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1、
核酸化學(xué)
1. 堿基互補規(guī)律(complementary base pairing):在形成雙螺旋結(jié)構(gòu)的過程中,由于各種堿基的大小與結(jié)構(gòu)的不同,使得堿基之間的互補配對只能在G…C(或C…G)和A…T(或T…A)之間進(jìn)行,這種堿基配對的規(guī)律就稱為堿基配對規(guī)律(互補規(guī)律)。
2. 順反子(cistron):基因功能的單位;一段染色體,它是一種多肽鏈的密碼;一種結(jié)構(gòu)基因。
3. 核酸的變性、復(fù)性(denaturation、renaturation):當(dāng)呈雙螺旋結(jié)構(gòu)的DNA溶液緩慢加熱時,其中的氫鍵便斷開,雙鏈DNA便脫解為單鏈,這叫做核酸的“溶解”或變性。在適宜的溫度下,分散開的兩條DNA
2、鏈可以完全重新結(jié)合成和原來一樣的雙股螺旋。這個DNA螺旋的重組過程稱為“復(fù)性”。
4. 退火(annealing):當(dāng)將雙股鏈呈分散狀態(tài)的DNA溶液緩慢冷卻時,它們可以發(fā)生不同程度的重新結(jié)合而形成雙鏈螺旋結(jié)構(gòu),這現(xiàn)象稱為“退火”。
5. 增色效應(yīng)(hyper chromic effect):當(dāng)DNA從雙螺旋結(jié)構(gòu)變?yōu)閱捂湹臒o規(guī)則卷曲狀態(tài)時,它在260nm處的吸收便增加,這叫“增色效應(yīng)”。
6. 減色效應(yīng)(hypo chromic effect):DNA在260nm處的光密度比在DNA分子中的各個堿基在260nm處吸收的光密度的總和小得多(約少35%~40%), 這現(xiàn)象稱為“減色效應(yīng)”。
3、7. DNA的熔解溫度(Tm值):引起DNA發(fā)生“熔解”的溫度變化范圍只不過幾度,這個溫度變化范圍的中點稱為熔解溫度(Tm)。
8. 分子雜交(molecular hybridization):不同的DNA片段之間,DNA片段與RNA片段之間,如果彼此間的核苷酸排列順序互補也可以復(fù)性,形成新的雙螺旋結(jié)構(gòu)。這種按照互補堿基配對而使不完全互補的兩條多核苷酸相互結(jié)合的過程稱為分子雜交。
9. 環(huán)化核苷酸(cyclic nucleotide):單核苷酸中的磷酸基分別與戊糖的3’-OH及5’-OH形成酯鍵,這種磷酸內(nèi)酯的結(jié)構(gòu)稱為環(huán)化核苷酸。
10. 回文結(jié)構(gòu)與鏡像重復(fù) 學(xué)指P22
11.
4、Watson-Crick配對與Hoogsteen配對 學(xué)指P23
12. DNA雙螺旋與DNA超螺旋:DNA雙螺旋(DNA double helix)是一種核酸的構(gòu)象,在該構(gòu)象中,兩條反向平行的多核甘酸鏈相互纏繞形成一個右手的雙螺旋結(jié)構(gòu)。超螺旋是由于雙螺旋DNA的彎曲、正超螺旋或負(fù)超螺旋而造成的DNA分子進(jìn)一步扭曲所形成的DNA的一種三級結(jié)構(gòu)。
13. 核酶與SiRNA:核酶是具有催化功能的RNA分子 學(xué)指P23
蛋白質(zhì)化學(xué)
14. 必需氨基酸:指人體(和其它哺乳動物)自身不能合成,機體又必需,需要從飲食中獲得的氨基酸。
15. 等電點:指氨基酸的正離子濃度和負(fù)離子濃
5、度相等時的pH 值,用符號pI表示。
16. 稀有氨基酸:指存在于蛋白質(zhì)中的20 種常見氨基酸以外的其它罕見氨基酸,它們是正常氨基酸的衍生物。
17. 蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu):指蛋白質(zhì)多肽鏈中氨基酸的排列順序,以及二硫鍵的位置。
18. 蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu):指在蛋白質(zhì)分子中的局部區(qū)域內(nèi),多肽鏈沿一定方向盤繞和折疊的方式。
19. 結(jié)構(gòu)域:指蛋白質(zhì)多肽鏈在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進(jìn)一步卷曲折疊成幾個相對獨立的近似球形的組裝體。
20. 蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu):指蛋白質(zhì)在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上借助各種次級鍵卷曲折疊成特定的球狀分子結(jié)構(gòu)的構(gòu)象。
21. 蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu):指多亞基蛋白質(zhì)分子中各個具有三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈
6、以適當(dāng)方式聚合所呈現(xiàn)的三維結(jié)構(gòu)。
22. 超二級結(jié)構(gòu):指蛋白質(zhì)分子中相鄰的二級結(jié)構(gòu)單位組合在一起所形成的有規(guī)則的、在空間上能辨認(rèn)的二級結(jié)構(gòu)組合體。
23. 蛋白質(zhì)的變性作用:蛋白質(zhì)分子的天然構(gòu)象遭到破壞導(dǎo)致其生物活性喪失的現(xiàn)象。蛋白質(zhì)在受到光照、熱、有機溶劑以及一些變性劑的作用時,次級鍵遭到破壞導(dǎo)致天然構(gòu)象的破壞,但其一級結(jié)構(gòu)不發(fā)生改變。
24. 蛋白質(zhì)的復(fù)性:指在一定條件下,變性的蛋白質(zhì)分子恢復(fù)其原有的天然構(gòu)象并恢復(fù)生物活性的現(xiàn)象。
25. 電泳 學(xué)指P25
26. 酰胺平面(肽平面/肽單位) 學(xué)指P65
27. 二面角 學(xué)指P66
28. 氨基酸殘基
7、學(xué)指P65
酶
29. 米氏常數(shù)(Km 值):用Km 值表示,是酶的一個重要參數(shù)。Km值是酶反應(yīng)速度(V)達(dá)到最大反應(yīng)速度(Vmax)一半時底物的濃度(單位M 或mM)。米氏常數(shù)是酶的特征常數(shù),只與酶的性質(zhì)有關(guān),不受底物濃度和酶濃度的影響。
30. 單體酶:只有一條多肽鏈的酶稱為單體酶,它們不能解離為更小的單位。分子量為13,000??35,000。
31. 寡聚酶:有幾個或多個亞基組成的酶稱為寡聚酶。寡聚酶中的亞基可以是相同的,也可以是不同的。亞基間以非共價鍵結(jié)合,容易為酸堿,高濃度的鹽或其它的變性劑分離。寡聚酶的分子量從35 000 到幾百萬。
32. 多酶體系:由幾個酶彼此
8、嵌合形成的復(fù)合體稱為多酶體系。多酶復(fù)合體有利于細(xì)胞中一系列反應(yīng)的連續(xù)進(jìn)行,以提高酶的催化效率,同時便于機體對酶的調(diào)控。多酶復(fù)合體的分子量都在幾百萬以上。
33. 激活劑:凡是能提高酶活性的物質(zhì),都稱激活劑,其中大部分是離子或簡單的有機化合物。
34. 抑制劑:能使酶的必需基團(tuán)或酶活性部位中的基團(tuán)的化學(xué)性質(zhì)改變而降低酶的催化活性甚至使酶的催化活性完全喪失的物質(zhì)。
35. 變構(gòu)酶:或稱別構(gòu)酶,是代謝過程中的關(guān)鍵酶,它的催化活性受其三維結(jié)構(gòu)中的構(gòu)象變化的調(diào)節(jié)。
36. 同工酶:是指有機體內(nèi)能夠催化同一種化學(xué)反應(yīng),但其酶蛋白本身的分子結(jié)構(gòu)組成卻有所不同的一組酶。
37. 活性中心:酶分子中直
9、接與底物結(jié)合,并催化底物發(fā)生化學(xué)反應(yīng)的部位,稱為酶的活性中心。
38. 必須基團(tuán):酶蛋白上與酶活性密切相關(guān)的基團(tuán),經(jīng)過化學(xué)修飾(烷化,?;龋┦姑甘Щ睿植加诨钚灾行?,但非活性中心。它直接參與對底物分子結(jié)合和催化的基團(tuán)以及參與維持酶分子構(gòu)象的基團(tuán)。
39. 酶的最適溫度 學(xué)指P92
40. 輔酶和輔基 學(xué)指P92
糖類代謝
41. 糖異生:非糖物質(zhì)(如丙酮酸或草酰乙酸等)轉(zhuǎn)變?yōu)槠咸烟堑倪^程。
42. 糖酵解途徑:糖酵解途徑指糖原或葡萄糖分子分解至生成丙酮酸的階段,是體內(nèi)糖代謝最主要途徑。
43. 磷酸戊糖途徑:磷酸戊糖途徑指機體某些組織(如肝、脂肪組織
10、等)以6-磷酸葡萄糖為起始物在6-磷酸葡萄糖脫氫酶催化下形成6-磷酸葡萄糖酸進(jìn)而代謝生成磷酸戊糖為中間代謝物的過程,又稱為磷酸已糖旁路。
44. UDPG
45. 單糖 學(xué)指P136
46. 寡糖 學(xué)指P136
47. 多糖 學(xué)指P136
48. 回補反應(yīng) 學(xué)指P136
生物氧化和能量轉(zhuǎn)換
49. 生物氧化: 生物體內(nèi)有機物質(zhì)氧化而產(chǎn)生大量能量的過程稱為生物氧化。生物氧化在細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行,氧化過程消耗氧放出二氧化碳和水,所以有時也稱之為“細(xì)胞呼吸”或“細(xì)胞氧化”。生物氧化包括:有機碳氧化變成CO2;底物氧化脫氫、氫及電子通過呼吸鏈傳遞、分子氧與傳遞的氫結(jié)成
11、水;在有機物被氧化成CO2 和H2O的同時,釋放的能量使ADP 轉(zhuǎn)變成ATP。
50. 呼吸鏈:有機物在生物體內(nèi)氧化過程中所脫下的氫原子,經(jīng)過一系列有嚴(yán)格排列順序的傳遞體組成的傳遞體系進(jìn)行傳遞,最終與氧結(jié)合生成水,這樣的電子或氫原子的傳遞體系稱為呼吸鏈或電子傳遞鏈。電子在逐步的傳遞過程中釋放出能量被用于合成ATP,以作為生物體的能量來源。
51. 氧化磷酸化:在底物脫氫被氧化時,電子或氫原子在呼吸鏈上的傳遞過程中伴隨ADP 磷酸化生成ATP 的作用,稱為氧化磷酸化。氧化磷酸化是生物體內(nèi)的糖、脂肪、蛋白質(zhì)氧化分解合成ATP 的主要方式。
52. 磷氧比:電子經(jīng)過呼吸鏈的傳遞作用最終與氧結(jié)合
12、生成水,在此過程中所釋放的能量用于ADP 磷酸化生成ATP。經(jīng)此過程消耗一個原子的氧所要消耗的無機磷酸的分子數(shù)(也是生成ATP 的分子數(shù))稱為磷氧比值(P/O)。如NADH 的磷氧比值是3,F(xiàn)ADH2 的磷氧比值是2。
53. 底物水平磷酸化:在底物被氧化的過程中,底物分子內(nèi)部能量重新分布產(chǎn)生高能磷酸鍵(或高能硫酯鍵),由此高能鍵提供能量使ADP(或GDP)磷酸化生成ATP(或GTP)的過程稱為底物水平磷酸化。此過程與呼吸鏈的作用無關(guān),以底物水平磷酸
54. 化方式只產(chǎn)生少量ATP。如在糖酵解(EMP)的過程中,3-磷酸甘油醛脫氫后產(chǎn)生的1,3-二磷酸甘油酸,在磷酸甘油激酶催化下形成ATP
13、 的反應(yīng),以及在2-磷酸甘油酸脫水后產(chǎn)生的磷酸烯醇式丙酮酸,在丙酮酸激酶催化形成ATP 的反應(yīng)均屬底物水平的磷酸化反應(yīng)。另外,
55. 在三羧酸環(huán)(TCA)中,也有一步反應(yīng)屬底物水平磷酸化反應(yīng),如α-酮戊二酸經(jīng)氧化脫羧后生成高能化合物琥珀酰~CoA,其高能硫酯鍵在琥珀酰CoA 合成酶的催化下轉(zhuǎn)移給GDP 生成GTP。然后在核苷二磷酸激酶作用下,GTP 又將末端的高能磷酸根轉(zhuǎn)給ADP 生成ATP。
56. 能荷:能荷是細(xì)胞中高能磷酸狀態(tài)的一種數(shù)量上的衡量,能荷大小可以說明生物體
57. 中ATP-ADP-AMP 系統(tǒng)的能量狀態(tài)。
58. 能荷=[ATP]+12 [ADP][ATP]+[A
14、DP]+[AMP]
59. 解偶聯(lián)劑 學(xué)指P149
脂類物質(zhì)的合成與分解
60. 必需脂肪酸:為人體生長所必需但有不能自身合成,必須從事物中攝取的脂肪酸。在脂肪中有三種脂肪酸是人體所必需的,即亞油酸,亞麻酸,花生四烯酸。
61. α-氧化:α-氧化作用是以具有3-18碳原子的游離脂肪酸作為底物,有分子氧間接參與,經(jīng)脂肪酸過氧化物酶催化作用,由α碳原子開始氧化,氧化產(chǎn)物是D-α-羥脂肪酸或少一個碳原子的脂肪酸。
62. β-氧化:脂肪酸的β-氧化作用是脂肪酸在一系列酶的作用下,在α碳原子和β碳原子之間斷裂,β碳原子氧化成羧基生成含2個碳原子的乙酰CoA 和比原來少2 個碳
15、原子的脂肪酸。
63. ω-氧化:ω-氧化是C5、C6、C10、C12脂肪酸在遠(yuǎn)離羧基的烷基末端碳原子被氧化成羥基,再進(jìn)一步氧化而成為羧基,生成α,ω-二羧酸的過程。
64. ACP(?;d體蛋白) 學(xué)指P165
65. 檸檬酸穿梭:就是線粒體內(nèi)的乙酰CoA 與草酰乙酸縮合成檸檬酸,然后經(jīng)內(nèi)膜上的三羧酸載體運至胞液中,在檸檬酸裂解酶催化下,需消耗ATP 將檸檬酸裂解回草酰乙酸和,后者就可用于脂肪酸合成,而草酰乙酸經(jīng)還原后再氧化脫羧成丙酮酸,丙酮酸經(jīng)內(nèi)膜載體運回線粒體,在丙酮酸羧化酶作用下重新生成草酰乙酸,這樣就可又一次參與轉(zhuǎn)運乙酰CoA 的循環(huán)。
66. NADPH:它是細(xì)胞中易
16、利用的還原力,它不被呼吸鏈氧化產(chǎn)生ATP,而是在還原性的生物合成中作氫和電子的供體。它是還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸。
67. 肉堿穿梭 學(xué)指P165
68. 脂肪酸合酶復(fù)合體:脂肪酸合酶系統(tǒng):脂肪酸合酶系統(tǒng)包括酰基載體蛋白(ACP)和6 種酶,它們分別是:乙酰轉(zhuǎn)酰酶;丙二酸單酰轉(zhuǎn)酰酶;β-酮脂酰ACP 合成酶;β-酮脂酰ACP 還原酶;β-羥;脂酰ACP 脫水酶;烯脂酰ACP 還原酶。
69. 多不飽和脂肪酸:含有兩個或兩個以上雙鍵的脂肪酸。
70. 乙酰CoA 羧化酶系:大腸桿菌乙酰CoA 羧化酶含生物素羧化酶、生物素羧基載體蛋白(BCCP)和轉(zhuǎn)羧基酶三種組份,它們共同作用
17、催化乙酰CoA 的羧化反應(yīng),生成丙二酸單酰-CoA。
71. 乙醛酸循環(huán):一種被修改的檸檬酸循環(huán),在其異檸檬酸和蘋果酸之間反應(yīng)順序有改變,以及乙酸是用作能量和中間物的一個來源。某些植物和微生物體內(nèi)有此循環(huán),他需要二分子乙酰輔酶A的參與;并導(dǎo)致一分子琥珀酸的合成。
72. HMG-CoA:HMG-CoA還原酶:肝細(xì)胞合成膽固醇過程中的限速酶,催化生成甲羥戊酸,抑制HMG-CoA還原酶能阻礙膽固醇合成。
核酸的生物合成
73. 復(fù)制:由一個親代DNA或一個親代RNA合成一個新的子代分子的過程,用親代分子作為合成的模板。
74. 半保留復(fù)制:雙鏈DNA 的復(fù)制方式,其中親代鏈分離,每一
18、子代DNA 分子由一條親代鏈和一條新合成的鏈組成。
75. 半不連續(xù)復(fù)制: 學(xué)指P210
76. 轉(zhuǎn)錄: 學(xué)指P211
77. 逆轉(zhuǎn)錄:以RNA為模板合成DNA的過程稱為逆轉(zhuǎn)錄。
78. 岡崎片段:在合成隨后鏈時合成許多小的DNA片段,這些小的DNA片段由岡崎發(fā)現(xiàn),故稱為岡崎片段。
79. 前導(dǎo)鏈 學(xué)指P210
80. 隨后鏈 學(xué)指P210
81. 啟動子 學(xué)指P211
82. 終止子 學(xué)指P211
83. 內(nèi)含子:真核生物的mRNA 前體中,除了貯存遺傳序列外,還存在非編碼序列,稱為內(nèi)含子。
84. 外顯子:真核生物的mRNA 前體中,
19、編碼序列稱為外顯子。
85. 中心法則:指遺傳信息從DNA傳遞給RNA,再從RNA傳遞給蛋白質(zhì),即完成遺傳信息的轉(zhuǎn)錄和翻譯的過程。也可以從DNA傳遞給DNA,即完成DNA的復(fù)制過程。
86. 翻譯:
87. 引物酶:
88. 反義鏈:
89. cDNA:
90. RNA剪接:將內(nèi)含子剪掉,將外顯子連接起來的分子過程。
91. hnRNA 學(xué)指P211
92. 轉(zhuǎn)錄鼓泡
蛋白質(zhì)的生物合成
93. 密碼子(codon):存在于信使RNA 中的三個相鄰的核苷酸順序,是蛋白質(zhì)合成中某一特定氨基酸的密碼單位。密碼子確定哪一種氨基酸叁入蛋白質(zhì)多肽鏈的特定位置上;共有64 個密碼子,其中61 個是氨基酸的密碼,3 個是作為終止密碼子。
94. 同義密碼子(synonym codon):為同一種氨基酸編碼的幾個密碼子之一,例如密碼子UUU 和UUC 二者都為苯丙氨酸編碼。
95. 反密碼子(anticodon):在轉(zhuǎn)移RNA 反密碼子環(huán)中的三個核苷酸的序列,在蛋白質(zhì)合成中通過互補的堿基配對,這部分結(jié)合到信使RNA 的特殊密碼上。
96. 多核糖體(polysome):在信使核糖核酸鏈上附著兩個或更多的核糖體。