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《重組DNA技術》PPT課件

上傳人:san****019 文檔編號:21532318 上傳時間:2021-05-03 格式:PPT 頁數(shù):53 大?。?.30MB
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1、1 第 七 章重 組 DNA技 術(Recombination DNA Technology) 2 第 一 節(jié) 基 本 概 念 3 重 組 DNA技 術 : 是 指 在 基 因 水 平 上 , 將 目的 DNA在 體 外 重 組 于 能 自 我 復 制的 載 體 DNA分 子 上 , 然 后 將 重 組DNA導 入 宿 主 細 胞 中 進 行 增 生 ,以 獲 得 大 量 的 目 的 DNA片 段 , 或以 此 為 基 礎 , 通 過 基 因 的 誘 導表 達 , 得 到 大 量 相 應 蛋 白 質 產物 的 過 程 。 又 稱 為 分 子 克 隆 技 術 或 基因 工 程 技 術 4 第 二

2、 節(jié) 重 組 DNA技 術 的 發(fā) 展 史 5 基 因 工 程 的 誕 生1、 Berg的 開 創(chuàng) 性 實 驗 第 一 個 實 現(xiàn) DNA重 組1980年 Nobel化 學 獎猴 病 毒 SV40的 DNA+ 噬 菌 體 的 DNA第 一 個 取 得 基 因 工 程 成 功1973年 構 建 雙 重 抗 藥 性 重 組 質 粒1973年 是 基 因 工 程 誕 生 的 元 年 6 第 三 節(jié) 工 具 酶 7Werner Arber 理 論 預 見 限 制 酶 Hamilton O. Smith 得 到 第 一 個 限 制 酶 Daniel Nathans 用 限 制 酶 切 得 SV40 DN

3、A片 斷1978年 Nobel生 理 或 醫(yī) 學 獎 1、 “ 基 因 剪 刀 ” 限 制 性 核 酸 內 切 酶 8 1.定 義 : 能 識 別 雙 鏈 DNA分 子 中 某 特 定 的 核 苷 酸 序 列 , 并 在 識 別 序 列 內 或 附 近 切 割 DNA雙 鏈 結 構 的 一 類 核 酸 內 切 酶 ( 在 核 酸 分 子 鏈 的 內 部 制 造 切 口 的 酶 ) 。2.來 源 : 原 核 生 物 9 型 酶 、 型 酶 : 具 有 限 制 切 割 與 甲 基 化 修 飾 活 性 。 型 和 型 酶 都 沒有 多 大 的 實 用 價 值 。 型 酶 : 應 用 廣 泛 , 能

4、在 DNA分 子 內 部 的 特 異 位 點 , 識 別 和 切割 雙 鏈 DNA, 其 切 割 位 點 的 序 列 可 知 、 固 定 。 通 常 所 說 的 限 制 性 內 切 酶 就 是 指 型 酶 。3.分 類 : 根 據(jù) 結 構 、 作 用 特 點 不 同 , 分 為 三 類 。 10 識 別 位 點 : 即 為 型 酶 識 別 的 特 殊 DNA序 列 。通 常 是 4 8個 堿 基 對 、 具 有 回 文 序 列 的 DNA片 段 5 G A A T T C - 3 3 C T T A A G - 54.識 別 和 切 割 位 點 : 11 5突 出 粘 性 末 端 3突 出 粘

5、 性 末 端 平 頭 ( 鈍 性 末 端 ) 12 5 突 出 黏 性 末 端 (EcoR ):3 突 出 黏 性 末 端 (Pst ):平 端 缺 口 ( 鈍 性 末 端 ) ( Sma ) 5 -G AATTC-3 5 -G AATTC-3 3 -CTTAA G-5 3 -CTTAA G-55 -CTGCA G-3 5 -CTGCA G-33 -G ACGTC-5 3 -G ACGTC-55 -CCC GGG-3 5 -CCC GGG-33 -GGG CCC-5 3 -GGG CCC-5切 割 方 式 : 對 dsDNA 2條 鏈 同 時 切 割 產 生 3種 不 同 缺 口 13 2、

6、DNA連 接 酶 催 化 DNA中 相 鄰 的 5 端 磷 酸 基 和 3 -OH末 端 之 間 形 成3 5 磷 酸 二 酯 鍵 。 大 腸 桿 菌 連 接 酶 , 只 能 連 接 粘 性 末 端 , T4噬 菌 體 連 接 酶 不但 能 連 接 粘 性 末 端 , 還 能 連 接 齊 平 末 端 。ACG-OH P-AATTCGTTACTTAA-P OH-GCA -ACGAATTCGT- -TGCTTAAGCA 14 3、 DNA聚 合 酶 具 有 5 3聚 合 活 性 、 5 3外 切 酶 活 性 、 3 5外 切 酶 活 性 ???用 于 合 成 雙 鏈 cDNA分 子 或 片 斷 連

7、 接 , 探 針 制 備 , 序 列 分 析 等 。( 1) 耐 熱 Taq DNA聚 合 酶 最 適 反 應 溫 度 為 75 80 具 有 5 3 外 切 酶 活 性 , 不 具 有 3 5 外 切 酶 活 性( 3) T4 DNA聚 合 酶 : 主 要 用 于 DNA的 末 端 的 標 記 。( 4) T7 DAN聚 合 酶 長 模 板 DNA引 物 的 延 伸 反 應 , 標 記 DNA。( 2) 逆 轉 錄 酶 15 ( 5) DNA聚 合 酶 大 片 段 ( Klenow 片 段 ) 為 DNA聚 合 酶 I用 枯 草 桿 菌 蛋 白 酶 裂 解 后 產 生 的 大 片 段 , 分

8、子 量 為 76 kD, 這 個 片 段 也 稱 為 Klenow片 段 ( Klenow fragment) 它 除 了 保 留 5 3 聚 合 酶 活 性 及 3 5 外 切 酶 活 性 外 ,失 去 了 5 3 外 切 酶 活 性 。 常 用 于 cDNA第 二 鏈 合 成 , 雙 鏈 DNA 3 端 標 記 等 。 16 ( 1) 5 端 標 記 ( 2) 制 備 載 體 時 , 用 堿 性 磷 酸 酶 處 理 后 , 可 防 止 載 體 自 身 連 接 , 提 高 重 組 效 率 。 堿 性 磷 酸 酶 有 細 菌 堿 性 磷 酸 酶 ( BAP) 和 牛 小 腸 堿 性 磷 酸 酶

9、 ( CIP) 。 CIP能 在 1% SDS溶 液 中 68 加 熱 15 min而 失 活 , 故 CIP較 為 常 用 。 4、 堿 性 磷 酸 酶 去 除 DNA、 RNA、 dNTP和 NTP 5端 的 磷 酸 根 。 17 催 化 單 脫 氧 核 苷 酸 轉 移 到 DNA3-端 羥 基 上 。應 用 : 探 針 標 記 , 標 記 測 序 以 及 制 備 人 工 黏 性 末 端 。催 化 多 聚 核 苷 酸 5 羥 基 末 端 磷 酸 化 。用 途 : 放 射 性 標 記 DNA的 5端 使 缺 少 5-磷 酸 基 的 DNA磷 酸 化 用 于 連 接 反 應 。單 鏈 核 酸

10、內 切 酶 , 降 解 單 鏈 DNA或 RNA。6、 T4多 聚 核 苷 酸 激 酶7、 S1核 酸 酶5、 末 端 轉 移 酶 18 第 四 節(jié) 重 組 DNA技 術 常 用 載 體 19 是 指 能 攜 帶 目 的 基 因 進 入 宿 主 細 胞 進 行 擴 增 和 表 達 的一 類 DNA分 子 。 一 、 定 義 分 類 :克 隆 載 體 : 用 于 在 宿 主 細 胞 中 克 隆 和 擴 增 外 源 DNA片 段 。 表 達 載 體 : 用 于 在 宿 主 細 胞 中 獲 得 外 源 基 因 表 達 產 物 。 20 1、 具 備 復 制 能 力 。2、 具 備 一 個 或 多 個

11、 篩 選 標 志 。3、 具 備 較 多 拷 貝 數(shù) , 易 從 宿 主 細 胞 中 分 離 純 化 。4、 具 備 一 個 或 多 個 限 制 性 內 切 酶 的 單 一 識 別 點 ( 多 克 隆 位 點 , MCS) 。5、 具 有 較 高 的 遺 傳 穩(wěn) 定 性 。 二 、 特 點 21 這 些 載 體 均 需 經 人 工 構 建 , 除 去 致 病 基 因 , 并 賦予 一 些 新 的 功 能 : 如 有 利 于 進 行 篩 選 的 標 志 基 因 、 單 一的 限 制 酶 切 點 等 。 3、 常 用 載 體 質 粒 DNA、 噬 菌 體 DNA、 病 毒 DNA、 酵 母 DNA

12、 22 1、 質 粒 ( plasmid) : 質 粒 為 細 菌 染 色 體 之 外 一 些 能 獨 立 復 制 并 保 持 穩(wěn) 定 遺 傳 的復 制 子 。 結 構 上 , 它 是 一 種 雙 鏈 閉 合 環(huán) 狀 的 DNA分 子 。 23 pBR322質 粒 載 體 相 對 分 子 質 量 小 , 長 度 為 4.3kb。 含 有 氨 芐 青 霉 素 和 四 環(huán) 素 的 抗 性基 因 (Ampr和 Tetr)。 有 24種 限 制 性 內 切 酶 位 點 。 有 一 個 復 制 起 始 點 ( ori) 及 與DNA復 制 有 關 的 序 列 , 賦 予 該 質 粒復 制 子 特 性 。

13、 為 松 弛 型 復 制 子 。 24 是 感 染 細 菌 的 一 類 病 毒 ,寄 生 于 細 菌 中 , 并 能 溶 解 細 菌細 胞 , 故 稱 噬 菌 體 。 2、 噬 菌 體 ( bacteriophage,phage) 25 噬菌體生活周期 26 27 4、 病 毒 3、 酵 母酵 母 人 工 染 色 體 ( YAC) : 用 于 大 片 段 DNA的 克 隆 。 28 第 五 節(jié) 重 組 DNA技 術 29 基 本 步 驟 目 的 基 因 的 獲 取重 組 DNA導 入 受 體 菌目 的 基 因 與 載 體連 接 成 重 組 DNA克 隆 載 體 的 選 擇重 組 體 的 篩 選

14、 克 隆 基 因 的 表 達 30 1、 制 備 目 的 基 因( 1) 化 學 合 成 : 已 知 目 的 基 因 的 核 苷 酸 序 列 或 根 據(jù) 基 因 產 物 的 氨 基 酸 序列 推 導 出 相 應 基 因 DNA堿 基 序 列 。 目 前 使 用 DNA合 成 儀 合 成 的 片 段 長 度 有 限 , 一 般 用 于 小分 子 活 性 多 肽 基 因 的 合 成 , 較 長 的 鏈 則 須 分 段 合 成 , 然 后 用連 接 酶 加 以 連 接 。 31 ( 2) 構 建 基 因 組 DNA文 庫 : 將 某 種 生 物 細 胞 的 整 個 基因 組 DNA用 物 理 或 酶

15、 學 的 方 法切 割 成 預 期 大 小 的 片 斷 , 并 將所 有 這 些 片 斷 都 與 適 當 的 載 體連 接 , 引 入 相 應 的 宿 主 細 胞 中保 存 和 擴 增 。 理 論 上 講 , 這 些 重 組 載 體上 帶 有 了 該 生 物 體 的 全 部 基因 , 稱 為 基 因 文 庫 。 32 (3)構 建 cDNA文 庫 : 33(5)直 接 用 限 制 性 內 切 酶 切 取 、 分 離 : 對 一 些 物 理 圖 譜 已 經 確 定 , 背 景 資 料 清 楚 的原 核 生 物 、 噬 菌 體 及 病 毒 等 基 因 組 , 可 直 接 用 限制 性 內 切 酶

16、消 化 后 , 通 過 分 離 獲 得 目 的 基 因 。 (4)聚 合 酶 鏈 反 應 ( PCR) 已 知 目 的 基 因 的 基 因 序 列 , 用 PCR從 基 因 組DNA中 獲 得 目 的 基 因 , 或 用 逆 轉 錄 PCR方 法 直 接從 mRNA獲 得 特 定 基 因 的 cDNA。 34 2、 克 隆 載 體 的 選 擇 和 構 建 用 于 基 因 組 文 庫 構 建 的 載 體 通 常 選 裝 載 量 較 大 的 噬 菌 體和 黏 性 質 粒 ; cDNA文 庫 和 克 隆 較 小 DNA片 段 通 常 選 pUC系 列 質 粒 ; 待 測 DNA序 列 使 用 M13

17、噬 菌 體 。 35 由 同 一 種 限 制 酶 切割 或 不 同 的 限 制 酶 切 割形 成 互 補 的 黏 性 末 端 。經 退 火 后 , 由 DNA連 接酶 連 接 。3、 目 的 基 因 與 載 體 的 連 接 粘 性 末 端 連 接 : 36 平 端 DNA片 段 可 以 在 T4 DNA連 接 酶 的 作 用下 相 連 接 , 但 連 接 效 率 較 低 。 為 提 高 連 接 效 率 ,所 用 的 ATP及 T4 DNA連 接 酶 的 濃 度 比 粘 性 末 端連 接 要 高 些 。 ( 2) 平 端 連 接 : 37 ( 3) 定 向 連 接 :GAATTCCTTAAG A

18、GATCTTCTAGAEco R 切 割 位 點 GCTTAAATCTAGAATTCGGATCTABg l 切 割 位 點AATTCG ATCTAG AATTCGGATCTA AATTCG ATCTAGEcoR + Bg l雙 酶 切 Eco R + Bg l雙 酶 切GCTTAA ATCTAGAATTCGGATCTAT4 DNA連 接 酶 重 組 體 38 ( 4) 同 聚 物 加 尾 連 接 : 39 ( 5) 人 工 接 頭 連 接 : 接 頭 是 指 含 有 某 些限 制 性 內 切 酶 切 點 的 寡核 苷 酸 片 段 。CCG AATTCG G G CTTAAG C5-3- Eco

19、 R 40 4、 重 組 DNA導 入 受 菌 體 將 重 組 DNA或 其 他 外 源 DNA導 入 宿 主 細 胞 的 常 用 方 法 :轉 化 、 感 染 、 轉 染 、 顯 微 注 射 、 電 穿 孔 等 。轉 化 ( transformation) : 是 指 將 重 組 質 粒 DNA導 入 受 體 細 胞 。轉 染 ( transfection) : 將 重 組 噬 菌 體 DNA直 接 引 入 受 體 細 胞的 過 程 。轉 導 ( transduction) : 重 組 噬 菌 體 DNA分 子 , 在 體 外 經 過 包裝 成 具 有 感 染 能 力 的 噬 菌 體 顆 粒

20、 , 再 以 此 噬 菌 體 為 載 體 , 將重 組 DNA導 入 受 體 細 胞 內 的 過 程 , 也 稱 為 感 染 ( infection) 。 41 5、 重 組 體 的 篩 選 與 鑒 定 篩 選 是 指 通 過 某 些 特 定 方 法 , 從 被 轉 化 的 細胞 群 體 或 基 因 文 庫 中 , 鑒 別 出 真 正 的 陽 性 重 組 子的 過 程 。 42 ( 一 ) 根 據(jù) 遺 傳 表 型 進 行 篩 選 的 方 法 ( 1) 抗 生 素 抗 性 篩 選 ( 2) -半 乳 糖 苷 酶 系 統(tǒng) 篩 選( 二 ) 根 據(jù) 重 組 子 結 構 特 征 進 行 篩 選 的 方

21、 法方 法 : 43 ( 1) 抗 生 素 抗 性 篩 選 : 大 多 數(shù) 載 體 均 帶 有 抗 生 素 抗 性 基 因( 一 ) 根 據(jù) 遺 傳 表 型 進 行 篩 選 的 方 法 b.插 入 失 活 法 :外 源 基 因 插 入 到 一 個 抗 性 基 因 位 點 , 使 此 種 抗 生 素 抗 性 消 失 , 重 組 體 轉 化 的 細 菌 不 能 在 含 有 這 種 抗 生 素 的 培 養(yǎng) 基 中 生 長 。a.構 建 重 組 體 時 , 保 留 了 抗 性 基 因 活 性 , 所 轉 化 的 細 胞 就 能 在 含 此 種 抗 生 素 的 培 養(yǎng) 基 中 生 長 ,未 轉 化 的

22、細 胞 則 不 能 生 長 。 44 ( 插入失活法)抗生素抗性篩選 45 ( 2) -半 乳 糖 苷 酶 系 統(tǒng) 篩 選 46 47 ( 二 ) 根 據(jù) 重 組 子 結 構 特 征 進 行 篩 選 的 方 法 ( 1) 快 速 裂 解 菌 落 并 鑒 定 分 子 大 小( 2) 內 切 酶 酶 切 圖 譜 鑒 定( 3) 分 子 雜 交( 4) PCR( 5) 核 酸 序 列 測 定 48 原位雜交 49 6、 外 源 基 因 的 表 達 與 分 離 純 化( 一 ) 原 核 表 達 體 系 ( E.coli表 達 體 系 最 為 常 用 ) 利 用 原 核 細 胞 ( 大 腸 桿 菌 為

23、主 ) 作 受 體 細 胞 , 經 培 養(yǎng) 、誘 導 表 達 外 源 目 的 基 因 。 50 ( 二 ) 真 核 表 達 體 系 ( 酵 母 、 昆 蟲 、 哺 乳 類 動 物 細 胞 ) 利 用 真 核 細 胞 作 為 受 體 細 胞 , 誘 導 表 達 外 源 基 因 51 ( 1) 分 離 : 提 取 和 獲 得 目 的 基 因 和 載 體( 2) 切 割 : 分 別 對 目 的 基 因 和 載 體 DNA 酶 切 ;( 3) 連 接 : 目 的 基 因 與 載 體 連 接 , 形 成 新 的 重 組 DNA分 子 ;( 4) 轉 化 : 用 重 組 DNA分 子 轉 化 受 體 細 胞 ;( 5) 篩 選 : 篩 選 轉 化 成 功 的 細 胞 克 ?。?6) 表 達 : 培 養(yǎng) 獲 得 外 源 基 因 的 細 胞 或 生 物 體 , 獲 得 所 需 的 遺 傳 性 狀 或 表 達 出 所 需 要 的 產 物 。小 結 : 52 第 六 節(jié) 重 組 DNA技 術 的 在 醫(yī) 學 上 的 應 用 ( 自 學 ) 53 謝 謝 !

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