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1、SigmaPlot 10.0, ImagePro- Plus 6.0,等軟件的使用 鄧志欽 2020/11/29 1 主要內(nèi)容 1 運用 SigmaPlot 10.0 做全程圖 2 運用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬時圖 3 運用 SigmaPlot 10.0做 I-V 曲線 4 運用 SigmaPlot 10.0做斷點柱狀圖 5 運用 ImagePro-Plus 6.0快速測量細胞面積 6 運用 ImagePro-Plus 6.0截圖 7運用 ImagePro-Plus 6.0分析灰度值 8 ImagePro-Plus 6.0定標 2020/
2、11/29 2 1 運用 SigmaPlot 10.0 做全程圖 1 運用 SigmaPlot 10.0 做全程圖 2020/11/29 3 1 運用 SigmaPlot 10.0 做全程圖 1 點擊“ File” “ Import” “File”, 找到你 對應的文件,打開格式為“ *.TXT”的文件。 或者 快捷鍵“ Ctrl + L” 2020/11/29 4 1 運用 SigmaPlot 10.0 做全程圖 2 點擊 “ Import” 打開格式為“ *.TXT”的文件。 2020/11/29 5 1 運用 SigmaPlot 10.0 做全程圖 3 點擊 “
3、 Import” 。 2020/11/29 6 事件 時間 (s) 電流( nA) 4 把事件一欄 刪除,保留時 間和電流。 2020/11/29 7 1 運用 SigmaPlot 10.0 做全程圖 5“時間”欄,從 0開始;點擊散點圖,開始作圖。 2020/11/29 8 1 運用 SigmaPlot 10.0 做全程圖 5 選擇“ XY pair”, X 軸是時間, Y軸是電流。 2020/11/29 9 1 運用 SigmaPlot 10.0 做全程圖 2020/11/29 10 1 運用 SigmaPlot 10.0 做全程圖 6 雙擊,對圖形進行編輯?!?/p>
4、 Lines Thickness”調(diào)整線條厚度, “ Scaling Range”調(diào)整坐標刻度范圍; “ Ticks Tick intervals Major Tick ”調(diào)整坐標刻度間隔。 保存文件,可以作為模板。 坐標軸標題 22 號, Times New Roman, 字符和單位之 間要空一格, 畫出橫線,說明加藥時 間,橫線厚度同樣 0.5 按需調(diào)整坐標 刻度范圍,字 體 20號。坐標 軸厚度, 0.5。 2020/11/29 11 2 運用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬時圖 2 運用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬時圖
5、2020/11/29 12 2 運用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬時圖 1 以制作加藥穩(wěn)定后的瞬時圖為例。 單擊,選中加藥穩(wěn)定后一點。 2020/11/29 13 2 運用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬時圖 2 返回“ data”窗口,圖中綠色標記的就是這時間中 0, 40, 80mV所對應電流。以這 5個電流為基礎作瞬時圖。 3 從圖中可以看到,這 5個電流所對應的事件是: 457-461。這時候 打開 2020/11/29 14 2 運用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬時圖 4雙擊,打開 s
6、ignal2文件夾里的“ Cfsview”應用程序。 2020/11/29 15 2 運用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬時圖 5點擊“ FileOpen ” ,選擇這個細胞所對應的 “*.DAT”文件。 2020/11/29 16 2 運用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬時圖 6 直接輸出生成瞬時圖文件。 點擊“ FileExport As” ,更改文件 類型 *.TXT 和文件名,點擊保存 。 2020/11/29 17 2 運用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬時圖 7 點擊“ OK” 2020/1
7、1/29 18 2 運用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬時圖 8 更改“ Frames”內(nèi)容為剛才選中的這一時間段所對應的事件即: “ 457..461” (中間兩個點需在英文狀態(tài)下輸入),點擊“ Export” 2020/11/29 19 2 運用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬時圖 9 打開“ SigmaPlot 10.0”,打開剛才用 signal2保存的文件。 2020/11/29 20 2 運用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬時圖 10 點擊線條圖 (第一欄第一個 ),選擇 “XYpair”, 點
8、擊“下一步”, “s”為 X軸, “chan 0”為 Y軸,點擊“下一步”。 2020/11/29 21 2 運用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬時圖 11 雙擊縱坐標軸,“ Scaling” “ Scale type”,選擇 “ Linear” 更改類 型。點擊橫坐標,同樣更改類型。 2020/11/29 22 2 運用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬時圖 12 雙擊,對圖形進行編輯。 “ Tick Label Factor out 1e-3”調(diào) 整橫坐標, 保存文件,可以作為模板。 坐標軸標題 22 號,字符和單 位之間要空
9、一 格 . 說明處理因素 按需調(diào)整坐標 刻度范圍,字 體 20號。坐標 軸厚度, 0.5。 Tick LabelFactor out 1e -3”調(diào)整橫 坐標 2020/11/29 23 3 運用 SigmaPlot 10.0做 I-V 曲線 3 運用 SigmaPlot 10.0做 I-V 曲線 2020/11/29 24 1 返回“ data”窗口,圖中綠色標記的就是這時間中 0, 40, 80mV所對應 電流。復制電流到 Excel表格中,按順序或倒序排序,用 電流 /電阻( pA/pF ) 得到這一個細胞的 電流密度 。同理,獲得 5個以上 的數(shù)據(jù),作為統(tǒng)計,得到
10、 mean std.err。 3 運用 SigmaPlot 10.0做 I-V 曲線 2020/11/29 25 2用 電流 /電阻( pA/pF ) 得到這一個細胞的 電流密度 。同理,獲得 5個以上 的 數(shù)據(jù),作為統(tǒng)計,得到 mean std.err。 3 運用 SigmaPlot 10.0做 I-V 曲線 2020/11/29 26 3 運用 SigmaPlot 10.0做 I-V 曲線 3 按下列格式排好,制作點線圖。 X 軸 Y1軸 Y2 軸 2020/11/29 27 3 運用 SigmaPlot 10.0做 I-V 曲線 4 單擊,點“下一步”,“ da
11、ta format”選擇 “ X many Y” 完成。 2020/11/29 28 3 運用 SigmaPlot 10.0做 I-V 曲線 5 按需對圖形進行編輯。 2020/11/29 29 4 運用 SigmaPlot 10.0做斷點柱狀圖 2020/11/29 30 4 運用 SigmaPlot 10.0做斷點柱狀圖 1 組間差異很大,需要對柱狀圖做出調(diào)整。 2020/11/29 31 4 運用 SigmaPlot 10.0做斷點柱狀圖 2 雙擊坐標軸,點擊“ Breaks” “ Show breaks” 更改合適的斷點位置,點擊 “確定”。再對圖形做出合適的
12、編輯,如柱子顏色,組間距離,線條粗細,字體字號 等。 2020/11/29 32 4 運用 SigmaPlot 10.0做斷點柱狀圖 Time (s) ctrl 24h 48h 72h C lC -3 m R N A 0 20000 30000 40000 2020/11/29 33 5 運用 ImagePro-Plus 6.0快速測量細胞面積 2020/11/29 34 5 運用 ImagePro-Plus 6.0快速測量細胞面積 1 打開目標圖像。點擊“ Edit” “ Show breaks” “Duplicate/Crop to AOI” 2020/11/29 35
13、5 運用 ImagePro-Plus 6.0快速測量細胞面積 2 點中新創(chuàng)建的圖像,點擊“ Best fit equalization”使圖像均衡化。 2020/11/29 36 3 選擇菜單欄的“ Measure” “Count / Size”, 打開 “Count / Size”對話框。 5 運用 ImagePro-Plus 6.0快速測量細胞面積 2020/11/29 37 5 運用 ImagePro-Plus 6.0快速測量細胞面積 4 選擇 “Count / Size”對話框中的“ Select Ranges”。打開“ Segmentation”對 話框,拖動對話框中
14、“ histogram Based”框條和時間軸, 保證每個時間點時 紅色部分填充滿細胞,使細胞與背景盡量分開 。完成后選擇“ Apply Mask” “Closd”。 2020/11/29 38 5 運用 ImagePro-Plus 6.0快速測量細胞面積 5 完成后點擊一次 “Count / Size”對話框中的“ Count”。這時候看到已經(jīng)有 106個點被標記。 “Count / Size”對話框中的“ Measure” 點擊“ Select Measurements”,打開測量選項對話框。 2020/11/29 39 5 運用 ImagePro-Plus 6.0快速測量細
15、胞面積 6 選擇測量選項對話框中 : “Area”, “ Center-X (mass)” , “ Center-Y (mass)” 和“ Roundness”四個測量選項。分別對它們進行編輯范圍。 2020/11/29 40 5 運用 ImagePro-Plus 6.0快速測量細胞面積 7 編輯 “Area”, “ Center-X (mass)” , “ Center-Y (mass)”和“ Roundness”四 個測量選項范圍,同時觀察左邊紅色部分的變化,使得細胞面積都在這個范 圍內(nèi)。完成后點擊“ OK”,第二次 點擊 “Count / Size”對話框中的“ Count”,
16、這時候看到已經(jīng)只有 27個點被標記。 。 2020/11/29 41 5 運用 ImagePro-Plus 6.0快速測量細胞面積 8 第二次 點擊 “Count / Size”對話框中的“ Count”,這時候看到已經(jīng)只有 27 個點被標記 。 2020/11/29 42 5 運用 ImagePro-Plus 6.0快速測量細胞面積 9 點擊菜單欄“ Measure” “Track Objiets”, 打開對話框,點擊對話框 中“ ”圖標 ,開始測量。 2020/11/29 43 5 運用 ImagePro-Plus 6.0快速測量細胞面積 10 測量完成后,點擊圖
17、標“ ”, 對離群值進行剔除 ,然后輸出結果到 Excel,就可以算出面積和體積了。 2020/11/29 44 6 運用 ImagePro-Plus 6.0截圖 2020/11/29 45 6 運用 ImagePro-Plus 6.0截圖 1 點擊“ Edit” “AOI” 調(diào)出 AOI對話框。點擊 AOI對話框中“ Add” , 增加一個區(qū)域,命名,保存。 2020/11/29 46 6 運用 ImagePro-Plus 6.0截圖 2 打開圖像,點擊下方按鈕,選中需要截圖的區(qū)域?!?Ctrl + C” 打 開 PowerPoint文檔, “ Ctrl + V
18、” 。直接復制粘貼選中的區(qū)域。 2020/11/29 47 6 運用 ImagePro-Plus 6.0截圖 3 按時間軸,把細胞序列切換到你感興趣的時間點。雙擊 AOI對話框中剛 才所命名的文件。 “ Ctrl + C” 打開 PowerPoint文檔, “ Ctrl + V” 。 直接復制粘貼選中的區(qū)域。 2020/11/29 48 7運用 ImagePro-Plus 6.0分析灰度值 2020/11/29 49 7運用 ImagePro-Plus 6.0分析灰度值 1 打開圖像,打開 “Count / Size”對話框。 2020/11/29 50 7運用 Image
19、Pro-Plus 6.0分析灰度值 2 選擇 “Count / Size”對話框中的“ Select Ranges”。打開“ Segmentation”對 話框,拖動對話框中“ histogram Based”框條, 保證紅色部分填充滿你的條 帶,使條帶與背景盡量分開 。完成后選擇“ Apply Mask” “Closd”。 2020/11/29 51 7運用 ImagePro-Plus 6.0分析灰度值 3 完成后點擊一次 “Count / Size”對話框中的“ Count”。這時候看到已經(jīng)有 106個點被標記。 “Count / Size”對話框中的“ Measure” 點擊“
20、 Select Measurements”,打開測量選項對話框。選擇“ IOD”,點擊“ OK”。 2020/11/29 52 7運用 ImagePro-Plus 6.0分析灰度值 4 選擇 “Count / Size”對話框中的“ View Data”。打開“ Measurements Data” 對話框。點擊“ File”,輸出數(shù)據(jù)到 Excel。 2020/11/29 53 8 ImagePro-Plus 6.0定標 2020/11/29 54 8 ImagePro-Plus 6.0定標 2020/11/29 55 2020/11/29 56 IPP 使用教程網(wǎng)站: 2020/11/29 57