生物芯片技術(shù)及其發(fā)展
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1、 生 物 芯 片 的 定 義 生 物 芯 片 ( Biochip或 Bioarray) 是 指 包被 在 固 相 載 體 上 的 高 密 度 DNA、 抗 原 、 抗體 、 細(xì) 胞 或 組 織 的 微 點(diǎn) 陣 (microarray) 。 生 物 芯 片 包 括 DNA芯 片 、 抗 原 芯 片 、 抗 體芯 片 、 細(xì) 胞 芯 片 、 組 織 芯 片 等 。 1998年 世 界 十 大 科 技 突 破 之 一 。 未 來 十 年 最 具 發(fā) 展 潛 力 的 技 術(shù) 。 特 點(diǎn) 高 度 并 行 性 : 提 高 實(shí) 驗(yàn) 進(jìn) 程 、 利 于顯 示 圖 譜 的 快 速 對 照 和 閱 讀 。 多 樣
2、 性 : 可 進(jìn) 行 樣 品 的 多 方 面 分 析 ,提 高 精 確 性 , 減 少 誤 差 。 微 型 化 : 減 少 試 劑 用 量 和 反 應(yīng) 液 體積 , 提 高 樣 品 濃 度 和 反 應(yīng) 速 率 。 自 動(dòng) 化 : 降 低 成 本 , 保 證 質(zhì) 量 。 生 物 芯 片 分 類 尚 未 統(tǒng) 一 。 廣 義 上 : 矩 陣 型 芯 片 、 處 理 型 芯 片 固 化 材 料 : 基 因 芯 片 、 蛋 白 質(zhì) 芯 片 、細(xì) 胞 芯 片 、 組 織 芯 片 研 究 歷 史 1991 Affymatrix公 司 Stephen Fodor:光 刻 與 光 化學(xué) 技 術(shù) 、 多 肽 和
3、寡 聚 核 苷 酸 微 陣 列 。 DNA Chip概 念 Stanford大 學(xué) Brown實(shí) 驗(yàn) 室 : 預(yù) 先 合 成 , 機(jī) 械 手 陣 列 1995 Schena等 : 基 因 表 達(dá) 譜 1996 Chee et al: DNA測 序 1996 Cronin et al: 突 變 檢 測 1996 Sapolsley & Lipshutz: 基 因 圖 克 隆 1996 Shalon et al: 復(fù) 雜 DNA樣 本 分 析 1996 Shoemaker et al: 缺 省 突 變 定 量 表 型 分 析 分 類 ( 根 據(jù) 應(yīng) 用 ) 基 因 變 異 檢 測 芯 片 疾 病
4、檢 測 (如 HIV、 P53基 因 、 結(jié) 核 桿 菌 ) 法 醫(yī) 鑒 定 (如 DNA指 紋 圖 譜 ) 表 達(dá) 譜 芯 片 腫 瘤 相 關(guān) 基 因 (正 常 與 腫 瘤 組 織 表 達(dá) 差 異 ) 藥 物 篩 選 (培 養(yǎng) 細(xì) 胞 藥 物 刺 激 前 后 表 達(dá) 差 異 ) 發(fā) 育 (同 一 組 織 不 同 發(fā) 育 時(shí) 期 基 因 表 達(dá) 差 異 ) 組 織 發(fā) 生 (不 同 組 織 或 器 官 的 基 因 表 達(dá) 差 異 ) 分 類 ( 根 據(jù) 工 藝 和 載 體 ) 原 位 合 成 法 : 密 集 程 度 高 , 可 合 成 任 意 序列 的 寡 聚 核 苷 酸 , 但 特 異 性
5、較 差 , 寡 聚 核 苷酸 合 成 長 度 有 限 , 且 隨 長 度 增 加 , 合 成 錯(cuò) 誤率 增 高 。 成 本 較 高 , 設(shè) 計(jì) 和 制 造 較 煩 瑣 費(fèi) 時(shí) 。 DNA微 矩 陣 法 : 成 本 低 , 易 操 作 , 點(diǎn) 樣 密 度通 常 能 滿 足 需 要 。 芯 片 的 載 體 需 表 面 緊 質(zhì) 、光 滑 的 固 體 , 如 硅 , 陶 , 玻 璃 等 , DNA微 矩 陣芯 片 常 用 玻 片 為 載 體 。 分 類 ( 根 據(jù) DNA成 分 ) 寡 聚 核 苷 酸 或 DNA片 段 : 約 2025個(gè) 核苷 酸 堿 基 , 常 用 于 基 因 類 型 的 分 析
6、,如 突 變 、 正 常 變 異 ( 多 態(tài) 性 ) 。 全 部 或 部 分 cDNA: 約 5005000個(gè) 核 苷酸 堿 基 , 通 常 用 于 兩 種 或 以 上 樣 本 的相 關(guān) 基 因 表 達(dá) 分 析 。 基 因 芯 片 的 種 類 Science Chip: 生 物 分 析 和 診 斷 。 Nutri Chip: 食 物 分 析 、 轉(zhuǎn) 基 因 、 污 染 檢 測 。 Leuko Chip: 血 液 分 析 、 病 毒 分 析 、 HLA分 析 。 Aqua Chip: 水 質(zhì) 分 析 。 Secure Chip: 含 DNA的 物 質(zhì) 鑒 定 。 Chromo Chip: 基 因
7、 分 析 和 染 色 體 序 列 。 Prokaryo Chip: 原 核 生 物 、 獸 醫(yī) 、 環(huán) 保 等 。 芯 片 制 備 : 微 點(diǎn) 陣 樣 本 制 備 : DNA提 純 、 擴(kuò) 增 、 標(biāo) 記 雜 交 : 樣 本 與 互 補(bǔ) 模 板 形 成 雙 鏈 檢 測 : 共 聚 焦 掃 描 , 雙 色 激 光 數(shù) 據(jù) 處 理 : 定 量 軟 件 , 數(shù) 據(jù) 庫 檢 索 , RNA印 跡 等 。 結(jié) 果 生 物 芯 片 分 析 1、 測 定 過 程 應(yīng) 包 括 五 個(gè) 基 本 步 驟 : 需 解 決 的 生 物 學(xué) 問 題 樣 本 制 備 生 物 化 學(xué) 反 應(yīng) 檢 測 數(shù) 據(jù) 分 析 2、
8、生 物 學(xué) 系 統(tǒng) 控 制 必 須 精 確 地 與 檢 測 目 的 相 匹 配 。3、 生 物 學(xué) 樣 本 必 須 精 確 地 與 生 物 學(xué) 種 類 相 匹 配 。4、 所 有 基 因 分 析 必 須 平 行 處 理 。5、 基 因 分 析 技 術(shù) 必 須 適 合 微 型 化 和 自 動(dòng) 化 。6、 平 行 格 式 必 須 精 確 的 依 據(jù) 生 物 學(xué) 樣 本 的 次 序 。7、 檢 測 系 統(tǒng) 必 須 能 精 確 地 獲 得 數(shù) 據(jù) 。8、 檢 測 系 統(tǒng) 獲 得 的 數(shù) 據(jù) 必 須 能 被 精 確 地 控 制 和 重 復(fù) 。 9、 兩 種 或 以 上 平 行 數(shù) 據(jù) 組 比 較 應(yīng) 受
9、 到 單 個(gè) 實(shí) 驗(yàn) 所 固 有 特 性 的 限 制 。10、 絕 對 比 例 關(guān) 系 只 存 在 于 組 合 實(shí) 驗(yàn) 的 平 行 數(shù) 據(jù) 組 內(nèi) 。11、 平 行 格 式 包 括 內(nèi) 在 和 外 部 的 整 個(gè) 系 統(tǒng) 誤 差 的 分 析 因 素 。12、 在 每 個(gè) 系 統(tǒng) 模 塊 中 采 集 到 該 系 統(tǒng) 所 有 變 量 的 四 維 數(shù) 據(jù) 時(shí) , 才 能 稱 為 完 成 生 物 系 統(tǒng) 平 行 基 因 分 析 。 生 物 芯 片 技 術(shù) 的 12條 原 則 只 是 一 個(gè) 基 本框 架 。 其 術(shù) 語 的 詳 細(xì) 定 義 和 有 關(guān) 理 論 可參 見http:/cmgm.stanfo
10、rd.edu/schena/http:/ 芯 片 制 備 原 位 合 成 法 ( in situ synthesis):又 可 分 為原 位 光 控 合 成 法 和 原 位 標(biāo) 準(zhǔn) 試 劑 合 成 法 。 適 用于 寡 核 苷 酸 , 使 用 光 引 導(dǎo) 化 學(xué) 原 位 合 成 技 術(shù) 。是 目 前 制 造 高 密 度 寡 核 苷 酸 最 為 成 功 的 方 法 。 合 成 后 交 聯(lián) ( post-synthetic attachment):利 用 手 工 或 自 動(dòng) 點(diǎn) 樣 裝 置 將 預(yù) 先 制 備 好 的 寡 核苷 酸 或 cDNA樣 品 點(diǎn) 在 經(jīng) 特 殊 處 理 過 的 玻 片 或
11、 其他 材 料 上 。 主 要 用 于 診 斷 、 檢 測 病 原 體 及 其 他特 殊 要 求 的 中 、 低 密 度 芯 片 的 制 備 。 兩 種 制 備 方 法 比 較 原 位 合 成 : 測 序 、 查 明 點(diǎn) 突 變高 密 度 、 根 據(jù) 已 知 的 DNA編 制 程 序制 作 復(fù) 雜 、 價(jià) 格 昂 貴 、 不 能 測 定 未 知 DNA序 列 合 成 后 交 聯(lián) : 比 較 分 析制 備 方 式 直 接 和 簡 單 , 點(diǎn) 樣 的 樣 品 可 事 先 純 化 ,交 聯(lián) 方 式 多 樣 , 可 設(shè) 計(jì) 和 制 備 符 合 自 己 需 要 的 芯 片 。中 、 低 密 度 , 樣
12、品 浪 費(fèi) 較 多 且 制 備 前 需 儲 存 大 量 樣 品 。 雜 交 是 芯 片 技 術(shù) 中 除 方 陣 構(gòu) 建 外 最 重 要 的 一 步 液 相 中 探 針 與 DNA片 段 按 堿 基 配 對 規(guī) 則 形 成雙 鏈 反 應(yīng) 。 選 擇 雜 交 條 件 時(shí) , 必 須 滿 足 檢 測 時(shí) 的 靈 敏度 和 特 異 性 。 使 能 檢 測 到 低 豐 度 基 因 , 且 能保 證 每 條 探 針 都 能 與 互 補(bǔ) 模 板 雜 交 。 合 適 長 度 的 DNA有 利 于 與 探 針 雜 交 。 溫 度 、 非 特 異 性 本 底 等 均 會 影 響 雜 交 結(jié) 果 。 最 好 在 封
13、 閉 循 環(huán) 條 件 下 雜 交 , 雜 交 爐 。 樣 本 制 備 制 備 高 質(zhì) 量 樣 本 是 困 難 的 但 又 是 極 其 重 要 的 。制 備 細(xì) 胞 、 組 織 或 整 個(gè) 器 官 樣 本 應(yīng) 特 別 小 心 。溫 度 、 激 素 和 營 養(yǎng) 環(huán) 境 、 遺 傳 背 景 、 組 織 成 分等 輕 微 改 變 都 會 使 基 因 表 達(dá) 的 結(jié) 果 發(fā) 生 明 顯 變化 。 用 于 基 因 類 型 分 析 的 樣 本 是 DNA, 用 于 表 達(dá) 研究 的 樣 本 是 cDNA。 樣 本 制 備 后 應(yīng) 進(jìn) 行 標(biāo) 記 , 通 常 為 酶 標(biāo) 記 、 熒 光標(biāo) 記 和 核 素 標(biāo)
14、記 。 結(jié) 果 分 析 芯 片 與 標(biāo) 記 的 靶 DNA或 RNA雜 交 后 , 或 與 標(biāo) 記 的靶 抗 原 或 抗 體 結(jié) 合 后 , 可 采 用 下 列 方 法 分 析 處理 數(shù) 據(jù) : 共 聚 焦 掃 描 儀 : 應(yīng) 用 最 廣 , 重 復(fù) 性 好 但 靈 敏 度較 低 。 質(zhì) 譜 法 : 快 速 、 精 確 , 可 準(zhǔn) 確 判 斷 是 否 存 在 基因 突 變 和 精 確 判 斷 突 變 基 因 的 序 列 位 置 。 探 針合 成 較 復(fù) 雜 。 化 學(xué) 發(fā) 光 、 光 導(dǎo) 纖 維 、 二 極 管 方 陣 檢 測 、 直 接電 荷 變 化 檢 測 等 。 芯 片 掃 讀 裝 置
15、根 據(jù) 采 用 的 光 電 偶 合 器 件 , 分 為 光 電 倍增 管 型 和 CCD型 。 根 據(jù) 激 光 光 源 , 可 分 為 激 光 型 和 非 激 光型 。 應(yīng) 用 最 為 廣 泛 的 是 激 光 光 源 的 共 聚 焦 掃描 裝 置 , 分 辨 率 、 靈 敏 度 極 高 , 有 良 好的 定 位 功 能 , 可 定 量 , 應(yīng) 用 廣 泛 。 圖 象 分 析 復(fù) 雜 的 雜 交 圖 譜 一 般 需 由 圖 象 分 析 軟 件來 完 成 。 分 析 軟 件 的 功 能 : 鑒 定 每 個(gè) 點(diǎn) 陣 、 最 大限 度 消 除 本 底 熒 光 的 干 擾 、 解 析 多 種 顏色 圖
16、象 、 可 標(biāo) 記 或 排 除 假 陽 性 、 識 別 和分 析 對 照 實(shí) 驗(yàn) 是 否 成 功 、 可 將 信 號 標(biāo) 準(zhǔn)化 等 。 圖 象 處 理 軟 件 必 須 具 備 提 取 基 因 庫 和 數(shù)據(jù) 庫 的 能 力 。 質(zhì) 量 控 制 實(shí) 驗(yàn) 對 照 : 體 外 轉(zhuǎn) 錄 從 cDNA合 成 mRNA, 參 入 標(biāo) 本 中 作 為 對 照 。此 mRNA不 與 點(diǎn) 陣 的 核 酸 雜 交 。 將 不 同 濃 度 的 不 同 基 因 參 入 標(biāo) 本 中 , 可 作 為 標(biāo) 本間 標(biāo) 準(zhǔn) 化 的 參 照 。 用 兩 種 不 同 吸 收 光 譜 的 熒 光 素 同 時(shí) 分 析 兩 個(gè) 標(biāo) 本 ,
17、如 果 兩 種 熒 光 強(qiáng) 度 一 致 , 可 排 除 標(biāo) 本 間 變 異 因 素 。 用 單 一 堿 基 錯(cuò) 配 的 寡 核 苷 酸 做 對 照 可 排 除 交 叉 雜交 。 結(jié) 果 有 效 性 的 證 實(shí) 在 表 達(dá) 矩 陣 上 , 有 時(shí) 難 于 區(qū) 分 極 其 相 似 的 序 列 , 如基 因 族 成 員 , 亞 類 或 異 類 的 存 在 。 比 較 兩 種 不 同 DNA序 列 表 達(dá) 水 平 時(shí) , 有 些 參 數(shù) 如 核苷 酸 的 成 分 、 二 級 結(jié) 構(gòu) 的 存 在 和 矩 陣 上 DNA的 長 度都 會 影 響 雜 交 。 證 實(shí) 矩 陣 分 析 的 結(jié) 果 可 用 RT
18、-PCR(區(qū) 別 基 因 族 成 員 ,比 較 不 同 DNA種 系 表 達(dá) ,證 實(shí) 基 因 變 異 或 突 變 和 精 確測 定 DNA表 達(dá) 水 平 )、 Northern Blot(證 實(shí) 某 一 基 因的 相 對 表 達(dá) 水 平 )、 Western Blot(RNA表 達(dá) 是 否 達(dá)到 細(xì) 胞 中 的 蛋 白 水 平 )、 質(zhì) 譜 儀 (證 實(shí) 矩 陣 結(jié) 果 是 否在 蛋 白 水 平 )等 。 基 因 表 達(dá) 分 析 : 腫 瘤 基 因 突 變 檢 測 : 遺 傳 性 疾 病 測 序 、 基 因 圖 繪 制 和 多 態(tài) 性 分 析 : 測 序 微 生 物 菌 種 鑒 定 : 毒
19、力 基 因 、 抗 藥 基 因 藥 物 研 究 : 新 藥 篩 選 、 指 導(dǎo) 合 理 用 藥 克 隆 選 擇 及 文 庫 篩 選 生 物 芯 片 技 術(shù) 的 發(fā) 展 發(fā) 展 趨 勢 微 型 化 : DNA矩 陣 越 來 越 小 。 集 成 化 : 矩 陣 上 的 基 因 組 越 來 越 大 。 多 樣 化 : 測 定 范 圍 越 來 越 廣 。 微 量 化 : 測 定 所 需 樣 本 越 來 越 少 。 全 自 動(dòng) 化 : 樣 品 制 備 到 結(jié) 果 顯 示 全 部 分 析 過 程 。 定 量 化 : 如 激 光 捕 獲 技 術(shù) , 顯 微 解 剖 技 術(shù) 等 可精 確 測 定 一 個(gè) 細(xì)
20、胞 內(nèi) 的 一 個(gè) 基 因 的 表 達(dá) 。 DNA矩 陣 數(shù) 據(jù) 信 息 庫 的 完 善 。 生 物 芯 片 技 術(shù) 的 發(fā) 展 技 術(shù) 毛 細(xì) 管 電 泳 芯 片 技 術(shù) PCR芯 片 技 術(shù) (PCR-Chip) 縮 微 芯 片 實(shí) 驗(yàn) 室 (lab-on-a-chip) 微 珠 芯 片 技 術(shù) (beadArray) 抗 體 和 蛋 白 質(zhì) 陣 列 技 術(shù) (Antibody and protein-array technology) 自 我 定 制 芯 片 技 術(shù) ( make your own chip) 血 氣 分 析 芯 片 毛 細(xì) 管 電 泳 芯 片 技 術(shù) Mathies最
21、早 報(bào) 道 毛 細(xì) 管 電 泳 芯 片 測 序 結(jié) 果 ,在 10分 鐘 內(nèi) 完 成 了 對 433個(gè) 堿 基 序 列 的 測 定 。 賓 夕 法 尼 亞 大 學(xué) Wilding等 成 功 地 利 用 毛 細(xì) 管電 泳 芯 片 分 離 了 用 于 診 斷 杜 鑫 -貝 克 肌 萎 縮 的多 條 DNA片 段 。 瑞 士 Ciba-Geigy公 司 和 加 拿 大 Alberta大 學(xué) 合作 利 用 玻 璃 毛 細(xì) 管 電 泳 芯 片 完 成 了 對 寡 核 苷 酸的 分 離 。 縮 微 芯 片 實(shí) 驗(yàn) 室 在 一 張 芯 片 上 完 成 樣 品 (如 血 液 、 組 織 等 )制 備 、化 學(xué)
22、 反 應(yīng) 、 檢 測 和 數(shù) 據(jù) 分 析 。 1998年 程 京 博 士 首 次 應(yīng) 用 LOC實(shí) 現(xiàn) 了 從 樣 品 制 備 到反 應(yīng) 結(jié) 果 顯 示 的 全 部 過 程 , 成 果 地 從 混 有 大 腸 桿菌 的 血 清 中 分 離 出 了 細(xì) 菌 。 含 有 加 熱 器 、 微 泵 微 閥 、 微 流 量 控 制 器 、 電 子 化學(xué) 和 電 子 發(fā) 光 探 測 器 的 芯 片 已 經(jīng) 問 世 。 也 已 出 現(xiàn)樣 品 制 備 、 化 學(xué) 反 應(yīng) 和 分 析 檢 測 部 分 結(jié) 合 的 芯 片 。 LOC與 衛(wèi) 星 傳 輸 和 網(wǎng) 絡(luò) 生 物 信 息 學(xué) 結(jié) 合 , 將 實(shí) 現(xiàn) 高通
23、量 、 一 體 化 和 移 動(dòng) 性 的 “ 未 來 型 掌 上 實(shí) 驗(yàn) 室 ”的 構(gòu) 想 。 抗 體 和 蛋 白 質(zhì) 陣 列 技 術(shù) 蛋 白 質(zhì) 組 學(xué) (protiomics)的 興 起 , 促進(jìn) 了 抗 體 和 蛋 白 質(zhì) 陣 列 技 術(shù) 的 發(fā) 展 。 Pareick Brown使 用 特 異 性 抗 體 微 矩 陣 ,測 定 了 細(xì) 胞 和 體 液 樣 本 中 數(shù) 千 種 不 同 的 蛋白 質(zhì) 。 Leuking等 采 用 蛋 白 質(zhì) 微 陣 列 技 術(shù) , 測 定了 10pg的 微 量 蛋 白 質(zhì) , 并 證 實(shí) 假 陽 性 極 低 。 乳 腺 癌 基 因 芯 片 Stanford
24、乳 腺 癌 微 矩 陣 (Perou et al.1999) 每 種 基 因 的 數(shù) 據(jù) 以 行 表 示 , 每 個(gè) 實(shí) 驗(yàn) 用列 表 示 。 顏 色 強(qiáng) 度 表 示 對 照 和 實(shí) 驗(yàn) cDNA的 比 率 。比 率 相 同 時(shí) 為 1。 結(jié) 果 為 紅 色 表 示 mRNA增 加 , 綠 色 表 示 減少 , 灰 白 色 表 示 缺 乏 。 兩 種 基 因 的 相 似 性 用 Pearson相 關(guān) 公 式 或Euclidian測 距 公 式 計(jì) 算 。 DNA微 矩 陣 分 析 軟 組 織 肉 瘤 表 達(dá)Kavine Maillard et al(1999) cDNAs進(jìn) 行 DNA表 達(dá)
25、矩 陣 , PCR產(chǎn) 物 包被 在 經(jīng) 賴 氨 酸 處 理 的 玻 片 上 , 用Cys3-和 Cys5-標(biāo) 記 的 cDNA進(jìn) 行 雜 交 ,洗 滌 后 用 Scanarray3000掃 描 儀 測 定矩 陣 , 表 達(dá) 數(shù) 據(jù) 儲 存 在 ACeDB數(shù) 據(jù) 庫中 , 根 據(jù) 數(shù) 據(jù) 表 達(dá) 類 型 區(qū) 分 不 同 的基 因 。 微 矩 陣 分 析 DNA和 蛋 白 表 達(dá)Holger Eickhoff et al.(1999) 根 據(jù) 已 有 的 序 列 數(shù) 據(jù) , 組 合 800000人 類 EST序列 , 已 重 矩 陣 了 38000克 隆 用 于 RNA表 達(dá) 分 析 ,克 隆 經(jīng)
26、 PCR擴(kuò) 增 后 共 價(jià) 結(jié) 合 于 玻 片 上 , 每 張 玻片 固 定 19200個(gè) 基 因 片 段 , 標(biāo) 記 人 組 織 RNAs與被 選 的 38000人 基 因 片 段 的 矩 陣 進(jìn) 行 雜 交 , 比較 健 康 與 疾 病 組 織 的 圖 象 , 用 軟 件 分 析 點(diǎn) 識 別和 點(diǎn) 定 量 。 使 用 寡 聚 核 苷 酸 鑒 定 新 的 cDNA克 隆 , 和 進(jìn) 入 表達(dá) 載 體 , 使 相 應(yīng) 蛋 白 能 直 接 表 達(dá) , 矩 陣 后 可 分析 蛋 白 -蛋 白 和 蛋 白 -DNA的 關(guān) 系 。 生 物 芯 片 相 關(guān) 儀 器 點(diǎn) 陣 儀 : 制 備 芯 片 。 點(diǎn)
27、 樣 針 分 為 實(shí) 心 和空 心 兩 種 , 點(diǎn) 樣 方 式 有 非 接 觸 噴 點(diǎn) 和 接觸 點(diǎn) 樣 兩 種 。 雜 交 儀 : 全 自 動(dòng) 完 成 調(diào) 節(jié) 、 加 探 針 、 漂洗 和 熱 循 環(huán) 的 雜 交 過 程 。 掃 描 儀 : 激 光 共 聚 焦 或 CCD直 接 成 像 分 析結(jié) 果 。 微 矩 陣 儀 器 介 紹 Q Bot Q Pix Q Array Q Pet Q Soft 2000 Q Bot 超 高 解 析 基 因 篩 選 暨 排 列 分 析 儀 。 基 因 菌 落 篩 選 (Colony Picking): 3500/h 基 因 排 列 打 點(diǎn) (Gridding
28、): 100000/h 基 因 復(fù) 制 (Replication): 9696,96384 基 因 重 新 排 列 (Re-Arraying): 正 確 的 基 因 置 復(fù) 制盤 基 因 微 矩 陣 排 列 (Micro-Arraying): 20000/片 全 自 動(dòng) 液 體 分 注 系 統(tǒng) (Liquid Handling):96針 ,注 液 量 1200l, 適 合 PCR產(chǎn) 物 。 分 析 軟 件 : 分 析 、 質(zhì) 控 、 上 網(wǎng) 。 環(huán) 境 控 制 : 紫 外 線 照 射 、 空 氣 濾 網(wǎng) 、 陽 極 處 理 鋁板 Q Pix 半 敞 開 式 基 因 篩 選 暨 排 列 分 析
29、儀 (經(jīng) 濟(jì) 型 ) 基 因 菌 落 篩 選 (Colony Picking): 3500/h 基 因 排 列 打 點(diǎn) (Gridding): 100000/h 基 因 復(fù) 制 (Replication): 9696,96384 基 因 重 新 排 列 (Re-Arraying): 正 確 的 基 因 置 復(fù) 制盤 基 因 微 矩 陣 排 列 (Micro-Arraying): 20000/片 分 析 軟 件 : 分 析 、 質(zhì) 控 、 上 網(wǎng) 環(huán) 境 控 制 : 紫 外 線 照 射 、 空 氣 濾 網(wǎng) 、 陽 極 處 理 鋁 板 Q Array 第 三 代 半 敞 開 式 基 因 微 矩 陣
30、 排 列 儀 。 基 因 微 矩 陣 排 列 (Microarrying): 同 時(shí) 處理 84片 玻 片 , 每 一 打 點(diǎn) 玻 片 分 4個(gè) 區(qū) 域 , 可安 排 不 同 的 矩 陣 排 列 。 可 選 16或 24針 座 。 儀 器 容 量 : 玻 片 84片 , 玻 片 架 6個(gè) , 384孔板 5盤 。 分 析 軟 件 : 分 析 、 質(zhì) 控 、 上 網(wǎng) 。 環(huán) 境 控 制 : 紫 外 線 照 射 、 空 氣 濾 網(wǎng) 、 陽 極處 理 鋁 板 。 自 動(dòng) 液 體 處 理 系 統(tǒng) 。 雜 交 儀 Affymetrix 640雜 交儀 : 溫 度 范 圍 : 0100C 探 針 用 量 : l 流 速 : 10ml/min 樣 本 區(qū) : 2.46.4cm 掃 描 儀 GenearrayTM掃 描 儀 : 激 光 : 氬 離 子 ,488nm 適 用 染 料 : 熒 光 素 、藻 紅 素 單 掃 描 時(shí) 間 : 4分 鐘 分 辨 率 : 3、 6、 9或24微 米
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