn)化能力。已經(jīng)轉(zhuǎn)化了得細菌,其后代仍保留合成S型莢膜的能力,說明此性狀可以遺傳給后代。 ②對噬菌體研究的進展使人們發(fā)現(xiàn),噬菌體侵染宿主細菌后,能繁殖產(chǎn)生大量的子代噬菌體。用含35S和32P標記的培養(yǎng)基進行T2噬菌體培養(yǎng),使T

2、2噬菌體的蛋白質(zhì)被35S標記,DNA被32P標記。將兩種不同標記的噬菌體分別侵染E.coil后,發(fā)現(xiàn)進入宿主細胞的只有32P標記的DNA,而無35S標記物。所產(chǎn)生的子代噬菌體只含有32P標記的DNA,不含有S標記的蛋白質(zhì)。T2侵染實驗證明了DNA進入宿主細胞是產(chǎn)生、決定子代噬菌體的遺傳物質(zhì)。 2. 核酸的化學組成及分子組成 化學組成:基本元素:C、H、O、N、P 核苷酸:核苷+磷酸 核苷:戊糖+堿基 核酸的元素組成有兩個特點:①一般不含S。②P含量較多,并且恒定(9%-10%)。分子組成:核酸(DNA和RNA):線性多聚核苷酸,基本結(jié)構(gòu)單元:核苷酸 3.核酸的生物學作用 DNA

3、:主要的遺傳物質(zhì) RNA:①作為細胞內(nèi)蛋白質(zhì)生物合成的主要參與者②具有生物催化劑的功能,作用于初始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的剪接加工。③與生物機體的生長發(fā)育密切相關(guān),,參與基因表達的調(diào)控。④與生物體的進化有很大關(guān)系 4.核酸的一、二、三級結(jié)構(gòu)分別指什么,各自的特點如何 DNA:一級結(jié)構(gòu):構(gòu)成DNA的脫氧核苷酸按照一定的排列順序,通過3’,5’-磷酸二酯鍵相連形成的線形結(jié)構(gòu)。 特點:不均一性①重復序列②富含AT的序列 二級結(jié)構(gòu):DNA的兩條多聚核苷酸鏈間通過氫鍵形成雙螺旋結(jié)構(gòu)。 特點:①主鏈:兩條長鏈反向平行螺旋而成螺旋直徑為2nm ②堿基對 ③螺距:為3.4nm ④大溝、小溝 三級

4、結(jié)構(gòu):DNA雙鏈進一步折疊卷曲形成的構(gòu)象。 RNA:一級結(jié)構(gòu)的特點 ① 組成RNA的戊糖是核糖 ②RNA的U替代DNA中的T,此外,RNA中常有一 些稀有堿基。 ③ 天然RNA分子都是單鏈線形分子,只有部分區(qū)域是A-型雙螺旋結(jié)構(gòu)。 5.Watson Crick雙螺旋結(jié)構(gòu)模型特點1)兩條反平行的多核苷酸鏈繞同一中心軸相纏繞,形成右手雙股螺旋,一條5’→3’,另一條3’→5’ 2)磷酸與脫氧核糖彼此通過3’5’-磷酸二酯鍵相連接,構(gòu)成DNA分子的骨架。 3)磷酸與脫氧核糖在雙螺旋外側(cè),嘌呤與嘧啶堿位于雙螺旋的內(nèi)側(cè)。 4)堿基平面與縱軸垂直,糖環(huán)平面與縱軸平行。兩條核苷酸鏈

5、之間依靠堿基間的氫鏈結(jié)合在一起。螺圈之間主要靠堿基平面間的堆積力維持 5)每圈螺旋含10個核苷酸,堿基堆積距離0.34nm,雙螺旋平均直徑2nm, 6)大溝:寬1.2nm ,深0.85nm,小溝:寬0.6nm,深0.75nm 6.DNA二級結(jié)構(gòu)的多態(tài)性 所謂DNA二級結(jié)構(gòu)的多態(tài)性,是指DNA不僅具有多種形式的雙螺旋結(jié)構(gòu),而且還能形成三鏈、四鏈結(jié)構(gòu),說明DNA的結(jié)構(gòu)是動態(tài)的,而不是靜態(tài)的。核酸的構(gòu)型的多樣性是由于核酸主干鏈上各鍵和堿基的旋轉(zhuǎn)造成的,而多鏈的DNA是特定的堿基序列導致的結(jié)果。 7.什么是拓撲異構(gòu)酶,有幾類 引起DNA拓撲異構(gòu)之間轉(zhuǎn)變的酶,可改變DNA拓撲異構(gòu)體

6、的L值,有兩類:兩類酶含量嚴格控制,使細胞內(nèi)DNA保持一定超螺旋水平。①拓撲異構(gòu)酶酶I(解旋酶)能使雙鏈負超螺旋DNA轉(zhuǎn)變成松馳形環(huán)狀DNA,每次催化使L值增加1。②拓撲異構(gòu)酶酶II(促旋酶)能使松馳環(huán)狀DNA轉(zhuǎn)變成負超螺旋形DNA,每次催化使L減少2。 8.什么是基因組、C值與C值矛盾 基因組:凡是具有細胞形態(tài)的所有生物其遺傳物質(zhì)都是DNA。在真核細胞中,每條未復制的染色體包裝一條DNA分子,一個生物貯存在單倍染色體組中的總遺傳信息,稱為該生物的基因組。 C值:一個單倍體基因組的DNA含量。C值矛盾:指C值往往與種系進化的復雜程度不一致,某些低等動物卻具有較大的C值。 9.染色體與核

7、小體的組成與結(jié)構(gòu) 核小體:①組蛋白八聚體構(gòu)成核小體的盤狀核心結(jié)構(gòu)②146bp的DNA分子超螺旋盤繞組蛋白八聚體1.75圈(核心小體),組蛋白H1在核心顆粒外結(jié)合額外20bp DNA,鎖住核小體DNA的進出端,起穩(wěn)定核小體的作用。包括組蛋白H1和166bp DNA的核小體結(jié)構(gòu)又稱染色質(zhì)小體。 ③兩個相鄰核小體之間以連接DNA 相連,典型長度60bp,不同物種變化值為0~80bp形成核小體。核小體單位包括200bp左右的DNA超螺旋和一個組蛋白八聚體及一個分子H1。 ④組蛋白與DNA之間的相互作用主要是結(jié)構(gòu)性的,基本不依賴于核苷酸的特異序列,實驗表明,核小體具有自組裝(self-assemb

8、le)的性質(zhì) ⑤核小體沿DNA的定位受不同因素的影響進而通過核小體相位改變影響基因表達 DNA+組蛋白7核小體(11nm)6螺線管(30nm)40超螺線管(300nm)5染色單體 10.RNA的種類與各自特點 RNA一級結(jié)構(gòu)的特點①組成RNA的戊糖是核糖②RNA的U替代DNA中的T,此外,RNA中常有一些稀有堿基。③天然RNA分子都是單鏈線形分子,只有部分區(qū)域是A-型雙螺旋結(jié)構(gòu) (1)、tRNA的結(jié)構(gòu)①70-90b,分子量在25kd左右,沉降系數(shù)4S左右②有較多稀有堿基③3’末端為…CCA-OH④5’末端大多為pG…或pC…⑤二級結(jié)構(gòu)是三葉草形⑥倒L形的三級結(jié)構(gòu)。 tRNA的

9、功能:①轉(zhuǎn)運氨基酸②識別密碼子③參與翻譯起始④參與DNA的反轉(zhuǎn)錄⑤參與基因表達調(diào)控 (2)、mRNA的結(jié)構(gòu):原核:多順反子。真核:單順反子,斷裂基因。 5’-帽子:m7G 5’-ppp5’-Nm(Nm )p- ①由甲基化酶催化②可抵抗5’核酸外切酶降解mRNA。③可為核糖體提供識別位點,使mRNA很快與核糖體結(jié)合,促進蛋白質(zhì)合成起始復合物的形成。 3’-端有一段約30-300核苷酸的polyA。 ①轉(zhuǎn)錄后由poly(A)聚合酶催化加尾②PolyA是mRNA由核進入胞質(zhì)所必需的形式。③polyA與mRNA半壽期有關(guān),polyA大大提高mRNA在胞質(zhì)中的穩(wěn)定性。 原核mRNA的

10、結(jié)構(gòu)(多順反子)①由先導區(qū)、插入序列、翻譯區(qū)和末端序列組成。沒有5’帽子和3’polyA。②SD序列:5’端先導區(qū)中,有一段富含嘌呤的堿基序列,典型的為5’-AGGAGGU-3’,位于起始密碼子AUG前約10核苷酸處,此序列由Shine和Dalgarno發(fā)現(xiàn),稱SD序列。③SD序列和核糖體16S的rRNA的3’末端富含嘧啶堿基的序列互補。 (3)、rRNA的結(jié)構(gòu) 細菌:16S rRNA、5S rRNA、23S rRNA組成30S轉(zhuǎn)錄單位 真核:18SrRNA、5.8S rRNA,28S rRNA組成45S的轉(zhuǎn)錄單位,5S rRNA單獨轉(zhuǎn)錄。 rRNA的功能:①組成核糖體②催化肽鍵形

11、成的轉(zhuǎn)移酶活性存在于23SrRNA上③參與tRNA與mRNA的結(jié)合 RNA的高級結(jié)構(gòu)特點 ①RNA是單鏈分子,因此,在RNA分子中,并不遵守堿基種類的數(shù)量比例關(guān)系,即分子中的嘌呤堿基總數(shù)不一定等于嘧啶堿基的總數(shù)。 ②RNA分子中,部分區(qū)域也能形成雙螺旋結(jié)構(gòu),不能形成雙螺旋的部分,則形成突環(huán)。這種結(jié)構(gòu)可以形象地稱為“發(fā)夾型”結(jié)構(gòu)。 ③在RNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)中,堿基的配對情況不象DNA中嚴格。G 除了可以和C 配對外,也可以和U 配對。G-U 配對形成的氫鍵較弱。不同類型的RNA, 其二級結(jié)構(gòu)有明顯的差異。 ④tRNA中除了常見的堿基外,還存在一些稀有堿基,這類堿基大部分位于突環(huán)部分

12、 11.什么是ORF、順反子、轉(zhuǎn)座子? 開放閱讀框ORF:結(jié)構(gòu)基因的正常核苷酸序列。從起始密碼子到終止密碼子的閱讀框,可編碼完整的多肽鏈。期間不存在使翻譯終止的終止密碼子。通常是從DNA推論出來的。順反子:—遺傳上的功能單位,對應于一條多肽鏈的DNA加上起始信號和終止信號。多順反子:有一條mRNA分子編碼幾條不同的多肽鏈(原核生物)。單順反子:只編碼一條多肽鏈的mRNA。轉(zhuǎn)座子:一些基因可以從染色體的一個基因座位轉(zhuǎn)到另一個基因座位,該特性稱轉(zhuǎn)座,這些基因叫轉(zhuǎn)座子,又叫跳躍基因。 12.真核基因組的特點 1.更大的DNA分子,以染色體形式儲存于細胞核內(nèi),除配子細胞外,體細胞內(nèi)的基

13、因的基因組是雙份的。(1)并非生物越高等,基因組越大。即并非進化的復雜程度與DNA含量成正比。(2)同一類生物基因組可能相差很大。(3)基因組中DNA的量遠大于編碼蛋白質(zhì)所需要的量。2. 基因組結(jié)構(gòu)復雜,有多個復制啟始位點。3. 基因是不連續(xù)的,有內(nèi)含子結(jié)構(gòu)。4. 轉(zhuǎn)錄單位一般是單順反子的。 13.核酸的水解方式有哪幾種 核酸的水解-酸、堿和酶 1.核酸的酸解和堿解: 核酸的水解包括糖苷鍵和磷酸酯鍵的水解 2、核酸的酶解:生物體內(nèi)存在多種核酸水解酶。這些酶可以催化水解多聚核苷酸鏈中的磷酸二酯鍵。(專一催化核酸的磷酸二酯鍵的酶為核酸酶) 14.什么是核酸的變性、復性、雜交,什么是Tm值

14、 核酸的變性是指核酸雙螺旋區(qū)的氫鍵斷裂,變成單鏈結(jié)構(gòu)的過程。變性核酸將失去其部分或全部的生物活性。核酸的變性并不涉及磷酸二酯鍵的斷裂,所以它的一級結(jié)構(gòu)(堿基順序)保持不變。 復性:變性DNA在適當?shù)臈l件下,兩條彼此分開的單鏈可以重新締合成為雙螺旋結(jié)構(gòu),這一過程稱為復性。 雜交:熱變性的DNA單鏈,在復性時并不一定與同源DNA互補鏈形成雙螺旋結(jié)構(gòu),它也可以與在某些區(qū)域有互補序列的異源DNA單鏈形成雙螺旋結(jié)構(gòu),這樣形成的新分子稱為雜交DNA分子。Tm:DNA的變性過程是突變性的,它在很窄的溫度區(qū)間內(nèi)完成。因此,通常將DNA的變性達到50%時,即增色效應達到一半時的溫度稱為DNA的解鏈溫度(T

15、m),Tm也稱熔解溫度或DNA的熔點。 15. 什么是DNA復制,其特點如何 復制:以親代DNA或RNA為模板,根據(jù)堿基配對的原則,在一系列酶的作用下,生成與親代相同的子代DNA或RNA的過程。 特點:①半保留復制②半不連續(xù)復制 半保留復制:在DNA復制過程中,兩條螺旋的多核苷酸鏈之間的氫鍵斷裂,然后以每條鏈各作為模板合成新的互補鏈。這樣新形成的兩個子代DNA分子與原來DNA分子的堿基順序完全一樣。在此過程中,每個子代分子的一條鏈來自親代DNA。另一條鏈則是新合成的,這種復制方式稱為半保留復制。半不連續(xù)復制:DNA復制時,一條鏈(前導鏈)是連續(xù)合成的,而另一條鏈(后隨鏈)的合成卻是不連

16、續(xù)的。 16.什么是復制起點,原核與真核生物復制起點有何不同,復制方式有哪幾種 復制起點:復制開始處DNA分子的特定位置。 原核生物:單復制起點,即整個染色體只有一個復制單位。 真核生物: 多復制起點,即有多個復制單位。 復制方式:大多數(shù)以對稱方式進行,即兩條鏈同時復制,也有一定時期內(nèi)DNA只復制一條鏈的情況。 (1)從新起始或復制叉式(2)置換式(線粒體和葉綠體的DNA復制方式)(3)共價延伸方式或滾環(huán)式復制 17. 什么是前導鏈,后隨鏈,崗崎片斷 前導鏈:與復制叉移動的方向一致,通過連續(xù)的5ˊ-3聚合合成的新DNA鏈。 后隨鏈:與復制叉移動的方向相反,通過不連續(xù)的

17、5ˊ-3ˊ聚合合成的新的DNA鏈。 岡崎片段:在DNA不連續(xù)復制過程中,沿著后隨鏈的模板鏈合成的新DNA片段,其長度在真核與原核生物當中存在差別,真核生物的岡崎片段長度約為100~200核苷酸殘基,而原核生物的為1000~2000核苷酸殘基。 18.DNA復制的一般特點是怎樣的 1.DNA的雙螺旋的兩條鏈在局部需要解開,以利于每條鏈作模板。 2.DNA的局部解旋引起周圍區(qū)域過度纏繞, 拓樸異構(gòu)酶使超螺張力釋放. 3.DNA聚合酶以5`到3`方向合成。DNA的兩條鏈方向相反,因此,,一條鏈的合成是連續(xù)的,而另一條鏈的合成則是不連續(xù)的。不連續(xù)鏈每個片段的合成都是獨立進行的,然后各片段

18、再連接起來。4.DNA聚合酶不能從頭合成,因此必須有引物。 5. DNA 復制必須高度精確 , DNA 復制錯誤率大約是 1/1010,校正機制保證新合成的 DNA 的正確性。 6.DNA 的合成必須非常迅速 ,其合成速度與基因組的大小及細胞分裂速度有關(guān)。 7復制器本身不能復制線性 DNA 的末端,一種特殊的端粒酶參與端粒的復制。 19. DNA復制過程涉及的酶有幾類,什么是大腸桿菌DNA聚合酶I和Klenow片段 1.依賴于DNA的DNA聚合酶 1)以脫氧核苷酸三磷酸(dNTPs)為前體催化合成DNA 2)需要模板和引物的存在; 3)不能起始合成新的DNA鏈; 4)

19、催化dNTPs加到生長中的DNA鏈的3'-OH末端; 5)催化DNA合成的方向是5'→3'。 2. 解鏈、解旋酶類 A.解螺旋酶(helicase)利用ATP 供能,作用于氫鍵,使DNA雙鏈解開成為兩條單鏈。 B.單鏈DNA結(jié)合蛋白 C.DNA拓撲異構(gòu)酶 3.引物酶 在模板的復制起始部位催化NTP的聚合, 形成短片段的RNA。這一小段RNA作為復制的引物,提供3′-OH末端,使DNA-pol能夠催化dNTP聚合。 大腸桿菌DNA聚合酶I:對復制中的錯誤進行校讀,對復制和修復中出現(xiàn)的空隙進行填補。 Klenow: E.coli DNA聚合酶Ⅰ經(jīng)胰蛋白酶或枯草桿菌蛋白酶部分水解生

20、成的C末端605個氨基酸殘基片段。該片段保留了DNA聚合酶I的5ˊ-3ˊ聚合酶和3ˊ-5ˊ外切酶活性,但缺少完整酶的5ˊ-3ˊ外切酶活性。 20. 原核生物DNA復制的過程 (一)復制起始(153)1、拓撲異構(gòu)酶解開超螺旋。2、DnaA蛋白識別并在ATP存在下結(jié)合于四個9bp的重復序列。3、在類組蛋白HU、ATP參與下, DnaA蛋白變性13個bp的重復序列,形成開鏈復合物。4 、DnaB借助于水解ATP產(chǎn)生的能量在DnaC的幫助下沿5’→3’方向移動,解開DNA雙鏈,形成前引發(fā)復合物。5、單鏈結(jié)合蛋白結(jié)合于單鏈。6、引物合成酶(DnaG蛋白)開始合成RNA引物。 (二)復制的延長:DN

21、A聚合酶催化游離的脫氧核苷酸結(jié)合到新鏈3’末端,使其不斷延長。 (三)復制的終止:多為環(huán)狀DNA分子,雙向復制的復制片段在復制的終止點處匯合。 21. 什么是突變,突變的種類 突變是DNA分子上堿基的改變。 1、點突變——指DNA分子上一個堿基的變異。 (1)轉(zhuǎn)換:發(fā)生在同型堿基之間,即嘌呤代替另一嘌呤,或嘧啶代替另一嘧啶。 (2)顛換:發(fā)生在異型堿基之間,即嘌呤變嘧啶或嘧啶變嘌呤。 2、缺失、插入。缺失:一個堿基或一段核苷酸鏈從DNA大分子上消失。插入:原來沒有的一個堿基或一段核苷酸鏈插入到DNA大分子中間。 3、重排——DNA分子內(nèi)發(fā)生較大片斷的交換,也稱為重組。4、雙

22、鏈斷裂 22. 四種DNA損傷修復的方式 (一)回復修復(光修復) 紫外光照射可使相鄰的兩個T 形成二聚體 光修復酶可使二聚體解聚為單體狀態(tài),DNA完全恢復正常。光修復酶的激活需300-600μm波長的光。 (二)切除修復是細胞內(nèi)最重要的修復機制,主要由DNA聚合酶Ⅰ和連接酶完成。 (三)重組修復(鏈轉(zhuǎn)移修復) 復制后修復,容易出錯 重組修復后的損傷位點可由其它機制進一步修復 (四)SOS修復 當DNA損傷廣泛難以繼續(xù)復制時,由此而誘發(fā)出一系列復雜的反應。 各種與修復有關(guān)的基因,組成一個稱為調(diào)節(jié)子的網(wǎng)絡式調(diào)控系統(tǒng)。 這種修復特異性低,對堿基的識別、選擇能力差。即使修復后

23、復制能繼續(xù),DNA保留的錯誤較多, 會引起較廣泛、長期的突變。 23. 什么是PCR,其原理與影響因素,體內(nèi)DNA復制與體外PCR反應有何不同 PCR技術(shù)是一種體外模擬自然DNA復制過程的核酸擴增技術(shù),亦稱為無細胞分子克隆技術(shù)。以待擴增的兩條DNA鏈為模板,在一對人工合成的寡核苷酸引物的介導下,通過耐高溫DNA聚合酶的酶促作用,快速特異地擴增出特定的DNA片斷。簡單的講,PCR技術(shù)即通過引物延伸核酸的某個區(qū)域而進行的重復雙向DNA合成。 工作原理:類似于DNA的天然復制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR由變性--退火(復性)--延伸三個基本反應步驟構(gòu)成:①模板

24、DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至90~95℃一定時 間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應作準備;②模板DNA與引物的退火(復性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55~60℃,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合;③引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在DNA聚合酶的作用下,于70~75℃,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按堿基配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復制鏈重復循環(huán)變性--退火--延伸三過程,就可獲得更多的“半保留復制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2~4分

25、鐘,2~3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。 影響因素:在PCR自動熱循環(huán)中,最關(guān)鍵的因素是變性與退火的溫度。 PCR技術(shù) DNA生物復制 環(huán)境 體外復制,加熱,90攝氏度左右 體內(nèi),溫和的環(huán)境 模板 DNA單鏈 DNA單鏈 原料 4種脫氧核糖核苷酸 4種脫氧核糖核苷酸 酶 主要是DNA聚合酶 DNA解旋酶,DNA聚合酶, DNA連接酶等各種酶 引物 需要人工合成的引物 自己合成引物成分 步驟 變性--退火--延伸 解旋-起始-延伸-結(jié)束 原則 堿基互補配對原則 堿基互補配對原則 24.什么是啟動子,簡述原核生物和真核生物啟動子的組

26、成。 啟動子:指能被RNA聚合酶識別、結(jié)合并啟動基因轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。 原核生物啟動子結(jié)構(gòu): -10區(qū)(TATA區(qū)):6bp的保守序列TATAAT,稱Pribnow框。此段序列出現(xiàn)在-4到-13bp之間。 頻度: T89 A89 T50 A65 A65 T100 -35序列(TTGACA區(qū)):RNA聚合酶全酶的識別區(qū)域(TTGACA) 各堿基出現(xiàn)頻率:T85 T83 G81 A61 C69 A52 真核生物啟動子: ①核心啟動子 保證RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄正常起始所必需的、最少的DNA序列,包括轉(zhuǎn)錄起始位點及轉(zhuǎn)錄起始位點上游TATA區(qū) 作用:選擇正確的轉(zhuǎn)錄起始位點,保

27、證精確起始 TATA 區(qū):-30~-25bp左右,保守序列T85A97T93A85A63A83A50 ②上游啟動子元件 CAAT盒(CCAAT): -70 - -80bp GC盒(GGGCGG):-80 - -110bp 作用:控制轉(zhuǎn)錄起始頻率。 25.什么是增強子,增強子有何生物學功能? 增強子:遠離轉(zhuǎn)錄起始點、決定基因的時間、空間特異性表達、增強啟動子轉(zhuǎn)錄活性的DNA序列. 其發(fā)揮作用的方式通常與方向、距離無關(guān),可位于轉(zhuǎn)錄起始點的上游或下游。沒有啟動子時,增強子無法發(fā)揮作用。 26. 簡述原核生物的RNA聚合酶的組成及生物學功能 原核生物的RNA聚合酶:大腸

28、桿菌的RNA聚合酶全酶由5種亞基α2ββ’ωσ組成,σ因子與其它部分的結(jié)合不是十分緊密,它易于與β’βα2分離,沒有σ亞基的酶稱為核心酶——只催化鏈的延長,對起始無作用。σ稱為起始因子。 亞基 基因 相對分子量 亞基數(shù) 組分 功能 α rpoA 36500 2 核心酶 核心酶組裝,啟動子識別 β rpoB 151000 1 核心酶 β和β'共同形成RNA合成的活性中心 β' rpoC 155000 1 核心酶 ω ? 11000 1 核心酶 ? σ rpoD 70000 1 σ因子 存在多種σ因子,用于識別不同的啟動子

29、 27. 原核生物基因轉(zhuǎn)錄終止子有何特征,通過哪些機制終止轉(zhuǎn)錄 RNA鏈延伸到終止位點, RNA合成停止,轉(zhuǎn)錄泡消失, RNA鏈釋放出來,轉(zhuǎn)錄終止,提供停止轉(zhuǎn)錄信號的DNA序列稱為終止子 強終止子:內(nèi)部終止子 弱終止子:需要ρ因子又稱為ρ依賴性終止子 不依賴ρ因子的終止 終止位點上游一般存在一個富含GC堿基的二重對稱區(qū),RNA形成發(fā)夾結(jié)構(gòu); 在終止位點前面有一段由4-8個A組成的序列,RNA的3’端為寡聚U 依賴ρ因子的終止ρ因子:六聚體蛋白、水解各種核甘三磷酸促使新生RNA鏈從三元轉(zhuǎn)錄復合物中解離出來,從而終止轉(zhuǎn)錄。 28. 簡述原核生物基因轉(zhuǎn)錄過程 1、起始位點的

30、識別:RNA聚合酶在σ亞基的引導下結(jié)合于啟動子上 2、轉(zhuǎn)錄起始:RNA聚合酶結(jié)合到啟動子上,DNA雙鏈局部解開,找到起始點,在模板鏈上通過堿基配對結(jié)合第一個核苷酸,合成RNA鏈;RNA的合成開始,σ亞基會被釋放脫離核心酶 3、RNA鏈的延伸:σ亞基脫落,RNA聚合酶核心酶變構(gòu),與模板結(jié)合松弛,沿著DNA模板前移; 在核心酶作用下,NTP不斷聚合,RNA鏈不斷延長。 當酶從起始位點往下游移動時,解旋隨酶一起進行,而轉(zhuǎn)錄完成部分DNA重新形成完整的雙螺旋。 4、轉(zhuǎn)錄終止:RNA鏈延伸到終止位點, RNA合成停止,轉(zhuǎn)錄泡消失, RNA鏈釋放出來,轉(zhuǎn)錄終止,提供停止轉(zhuǎn)錄信號的DNA序列稱為終

31、止子。 29. 原核生物和真核生物基因轉(zhuǎn)錄過程有哪些差異 真核生物與原核生物基因的轉(zhuǎn)錄過程基本上是相同的,但仍有一些區(qū)別,主要有以下幾點:1.原核生物的轉(zhuǎn)錄和翻譯幾乎同時進行,而真核生物的轉(zhuǎn)錄在胞核,翻譯在胞漿。2.原核生物中只有一種RNA聚合酶催化RNA的合成,而在真核生物中則有RNA聚合酶Ⅰ、RNA聚合酶Ⅱ和RNA聚合酶Ⅲ三種不同酶,分別催化不同種類型RNA的合成。三種RNA聚合酶都是由10個以上亞基組成的復合酶。RNA聚合酶Ⅰ存在于細胞核仁內(nèi),催化合成除5SrRNA以外的所有rRNA的合成;RNA聚合酶Ⅱ和RNA聚合酶Ⅲ均存在于細胞核質(zhì)內(nèi),RNA聚合酶Ⅱ催化合成mRNA前體,即不均一

32、核RNA(hnRNA)的合成,而RNA聚合酶Ⅲ催化tRNA和小核RNA的合成。3.真核和原核生物的在起始點識別和轉(zhuǎn)錄終止的方式也有所不同。 30. 真核生物基因5’端帽子、3’端尾巴結(jié)構(gòu) 在5’端加帽 真核生物mRNA5’端都經(jīng)過修飾加帽 mRNA前端序列轉(zhuǎn)錄合成后,在其5’ 端加上一個7-甲基鳥核苷三磷酸(m7Gppp),mRNA5’端的這種結(jié)構(gòu)稱為帽子(cap)。 帽子結(jié)構(gòu)功能: ①能被核糖體小亞基識別,促使mRNA和核糖體的結(jié)合; ②m7Gppp結(jié)構(gòu)能有效地封閉mRNA 5’末端,以保護mRNA免受5’核酸外切酶的降解,增強mRNA的穩(wěn)定。 3’端加尾 絕大數(shù)真核

33、生物mRNA轉(zhuǎn)錄完成后在3’加多聚腺苷酸尾巴poly(A) 加尾信號: 真核基因mRNA轉(zhuǎn)錄終止位點上游15~30bp處保守序列:AAUAAA poly(A)尾巴功能: 提高了mRNA在細胞質(zhì)中的穩(wěn)定性。 31. 內(nèi)含子(intron) 、外顯子(exon) 大數(shù)真核生物基因為斷裂基因(interrupted gene),真核基因表達需要RNA的剪接過程(splicing),從mRNA前體分子中切除被稱為內(nèi)含子(intron) 的非編碼區(qū),并使基因中被稱為外顯子(exon)的編碼區(qū)拼接形成成熟的mRNA。 內(nèi)含子:真核生物細胞DNA中的間插序列。這些序列被轉(zhuǎn)錄在前體RNA中,經(jīng)過剪接

34、被去除,最終不存在于成熟RNA分子中。內(nèi)含子和外顯子的交替排列構(gòu)成了割裂基因。在前體RNA中的內(nèi)含子常被稱作“間插序列”。 外顯子:基因組DNA中出現(xiàn)在成熟RNA分子上的序列。外顯子被內(nèi)含子隔開,轉(zhuǎn)錄后經(jīng)過加工被連接在一起,生成成熟的RNA分子。信使核糖核酸(mRNA)所攜帶的信息參與指定蛋白質(zhì)產(chǎn)物的氨基酸排列。 32.真核mRNA的加工一般要經(jīng)過哪些過程? ①5’端加帽 ②3’端加尾 ③RNA的剪接 mRNA的剪接機制 mRNA前體中內(nèi)含子的兩端邊界存在共同的序列,這些序列結(jié)構(gòu)可能是mRNA前體剪接的信號。兩端邊界的保守序列,稱為邊界順序。其規(guī)律稱為GT-AG法則或Ch

35、ambon法則。高等真核生物中,內(nèi)含子通常是固定地從mRNA前體中被剪接,然而,在個體發(fā)育或細胞分化時可以有選擇性地進行變位剪接,產(chǎn)生出組織或發(fā)育階段特異性mRNA,稱為內(nèi)含子的可變剪接。 ④RNA的編輯 :編輯是指轉(zhuǎn)錄后的RNA在編碼區(qū)發(fā)生堿基的突變、加入或丟失等現(xiàn)象,導致DNA所編碼的遺傳信息發(fā)生改變。 作用機制: 1、位點特異性脫氨基作用 2、尿苷酸的缺失和添加 33. 原核生物和真核生物mRNA結(jié)構(gòu)差異? 1、原核生物mRNA的特征 ①半衰期短 ②多以多順反子的形式存在 多順反子mRNA:編碼多個蛋白質(zhì)的mRNA。 單順反子mRNA:只編碼一個蛋白質(zhì)的m

36、RNA。 ③5’ 端無“帽子”結(jié)構(gòu), 3’ 端沒有或只有較短的poly(A )結(jié)構(gòu)。 SD序列:mRNA中用于結(jié)合原核生物核糖體的序列。 2、真核生物mRNA的特征 ① 5’ 端存在“帽子”結(jié)構(gòu) ②多數(shù)mRNA 3’ 端具有poly(A )尾巴(組蛋白除外) ③以單順反子的形式存在“基因”的分子生物學定義:產(chǎn)生一條多肽鏈或功能RNA所必需的全部核甘酸序列。 34.什么是逆轉(zhuǎn)錄,與正常基因轉(zhuǎn)錄有何差別? 逆轉(zhuǎn)錄:以RNA為模板,依靠逆轉(zhuǎn)錄酶的作用,以四種脫氧核苷三磷酸(dNTP)為底物,產(chǎn)生DNA鏈。常見于逆轉(zhuǎn)錄病毒的復制中。 區(qū)別:無RNA聚合酶的參與,方向為RNA→D

37、NA,轉(zhuǎn)錄是以DNA為模板,而逆轉(zhuǎn)錄是以RNA為模板。 35. 生物遺傳的三聯(lián)體密碼有哪些特性? 連續(xù)性:編碼蛋白質(zhì)氨基酸序列的各個三聯(lián)體密碼連續(xù)閱讀,密碼間無間斷也無交叉。 簡并性:由一種以上密碼子編碼同一個氨基酸現(xiàn)象稱為簡并,對應于同一氨基酸的密碼子稱為同義密碼子 特性:通用性和特殊性:1、蛋白質(zhì)合成的整套密碼,從原核生物到人類都通用 2、64種密碼子=61氨基酸密碼子+3終止密碼子 擺動性:轉(zhuǎn)運氨基酸的tRNA上的反密碼子需要通過堿基互補與mRNA上的遺傳密碼子反向配對結(jié)合,在密碼子與反密碼子的配對中,前兩對嚴格遵守堿基配對原則,第

38、三對堿基有一定的自由度,可以“擺動”,該現(xiàn)象稱密碼子的擺動性 36.簡述tRNA的結(jié)構(gòu)和功能 結(jié)構(gòu):大多數(shù)有三葉草形二級結(jié)構(gòu)(3’端有CCA-OH序列 T C環(huán) 額外環(huán) 反密碼子環(huán) 二氫尿嘧啶環(huán))和L三級結(jié)構(gòu)(1、倒L形 ,由氫鍵維持 2、氨基酸接受臂CCA序列和反密碼子處于倒L的兩端3、D環(huán)和T C環(huán)形成了倒L的角4、絕大多數(shù)三級結(jié)構(gòu)的氫鍵由二級結(jié)構(gòu)中未配對的堿基形成) 功能:1、解讀mRNA的遺傳信息2、運輸?shù)墓ぞ?,運載氨基酸 37. 簡述原核和真核生物核糖體的組成及功能 原核細胞的核糖體較小,沉降系數(shù)為70S,相對分子質(zhì)量為2.5x103 kDa,由50S和30S

39、兩個亞基組成; 而真核細胞的核糖體體積較大,沉降系數(shù)是80S,相對分子質(zhì)量為3.9~4.5x103 kDa,由60S和40S兩個亞基組成。典型的原核生物大腸桿菌核糖體是由50S大亞基和30S小亞基組成的。在完整的核糖體中,rRNA約占2/3,蛋白質(zhì)約為1/3。50S大亞基含有34多肽鏈和兩種RNA分子,相對分子質(zhì)量大的rRNA的沉降系數(shù)為23S,相對分子質(zhì)量小的rRNA為5S。30S小亞基含有21多肽鏈和一個16S的rRNA分子。 在單個核糖體上,可化分多個功能活性中心,在蛋白質(zhì)合成過程中各有專一的識別作用和功能。 38.什么是S-D序列,有何生物學功能? S-D序列 SD(Shi

40、ne-Dalgarno):原核生物mRNA分子中起始密碼子上游8-13個核苷酸處有一段富含嘌呤核苷酸的序列,它可以與30S亞基中的16SrRNA3‘端富含嘧啶的尾部互補結(jié)合,因此有助于mRNA的翻譯從起始密碼子處開始。 39.何謂分子伴侶?其生物學功能是什么? 分子伴侶:是一類結(jié)構(gòu)上互不相同的蛋白質(zhì)家族,它們在細胞內(nèi)幫助其它多肽進行正確的折疊、組裝和轉(zhuǎn)運。分子伴侶本身并不參與最終產(chǎn)物的形成。 40.簡述原核生物蛋白質(zhì)翻譯過程 翻譯起始:1、核蛋白大小亞基分離2、30S小亞基通過SD序列與mRNA模板結(jié)合3、在IF-2和GTP的幫助下,fMet-tRNAfMet進入小亞基的P位,tRNA

41、上的反密碼子與mRNA上的起始密碼子配對。4、帶有TRNA、mRNA和3個翻譯起始因子的小亞基復合物與50S大亞基結(jié)合,GTP水解,釋放翻譯起始因子 翻譯的延伸(肽鏈的延伸):肽鏈延伸由許多循環(huán)組成,每加一個氨基酸就是一個循環(huán),每個循環(huán)包括:AA-tRNA與核糖體結(jié)合、肽鏈的生成和移位 翻譯的終止:終止因子RF1:識別終止密碼子UAA 和UAG RF2:識別終止密碼子UAA 和UGA RF3:具有GTP酶活性,刺激RF1和RF2活性,協(xié)助肽鏈的釋放 41.蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)運機制有哪些類型? 翻譯-運轉(zhuǎn)同步機制:蛋白質(zhì)的合成和轉(zhuǎn)運同時發(fā)生 翻譯后運轉(zhuǎn)機制:蛋白質(zhì)從核糖體上釋放后才發(fā)生轉(zhuǎn)

42、運 蛋白性質(zhì) 運轉(zhuǎn)機制 主要類型 分泌 蛋白質(zhì)在結(jié)合核糖體上合成,并以翻譯-運轉(zhuǎn)同步機制運輸 免疫球蛋白、卵蛋白、水解酶、激素等 細胞器發(fā)育 蛋白質(zhì)在游離核糖體上合成,以翻譯后運轉(zhuǎn)機制運輸 核、葉綠體、線粒體、乙醛酸循環(huán)體、過氧化物酶體等細胞器中的蛋白質(zhì) 膜的形成 兩種機制兼有 質(zhì)膜、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、類囊體中的蛋白質(zhì) 42.何謂信號肽?其生物學功能是什么? 分泌蛋白的肽鏈N端有保守的氨基酸序列,能夠指導蛋白質(zhì)的跨膜轉(zhuǎn)移,靶向引導蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到細胞的正確部位,稱為信號肽。 信號肽序列特點:(1)一般帶有10-15個疏水氨基酸; (2)在靠近該序列

43、N-端常常有1個或數(shù)個帶正電荷的氨基酸;(3)在其C-末端靠近蛋白酶切割位點處常常帶有數(shù)個極性氨基酸,離切割位點最近的那個氨基酸往往帶有很短的側(cè)鏈。①核糖體組裝、翻譯起始; ②位于蛋白質(zhì)N-端的信號肽序列首先被翻譯; ③SRP與核糖體GTP以及帶有信號肽的新生蛋白質(zhì)相結(jié)合,暫時中止肽鏈延伸;④核糖體-SRP復合物與膜上的受體相結(jié)合; ⑤GTP水解,釋放SRP并進入新一輪循環(huán); ⑥肽鏈更新開始延伸并不斷向內(nèi)腔運輸; ⑦信號肽被切除; ⑧多肽合成結(jié)束核糖體解離并恢復到翻譯起始前的狀態(tài) 43.組成性表達和適應性表達 組成性表達:不大受環(huán)境變動而變化的一類基因表達 管家基因:某些基因在一個個

44、體的幾乎所有細胞中持續(xù)表達 適應性表達:環(huán)境的變化容易使其表達水平變動的一類基因表達(可誘導基因:應環(huán)境條件變化基因表達水平增高的現(xiàn)象稱誘導 該類基因被稱為~ 可阻遏基因:概念相反 ) 奢侈基因:只在特定的細胞類型中表達的基因 44.解釋說明:正轉(zhuǎn)錄調(diào)控、 負轉(zhuǎn)錄調(diào)控、可誘導調(diào)節(jié)、可阻遏調(diào)節(jié) 根據(jù)操縱子對調(diào)節(jié)蛋白(阻遏蛋白或激活蛋白)的應答分為正轉(zhuǎn)錄調(diào)控和負轉(zhuǎn)錄調(diào)控 【正轉(zhuǎn)錄調(diào)控】如果在沒有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)存在時基因是關(guān)閉的,加入這種調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)后基因活性就被開啟,這樣的調(diào)控叫正轉(zhuǎn)錄調(diào)控,調(diào)節(jié)蛋白稱激活蛋白 【負轉(zhuǎn)錄調(diào)控】如果在沒有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)存在時基因是表達的,加入這種調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)后基因

45、活性就被關(guān)閉,這樣的調(diào)控叫負轉(zhuǎn)錄調(diào)控,調(diào)節(jié)蛋白稱阻遏蛋白 根據(jù)操縱子對某些調(diào)節(jié)它們的小分子應答分為可誘導調(diào)節(jié)和可阻遏調(diào)節(jié)兩大類 【可誘導調(diào)節(jié)】指一些基因在特殊的代謝物和化合物的作用下,由原來的關(guān)閉狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)楣ぷ鳡顟B(tài),即在某些物質(zhì)的誘導下使基因活化。例如:大腸桿菌的乳糖操縱子分蛋白代謝的基因 【可阻遏調(diào)節(jié)】基因平時是開啟的,處在產(chǎn)生蛋白質(zhì)或酶的工作過程中,由于一些特殊代謝物或化合物的積累而將其關(guān)閉,阻遏了基因的表達 例:色氨酸操縱子合成代謝蛋白的基因 45.論述乳糖操縱子的正負調(diào)控機制。 ① Z、Y、A基因的產(chǎn)物由同一條多順反子的mRNA分子所編碼 ② 這個mRNA分子的啟動子緊接

46、著O區(qū),而位于I與O之間的啟動子區(qū)(P),不能單獨起動合成β-半乳糖苷酶和透過酶的生理過程。 ③ 操縱區(qū)是DNA上的一小段序列(僅為26bp),是阻遏物的結(jié)合位點。 ④當阻遏物與操縱區(qū)結(jié)合時,lac mRNA的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制。 ⑤誘導物通過與阻遏物結(jié)合,改變它的三維構(gòu)象,使之不能與操縱基因結(jié)合,從而激發(fā)lac mRNA的合成。當有誘導物存在時,操縱區(qū)沒有被阻遏物占據(jù),所以啟動子能夠順利起始mRNA的合成。 46.論述色氨酸操縱子的結(jié)構(gòu)及調(diào)控機制 一、色氨酸操縱子的結(jié)構(gòu) 1.合成色氨酸所需要酶類的基因E、D、C、B、A等頭尾相 接串連排列組成結(jié)構(gòu)基因群。 2. 調(diào)控基因trpR的

47、位置遠離結(jié)構(gòu)基因群,在其自身的啟動子作用下,以組成性方式低水平表達調(diào)控蛋白R 3.結(jié)構(gòu)基因trpE有前導序列(Leader sequence,L) 4. 有衰減子(attenuator)/弱化子 二、trp 操縱子的阻遏系統(tǒng) 色氨酸操縱子的阻遏系統(tǒng)是色氨酸生物合成途徑的第一水平調(diào)控,它主管轉(zhuǎn)錄的啟動與否。 阻遏蛋白R并沒有與O結(jié)合的活性。當環(huán)境能提供足夠濃度的色氨酸時,R與色氨酸結(jié)合后構(gòu)象變化而活化,就能夠與O特異性親和結(jié)合,阻遏結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄。 色氨酸含量很低時,阻遏被消除,轉(zhuǎn)錄開放合成色氨酸 色氨酸充足時,色氨酸-阻遏蛋白復合體結(jié)合操縱區(qū),完全阻斷轉(zhuǎn)錄 三、trp

48、 操縱子的弱化機制 當色氨酸濃度低時,負載色氨酸的tRNAtrp就少,翻譯通過兩個色氨酸密碼子的速度慢,當4區(qū)轉(zhuǎn)錄完成時,核糖體才進行到1區(qū),這時的前導區(qū)結(jié)構(gòu)是2-3配對,不形成3-4配對的終止結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)錄繼續(xù)進行 當色氨酸濃度高時,核糖體可以順利通過兩個色氨酸密碼子,當4區(qū)轉(zhuǎn)錄完成時,核糖體就達到2區(qū),這樣2-3不能配對,形成3-4配對的終止結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)錄停止 47.真核生物和原核生物基因組各有那些特點? 【真核生物基因組結(jié)構(gòu)特點】1、結(jié)構(gòu)龐大2、單順反子3、基因不連續(xù)4、非編碼區(qū)較多5、含大量的重復序列 【原核生物基因組結(jié)構(gòu)特點】1、基因組很小,大多只有一條染色體2、結(jié)構(gòu)簡練3、存在轉(zhuǎn)

49、錄單元多順販子4、有重疊基因 48.真核細胞與原核細胞在基因轉(zhuǎn)錄、翻譯及DNA的空間結(jié)構(gòu)方面存在以下幾個方面的差異 在真核細胞中,一條成熟的mRNA鏈只能翻譯出一條多肽鏈,很少存在原核生物中常見的多基因操縱子形式 真核細胞DNA與組蛋白和大量的非組蛋白結(jié)合,只有一小部分DNA是裸露的。 高等真核細胞DNA中很大部分是不轉(zhuǎn)錄的,大部分真核細胞的基因中間還存在不被翻譯的內(nèi)含子 真核生物能夠有序的根據(jù)生長發(fā)育階段的需要進行DNA片段重排,還能在需要時增加細胞內(nèi)某些基因的拷貝數(shù)。 在真核生物中,基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)節(jié)區(qū)相對較大,它們可能遠離啟動子達幾百個甚至上千個堿基對,這些調(diào)節(jié)區(qū)一般通過改變整個

50、所控制基因5’上游區(qū)DNA構(gòu)型來影響它與RNA聚合酶的結(jié)合能力。在原核生物中轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)區(qū)都很小,大都位于啟動子上游不遠處,調(diào)控蛋白結(jié)合到位點上可直接促進或抑制RNA聚合酶與它結(jié)合。真核生物的RNA在細胞核中合成,只有經(jīng)轉(zhuǎn)錄穿過核膜,到達細胞質(zhì)后,才能被翻譯成蛋白質(zhì),原核生物不存在這樣嚴格的空間間隔。許多真核生物的基因只有經(jīng)過復雜的成熟和剪接過程,才能順利的翻譯成蛋白質(zhì) 49.真核生物DNA水平上的基因表達調(diào)控有那些? 1、基因丟失:在細胞分化過程中,可通過丟失掉某些基因而除去這些基因的活性。某些原生生物、線蟲、昆蟲和甲殼類動物在個體發(fā)育過程中,許多體細胞常丟失掉整條或部分的染色體,只有將來分

51、化產(chǎn)生生殖細胞的那些細胞一直保留著整套染色體 2、基因擴增 :指某些基因的拷貝數(shù)專一性增大的現(xiàn)象,它使得細胞在短期內(nèi)產(chǎn)生大量的基因產(chǎn)物以滿足生長發(fā)育的需要(非洲爪蟾卵母細胞中rRNA的基因擴增是因發(fā)育需要而產(chǎn)生的基因擴增現(xiàn)象)3、基因重排:將一個基因從遠離啟動子的地方移到距它很近的位點從而啟動轉(zhuǎn)錄(包括:抗體分子的形成 Ti質(zhì)粒 轉(zhuǎn)座子) 4、DNA甲基化狀態(tài)與調(diào)控【甲基化:甲基化降低基因表達活性,去甲基化誘導基因的活化與表達】【DNA甲基化抑制基因轉(zhuǎn)錄機理:DNA甲基化能引起染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、DNA構(gòu)象、DNA穩(wěn)定性及DNA與蛋白質(zhì)相互作用方式的改變,從而控制基因表達】 5、染色體結(jié)構(gòu)與調(diào)控【活性

52、染色質(zhì):具有轉(zhuǎn)錄活性。具有疏松的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)從而便于轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子與順式調(diào)控原件的結(jié)合和RNA聚合酶在轉(zhuǎn)錄模板上滑動 特點:1、有DNasel超敏感位點2、有基因座控制區(qū)3、有核基質(zhì)結(jié)合區(qū)(MAR序列)】 50.順式作用元件和反式作用因子,簡述其典型結(jié)構(gòu)。 順式作用原件:(a)定義:影響自身基因表達活性的非編碼DNA序列.(b)例:啟動子、增強子、沉默子等 啟動子:在DNA分子中,RNA聚合酶能夠識別、結(jié)合并導致轉(zhuǎn)錄起始的序列。有核心啟動子和上游啟動子。 增強子:指能使與它連鎖的基因轉(zhuǎn)錄頻率明顯增加的DNA序列(SV40的轉(zhuǎn)錄單元上發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)錄起始位點上游約200bp處有兩段長72bp的正向

53、重復序列) 特點:1、增強效應十分明顯,一般能使基因轉(zhuǎn)錄頻率增加10——200倍;2、增強效應與其位置與取向無關(guān),不論增強子以什么方向排列(5’-3’或3‘-5’),甚至和靶基因相距3kb,或在靶基因下游均表現(xiàn)出增強效應;3、大多數(shù)為重復序列,一般長50bp,適合于某些蛋白因子結(jié)合。其內(nèi)部常含有一個核心序列:(G)TGGA/TA/TA/T(G),該序列是產(chǎn)生增強效應時所必須的;4、增強效應有嚴密的組織和細胞特異性,說明增強子只有與特定的蛋白質(zhì)(轉(zhuǎn)錄因子)相互作用才能發(fā)揮其功能;5、沒有基因?qū)R恍?,可以在不同的基因組合上表達增強效應;6、許多增強子還受外部信號調(diào)控,如金屬硫蛋白的基因啟動區(qū)上游

54、所帶的增強子,就可以對環(huán)境中的鋅、鎘濃度做出反應。 沉默子:某些基因含有負性調(diào)節(jié)元件——沉默子,當其結(jié)合基因含有負性調(diào)節(jié)元件——沉默子,當其結(jié)合特異蛋白因子時,對基因轉(zhuǎn)錄起阻遏作用。 反式作用因子:(a):定義:能直接或間接的識別或結(jié)合在各類順式原件的核心序列上,參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的蛋白質(zhì)。 TFIID(TATA) CTF(CACA) SP1(GGGCGG) HSF(熱激蛋白啟動區(qū)) 有三個結(jié)構(gòu)域: DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(1、螺旋-轉(zhuǎn)折-螺旋2、鋅指結(jié)構(gòu)3、堿性亮氨酸拉鏈4、堿性-螺旋-環(huán)-螺旋) 轉(zhuǎn)錄活化結(jié)構(gòu)域 連接區(qū) 典型結(jié)構(gòu):1、螺旋-轉(zhuǎn)折-螺旋:廣泛分布在從酵母到人類的各種真核生物中,雖彼此在氨基酸的順序上差別很大,但高級結(jié)構(gòu)高度保守,如同源域蛋白。2、鋅指結(jié)構(gòu):一種出現(xiàn)在DNA結(jié)合蛋白中的結(jié)構(gòu)基元。由一個含有大約30個氨基酸的環(huán)和一個與環(huán)上的4個Cys或2個His配位的構(gòu)成,形成結(jié)構(gòu)像手指狀.3、堿性-亮氨酸拉鏈:(a)二聚體(b) 連氨酸之間相互形成二聚體 形成“拉鏈”(c)肽鏈氨基端20——30個富含堿性氨基酸的結(jié)構(gòu)域與DNA結(jié)合 (d)這類蛋白質(zhì)的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域?qū)嶋H是以堿性區(qū)和亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)域整體作為基礎的。4、堿性-螺旋-環(huán)-螺旋 13

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