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1、
核酸化學
1. 堿基互補規(guī)律(complementary base pairing):在形成雙螺旋結構的過程中,由于各種堿基的大小與結構的不同,使得堿基之間的互補配對只能在G…C(或C…G)和A…T(或T…A)之間進行,這種堿基配對的規(guī)律就稱為堿基配對規(guī)律(互補規(guī)律)。
2. 順反子(cistron):基因功能的單位;一段染色體,它是一種多肽鏈的密碼;一種結構基因。
3. 核酸的變性、復性(denaturation、renaturation):當呈雙螺旋結構的DNA溶液緩慢加熱時,其中的氫鍵便斷開,雙鏈DNA便脫解為單鏈,這叫做核酸的“溶解”或變性。在適宜的溫度下,分散開的兩條DNA
2、鏈可以完全重新結合成和原來一樣的雙股螺旋。這個DNA螺旋的重組過程稱為“復性”。
4. 退火(annealing):當將雙股鏈呈分散狀態(tài)的DNA溶液緩慢冷卻時,它們可以發(fā)生不同程度的重新結合而形成雙鏈螺旋結構,這現(xiàn)象稱為“退火”。
5. 增色效應(hyper chromic effect):當DNA從雙螺旋結構變?yōu)閱捂湹臒o規(guī)則卷曲狀態(tài)時,它在260nm處的吸收便增加,這叫“增色效應”。
6. 減色效應(hypo chromic effect):DNA在260nm處的光密度比在DNA分子中的各個堿基在260nm處吸收的光密度的總和小得多(約少35%~40%), 這現(xiàn)象稱為“減色效應”。
3、7. DNA的熔解溫度(Tm值):引起DNA發(fā)生“熔解”的溫度變化范圍只不過幾度,這個溫度變化范圍的中點稱為熔解溫度(Tm)。
8. 分子雜交(molecular hybridization):不同的DNA片段之間,DNA片段與RNA片段之間,如果彼此間的核苷酸排列順序互補也可以復性,形成新的雙螺旋結構。這種按照互補堿基配對而使不完全互補的兩條多核苷酸相互結合的過程稱為分子雜交。
9. 環(huán)化核苷酸(cyclic nucleotide):單核苷酸中的磷酸基分別與戊糖的3’-OH及5’-OH形成酯鍵,這種磷酸內酯的結構稱為環(huán)化核苷酸。
10. 回文結構與鏡像重復 學指P22
11.
4、Watson-Crick配對與Hoogsteen配對 學指P23
12. DNA雙螺旋與DNA超螺旋:DNA雙螺旋(DNA double helix)是一種核酸的構象,在該構象中,兩條反向平行的多核甘酸鏈相互纏繞形成一個右手的雙螺旋結構。超螺旋是由于雙螺旋DNA的彎曲、正超螺旋或負超螺旋而造成的DNA分子進一步扭曲所形成的DNA的一種三級結構。
13. 核酶與SiRNA:核酶是具有催化功能的RNA分子 學指P23
蛋白質化學
14. 必需氨基酸:指人體(和其它哺乳動物)自身不能合成,機體又必需,需要從飲食中獲得的氨基酸。
15. 等電點:指氨基酸的正離子濃度和負離子濃
5、度相等時的pH 值,用符號pI表示。
16. 稀有氨基酸:指存在于蛋白質中的20 種常見氨基酸以外的其它罕見氨基酸,它們是正常氨基酸的衍生物。
17. 蛋白質的一級結構:指蛋白質多肽鏈中氨基酸的排列順序,以及二硫鍵的位置。
18. 蛋白質的二級結構:指在蛋白質分子中的局部區(qū)域內,多肽鏈沿一定方向盤繞和折疊的方式。
19. 結構域:指蛋白質多肽鏈在二級結構的基礎上進一步卷曲折疊成幾個相對獨立的近似球形的組裝體。
20. 蛋白質的三級結構:指蛋白質在二級結構的基礎上借助各種次級鍵卷曲折疊成特定的球狀分子結構的構象。
21. 蛋白質的四級結構:指多亞基蛋白質分子中各個具有三級結構的多肽鏈
6、以適當方式聚合所呈現(xiàn)的三維結構。
22. 超二級結構:指蛋白質分子中相鄰的二級結構單位組合在一起所形成的有規(guī)則的、在空間上能辨認的二級結構組合體。
23. 蛋白質的變性作用:蛋白質分子的天然構象遭到破壞導致其生物活性喪失的現(xiàn)象。蛋白質在受到光照、熱、有機溶劑以及一些變性劑的作用時,次級鍵遭到破壞導致天然構象的破壞,但其一級結構不發(fā)生改變。
24. 蛋白質的復性:指在一定條件下,變性的蛋白質分子恢復其原有的天然構象并恢復生物活性的現(xiàn)象。
25. 電泳 學指P25
26. 酰胺平面(肽平面/肽單位) 學指P65
27. 二面角 學指P66
28. 氨基酸殘基
7、學指P65
酶
29. 米氏常數(shù)(Km 值):用Km 值表示,是酶的一個重要參數(shù)。Km值是酶反應速度(V)達到最大反應速度(Vmax)一半時底物的濃度(單位M 或mM)。米氏常數(shù)是酶的特征常數(shù),只與酶的性質有關,不受底物濃度和酶濃度的影響。
30. 單體酶:只有一條多肽鏈的酶稱為單體酶,它們不能解離為更小的單位。分子量為13,000??35,000。
31. 寡聚酶:有幾個或多個亞基組成的酶稱為寡聚酶。寡聚酶中的亞基可以是相同的,也可以是不同的。亞基間以非共價鍵結合,容易為酸堿,高濃度的鹽或其它的變性劑分離。寡聚酶的分子量從35 000 到幾百萬。
32. 多酶體系:由幾個酶彼此
8、嵌合形成的復合體稱為多酶體系。多酶復合體有利于細胞中一系列反應的連續(xù)進行,以提高酶的催化效率,同時便于機體對酶的調控。多酶復合體的分子量都在幾百萬以上。
33. 激活劑:凡是能提高酶活性的物質,都稱激活劑,其中大部分是離子或簡單的有機化合物。
34. 抑制劑:能使酶的必需基團或酶活性部位中的基團的化學性質改變而降低酶的催化活性甚至使酶的催化活性完全喪失的物質。
35. 變構酶:或稱別構酶,是代謝過程中的關鍵酶,它的催化活性受其三維結構中的構象變化的調節(jié)。
36. 同工酶:是指有機體內能夠催化同一種化學反應,但其酶蛋白本身的分子結構組成卻有所不同的一組酶。
37. 活性中心:酶分子中直
9、接與底物結合,并催化底物發(fā)生化學反應的部位,稱為酶的活性中心。
38. 必須基團:酶蛋白上與酶活性密切相關的基團,經(jīng)過化學修飾(烷化,?;龋┦姑甘Щ?,往往分布于活性中心,但非活性中心。它直接參與對底物分子結合和催化的基團以及參與維持酶分子構象的基團。
39. 酶的最適溫度 學指P92
40. 輔酶和輔基 學指P92
糖類代謝
41. 糖異生:非糖物質(如丙酮酸或草酰乙酸等)轉變?yōu)槠咸烟堑倪^程。
42. 糖酵解途徑:糖酵解途徑指糖原或葡萄糖分子分解至生成丙酮酸的階段,是體內糖代謝最主要途徑。
43. 磷酸戊糖途徑:磷酸戊糖途徑指機體某些組織(如肝、脂肪組織
10、等)以6-磷酸葡萄糖為起始物在6-磷酸葡萄糖脫氫酶催化下形成6-磷酸葡萄糖酸進而代謝生成磷酸戊糖為中間代謝物的過程,又稱為磷酸已糖旁路。
44. UDPG
45. 單糖 學指P136
46. 寡糖 學指P136
47. 多糖 學指P136
48. 回補反應 學指P136
生物氧化和能量轉換
49. 生物氧化: 生物體內有機物質氧化而產生大量能量的過程稱為生物氧化。生物氧化在細胞內進行,氧化過程消耗氧放出二氧化碳和水,所以有時也稱之為“細胞呼吸”或“細胞氧化”。生物氧化包括:有機碳氧化變成CO2;底物氧化脫氫、氫及電子通過呼吸鏈傳遞、分子氧與傳遞的氫結成
11、水;在有機物被氧化成CO2 和H2O的同時,釋放的能量使ADP 轉變成ATP。
50. 呼吸鏈:有機物在生物體內氧化過程中所脫下的氫原子,經(jīng)過一系列有嚴格排列順序的傳遞體組成的傳遞體系進行傳遞,最終與氧結合生成水,這樣的電子或氫原子的傳遞體系稱為呼吸鏈或電子傳遞鏈。電子在逐步的傳遞過程中釋放出能量被用于合成ATP,以作為生物體的能量來源。
51. 氧化磷酸化:在底物脫氫被氧化時,電子或氫原子在呼吸鏈上的傳遞過程中伴隨ADP 磷酸化生成ATP 的作用,稱為氧化磷酸化。氧化磷酸化是生物體內的糖、脂肪、蛋白質氧化分解合成ATP 的主要方式。
52. 磷氧比:電子經(jīng)過呼吸鏈的傳遞作用最終與氧結合
12、生成水,在此過程中所釋放的能量用于ADP 磷酸化生成ATP。經(jīng)此過程消耗一個原子的氧所要消耗的無機磷酸的分子數(shù)(也是生成ATP 的分子數(shù))稱為磷氧比值(P/O)。如NADH 的磷氧比值是3,F(xiàn)ADH2 的磷氧比值是2。
53. 底物水平磷酸化:在底物被氧化的過程中,底物分子內部能量重新分布產生高能磷酸鍵(或高能硫酯鍵),由此高能鍵提供能量使ADP(或GDP)磷酸化生成ATP(或GTP)的過程稱為底物水平磷酸化。此過程與呼吸鏈的作用無關,以底物水平磷酸
54. 化方式只產生少量ATP。如在糖酵解(EMP)的過程中,3-磷酸甘油醛脫氫后產生的1,3-二磷酸甘油酸,在磷酸甘油激酶催化下形成ATP
13、 的反應,以及在2-磷酸甘油酸脫水后產生的磷酸烯醇式丙酮酸,在丙酮酸激酶催化形成ATP 的反應均屬底物水平的磷酸化反應。另外,
55. 在三羧酸環(huán)(TCA)中,也有一步反應屬底物水平磷酸化反應,如α-酮戊二酸經(jīng)氧化脫羧后生成高能化合物琥珀?!獵oA,其高能硫酯鍵在琥珀酰CoA 合成酶的催化下轉移給GDP 生成GTP。然后在核苷二磷酸激酶作用下,GTP 又將末端的高能磷酸根轉給ADP 生成ATP。
56. 能荷:能荷是細胞中高能磷酸狀態(tài)的一種數(shù)量上的衡量,能荷大小可以說明生物體
57. 中ATP-ADP-AMP 系統(tǒng)的能量狀態(tài)。
58. 能荷=[ATP]+12 [ADP][ATP]+[A
14、DP]+[AMP]
59. 解偶聯(lián)劑 學指P149
脂類物質的合成與分解
60. 必需脂肪酸:為人體生長所必需但有不能自身合成,必須從事物中攝取的脂肪酸。在脂肪中有三種脂肪酸是人體所必需的,即亞油酸,亞麻酸,花生四烯酸。
61. α-氧化:α-氧化作用是以具有3-18碳原子的游離脂肪酸作為底物,有分子氧間接參與,經(jīng)脂肪酸過氧化物酶催化作用,由α碳原子開始氧化,氧化產物是D-α-羥脂肪酸或少一個碳原子的脂肪酸。
62. β-氧化:脂肪酸的β-氧化作用是脂肪酸在一系列酶的作用下,在α碳原子和β碳原子之間斷裂,β碳原子氧化成羧基生成含2個碳原子的乙酰CoA 和比原來少2 個碳
15、原子的脂肪酸。
63. ω-氧化:ω-氧化是C5、C6、C10、C12脂肪酸在遠離羧基的烷基末端碳原子被氧化成羥基,再進一步氧化而成為羧基,生成α,ω-二羧酸的過程。
64. ACP(?;d體蛋白) 學指P165
65. 檸檬酸穿梭:就是線粒體內的乙酰CoA 與草酰乙酸縮合成檸檬酸,然后經(jīng)內膜上的三羧酸載體運至胞液中,在檸檬酸裂解酶催化下,需消耗ATP 將檸檬酸裂解回草酰乙酸和,后者就可用于脂肪酸合成,而草酰乙酸經(jīng)還原后再氧化脫羧成丙酮酸,丙酮酸經(jīng)內膜載體運回線粒體,在丙酮酸羧化酶作用下重新生成草酰乙酸,這樣就可又一次參與轉運乙酰CoA 的循環(huán)。
66. NADPH:它是細胞中易
16、利用的還原力,它不被呼吸鏈氧化產生ATP,而是在還原性的生物合成中作氫和電子的供體。它是還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸。
67. 肉堿穿梭 學指P165
68. 脂肪酸合酶復合體:脂肪酸合酶系統(tǒng):脂肪酸合酶系統(tǒng)包括?;d體蛋白(ACP)和6 種酶,它們分別是:乙酰轉酰酶;丙二酸單酰轉酰酶;β-酮脂酰ACP 合成酶;β-酮脂酰ACP 還原酶;β-羥;脂酰ACP 脫水酶;烯脂酰ACP 還原酶。
69. 多不飽和脂肪酸:含有兩個或兩個以上雙鍵的脂肪酸。
70. 乙酰CoA 羧化酶系:大腸桿菌乙酰CoA 羧化酶含生物素羧化酶、生物素羧基載體蛋白(BCCP)和轉羧基酶三種組份,它們共同作用
17、催化乙酰CoA 的羧化反應,生成丙二酸單酰-CoA。
71. 乙醛酸循環(huán):一種被修改的檸檬酸循環(huán),在其異檸檬酸和蘋果酸之間反應順序有改變,以及乙酸是用作能量和中間物的一個來源。某些植物和微生物體內有此循環(huán),他需要二分子乙酰輔酶A的參與;并導致一分子琥珀酸的合成。
72. HMG-CoA:HMG-CoA還原酶:肝細胞合成膽固醇過程中的限速酶,催化生成甲羥戊酸,抑制HMG-CoA還原酶能阻礙膽固醇合成。
核酸的生物合成
73. 復制:由一個親代DNA或一個親代RNA合成一個新的子代分子的過程,用親代分子作為合成的模板。
74. 半保留復制:雙鏈DNA 的復制方式,其中親代鏈分離,每一
18、子代DNA 分子由一條親代鏈和一條新合成的鏈組成。
75. 半不連續(xù)復制: 學指P210
76. 轉錄: 學指P211
77. 逆轉錄:以RNA為模板合成DNA的過程稱為逆轉錄。
78. 岡崎片段:在合成隨后鏈時合成許多小的DNA片段,這些小的DNA片段由岡崎發(fā)現(xiàn),故稱為岡崎片段。
79. 前導鏈 學指P210
80. 隨后鏈 學指P210
81. 啟動子 學指P211
82. 終止子 學指P211
83. 內含子:真核生物的mRNA 前體中,除了貯存遺傳序列外,還存在非編碼序列,稱為內含子。
84. 外顯子:真核生物的mRNA 前體中,
19、編碼序列稱為外顯子。
85. 中心法則:指遺傳信息從DNA傳遞給RNA,再從RNA傳遞給蛋白質,即完成遺傳信息的轉錄和翻譯的過程。也可以從DNA傳遞給DNA,即完成DNA的復制過程。
86. 翻譯:
87. 引物酶:
88. 反義鏈:
89. cDNA:
90. RNA剪接:將內含子剪掉,將外顯子連接起來的分子過程。
91. hnRNA 學指P211
92. 轉錄鼓泡
蛋白質的生物合成
93. 密碼子(codon):存在于信使RNA 中的三個相鄰的核苷酸順序,是蛋白質合成中某一特定氨基酸的密碼單位。密碼子確定哪一種氨基酸叁入蛋白質多肽鏈的特定位置上;共有64 個密碼子,其中61 個是氨基酸的密碼,3 個是作為終止密碼子。
94. 同義密碼子(synonym codon):為同一種氨基酸編碼的幾個密碼子之一,例如密碼子UUU 和UUC 二者都為苯丙氨酸編碼。
95. 反密碼子(anticodon):在轉移RNA 反密碼子環(huán)中的三個核苷酸的序列,在蛋白質合成中通過互補的堿基配對,這部分結合到信使RNA 的特殊密碼上。
96. 多核糖體(polysome):在信使核糖核酸鏈上附著兩個或更多的核糖體。