生物記憶反饋回路的動(dòng)力學(xué)行為大學(xué)畢業(yè)論文
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1、 本科生畢業(yè)論文 姓 名: 學(xué) 號(hào): 學(xué) 院: 理學(xué)院 專 業(yè): 光信息科學(xué)與技術(shù) 論文題目: 生物記憶反饋回路的動(dòng)力學(xué)行為 專 題: 指導(dǎo)教師: 職 稱: 2012年 05月 大學(xué)畢業(yè)論文任務(wù)書 學(xué)
2、院 理學(xué)院 專業(yè)年級(jí) 光信息科學(xué)與技術(shù)08級(jí) 學(xué)生姓名 任務(wù)下達(dá)日期:2012 年 1 月 3 日 畢業(yè)論文日期: 2012年 3 月 4 日至 2012年 6 月 10 日 畢業(yè)論文題目: 生物記憶反饋回路的動(dòng)力學(xué)行為 畢業(yè)論文專題題目: 畢業(yè)論文主要內(nèi)容和要求: 主要內(nèi)容:生物反饋是運(yùn)用儀器(通常用電子儀器)通過(guò)視覺(jué)或聽(tīng)覺(jué)信號(hào),揭示人體內(nèi)部正?;虍惓;顒?dòng)的方法。其目的在于,通過(guò)操縱那些在其它情況下意識(shí)不到或感覺(jué)不到的生理活動(dòng),以達(dá)到控制機(jī)體內(nèi)部活動(dòng)的目的。體內(nèi)的生理活動(dòng),比如心臟跳動(dòng)的快慢,一般是人們意識(shí)不到的,也難以隨意使之加快或減
3、慢。如果我們把心臟跳動(dòng)以一定的聲高來(lái)表示,就可以通過(guò)使信號(hào)變大或變小,來(lái)達(dá)到使心率加快或減慢的目的。通過(guò)這種方法,可以對(duì)心動(dòng)過(guò)速或心動(dòng)過(guò)緩進(jìn)行治療。這就是人們通常所說(shuō)的生物反饋。 主要要求: 1.通過(guò)文獻(xiàn)閱讀了解和掌握細(xì)胞生物反饋過(guò)程,了解生物反饋在生物體內(nèi)與刺激的關(guān)系; 2.了解常微分方程定態(tài)解的穩(wěn)定性分析;掌握隨機(jī)微分方程的解法; 3.了解系統(tǒng)的模型,以及模型所對(duì)應(yīng)的具體生物系統(tǒng); 4.能夠通過(guò)程序設(shè)計(jì)語(yǔ)言來(lái)分析和求解生物模型。 院長(zhǎng)簽字: 指導(dǎo)教師簽字: 摘 要 生物記憶是廣泛存在于各種生物體的不同子系統(tǒng)中的一種效應(yīng)
4、,各種生物記憶實(shí)現(xiàn)記憶的機(jī)制不同。本課題以一個(gè)包含兩蛋白的反饋回路為基礎(chǔ),通過(guò)回路模型的動(dòng)力學(xué)行為研究,來(lái)理解該系統(tǒng)中生物記憶實(shí)現(xiàn)的機(jī)制,以及各種因素對(duì)于生物記憶的影響。 在本文中我們首先建立了以生物記憶反饋回路為基礎(chǔ)的模型。通過(guò)對(duì)模型的求解計(jì)算,我們發(fā)現(xiàn)在不同程度的刺激下,生物體可以呈現(xiàn)出不同的記憶及反饋行為。通過(guò)選取合適的參數(shù)值得到了描述生物記憶反饋的模型。在此基礎(chǔ)上,我們給予生物體不同程度刺激,觀察在不同刺激下的生物記憶情況。通過(guò)模擬計(jì)算發(fā)現(xiàn)在不同程度的刺激下,生物記憶的不同。我們計(jì)算了系統(tǒng)的特征相干時(shí)間來(lái)描述系統(tǒng)在不同刺激和噪聲作用下的生物記憶。 關(guān)鍵詞:生物記憶反饋;噪聲;
5、刺激;穩(wěn)態(tài);動(dòng)力學(xué);回路模型 目 錄 1. 引言 1 1.1生物記憶及反饋 1 1.1.1什么是生物記憶 1 1.1.2什么是生物反饋(此節(jié)可刪除,相關(guān)內(nèi)容放到第一節(jié)) 1 1.1.3生物記憶對(duì)生物的重要作用 2 1.1.4建立生物記憶反饋模型(此節(jié)應(yīng)改為生物模型的綜述知識(shí),而不是具體介紹本文的模型,相關(guān)內(nèi)容可參考劉軒本科論文中關(guān)于生物模型的一些介紹,原來(lái)的內(nèi)容放到2.1節(jié)) 3 1.2微分方程數(shù)值計(jì)算方法(本節(jié)也不是要你介紹計(jì)算結(jié)果。而是介紹計(jì)算方法,內(nèi)容可參考我給你的博士論文的相關(guān)章節(jié)) 4 1.3 本文的主要內(nèi)容和安排 5 2.
6、簡(jiǎn)單生物反饋回路的記憶功能研究 5 2.1.反饋回路模型簡(jiǎn)介(模型方程應(yīng)該放在這里) 5 2.2模型的穩(wěn)態(tài)特征 8 2.3生物記憶的形成……………………………………………………………………………...8 3.噪聲對(duì)生物記憶功能影響………………………………………………………………………..9 3.1 有噪聲的生物記憶模型………………………………………………………………..9 3.2有噪聲的生物記憶模型(應(yīng)改為噪聲對(duì)生物記憶功能的影響)…………………………………………………………………12 C++語(yǔ)言程序………………………………………………………………………………...13 翻譯部
7、分 英文原文 22 中文譯文 29 致 謝 41 1. 引言 1.1生物記憶及反饋 1.1.1什么是生物記憶 生物記憶是人類心智活動(dòng)的一種,屬于心理學(xué)或腦部科學(xué)的范疇。記憶代表著一個(gè)人對(duì)過(guò)去活動(dòng)、感受、經(jīng)驗(yàn)的印象累積,有相當(dāng)多種分類,主要因環(huán)境、時(shí)間和知覺(jué)來(lái)分。在記憶形成的步驟中,可分為下列三種信息處理方式: 1.譯碼:獲得信息并加以處理和組合。 2.儲(chǔ)存:將組合整理過(guò)的信息做永久紀(jì)錄。 3.檢索:將被儲(chǔ)存的信息取出,回應(yīng)一些暗示和事件物記憶 1.1.2什么是生物反饋 生物反饋研究,是本世紀(jì)60年代由5個(gè)人發(fā)起的。倍斯馬吉安認(rèn)為:生物反饋
8、是運(yùn)用儀器(通常用電子儀器)通過(guò)視覺(jué)或聽(tīng)覺(jué)信號(hào),揭示人體內(nèi)部正?;虍惓;顒?dòng)的方法。其目的在于,通過(guò)操縱那些在其它情況下意識(shí)不到或感覺(jué)不到的生理活動(dòng),以達(dá)到控制機(jī)體內(nèi)部活動(dòng)的目的。體內(nèi)的生理活動(dòng),比如心臟跳動(dòng)的快慢,一般是人們意識(shí)不到的,也難以隨意使之加快或減慢。如果我們把心臟跳動(dòng)以一定的聲高來(lái)表示,就可以通過(guò)使信號(hào)變大或變小,來(lái)達(dá)到使心率加快或減慢的目的。通過(guò)這種方法,可以對(duì)心動(dòng)過(guò)速或心動(dòng)過(guò)緩進(jìn)行治療。這就是人們通常所說(shuō)的生物反饋。根據(jù)生物所起的作用是正向的(積極的或陽(yáng)性的)還是負(fù)向的(消極的或陰性的),可以把它分為正反饋和負(fù)反饋;根據(jù)反饋環(huán)節(jié)中是否有外感受器的參與,又可把它分為內(nèi)反饋和外反饋
9、。 生物反饋的研究,既有理論意義又有實(shí)用價(jià)值:它打破了傳統(tǒng)的學(xué)習(xí)理論認(rèn)為植物性神經(jīng)系統(tǒng)所支配的器官不能進(jìn)行學(xué)習(xí)、不能隨意控制的老框框,開(kāi)辟了“內(nèi)臟學(xué)習(xí)”的新領(lǐng)域;通過(guò)生物反饋訓(xùn)練,可以改變有機(jī)體的內(nèi)環(huán)境,改變神經(jīng)、循環(huán)、呼吸、消化等系統(tǒng)的工作狀態(tài),因此為治療多種疾患提供了新手段。生物反饋研究的早期,學(xué)者們對(duì)腦電α、腦電θ和感覺(jué)運(yùn)動(dòng)節(jié)律的反饋訓(xùn)練進(jìn)行了大量研究,又研究了心率反饋、血壓反饋、皮溫反饋、皮電反饋、肌電反饋等,以及它們?cè)谂R床上的實(shí)際應(yīng)用。其中以肌電反饋應(yīng)用最廣。 (1.1) 1.1.3生物記憶對(duì)生
10、物的重要作用 生物記憶是廣泛存在于各種生物體的不同子系統(tǒng)中的一種效應(yīng),各種生物記憶實(shí)現(xiàn)記憶的機(jī)制不同。本課題以一個(gè)包含兩蛋白的反饋回路為基礎(chǔ),通過(guò)回路模型的動(dòng)力學(xué)行為研究,來(lái)理解該系統(tǒng)中生物記憶實(shí)現(xiàn)的機(jī)制,以及各種因素對(duì)于生物記憶的影響。 1.1.4建立生物記憶反饋模型 利用物理知識(shí)把生物模型變?yōu)槲锢砟P?,在這個(gè)過(guò)程中需要用到一些物理公式和數(shù)學(xué)知識(shí)以及一些編程知識(shí)! 1.2微分方程數(shù)值計(jì)算方法 1.2.1相關(guān)計(jì)算的圖形 1.2.2進(jìn)行相關(guān)研究的方法 在本次論文中,主要應(yīng)用非線性物理學(xué),計(jì)算物理學(xué),統(tǒng)計(jì)物理學(xué)相關(guān)知識(shí)對(duì)于這個(gè)生物記
11、憶反饋回路的動(dòng)力學(xué)行為進(jìn)行研究。除此之外,采用C語(yǔ)言,F(xiàn)ortran等程序設(shè)計(jì)語(yǔ)言來(lái)分析和求解生物模型。最終通過(guò)回路模型的動(dòng)力學(xué)行為研究,來(lái)理解該系統(tǒng)中生物記憶實(shí)現(xiàn)的機(jī)制,以及各種因素對(duì)于生物記憶的影響。 在研究中所要用到的公式: (1) (2) (3) 1.2.3模型的建立及用到的知識(shí) 主要應(yīng)用非線性物理學(xué),計(jì)算物理學(xué),統(tǒng)計(jì)物理學(xué)相關(guān)知識(shí) 1.3 本文的主要內(nèi)容和安排 前面介紹了與本文研究對(duì)象生物記憶反饋回路的動(dòng)力學(xué)行為的相關(guān)背景知識(shí),從第一章開(kāi)始將介紹本文中所涉及到的具體處理問(wèn)題的
12、方法。第二章對(duì)計(jì)算有了更深刻的認(rèn)識(shí),以及提供了相關(guān)理論知識(shí)。第三章是本文的重點(diǎn),我們首先建立了生物記憶反饋回路的模型,在此基礎(chǔ)上給出了反饋回路動(dòng)力學(xué)的模型,并簡(jiǎn)單介紹了其中各個(gè)參數(shù)的意義。在此模型的基礎(chǔ)上,我們引入噪聲,研究在噪聲的影響下生物記憶規(guī)律,先計(jì)算了在無(wú)噪聲,有噪聲的條件下不同程度刺激生物記憶的大小程度。為了更清楚的表象混沌鈣離子振蕩系統(tǒng)中的相干共振行為,我們計(jì)算了定量描述相干共振的特征相干時(shí)間隨加入噪聲的變化規(guī)律。第四章是對(duì)本文所做的工作和得出的結(jié)論的總結(jié)。 2. 簡(jiǎn)單生物反饋回路的記憶功能研究 2.1反饋回路模型簡(jiǎn)介 在此
13、圖中,S指的是給予生物體一個(gè)刺激,而后產(chǎn)生了一個(gè)記憶,之后便有了一個(gè)輸出信號(hào)。同時(shí)輸出信號(hào)會(huì)給AB生物體一個(gè)反饋?zhàn)饔谩? 2.2模型的穩(wěn)態(tài)特征 在分析模型的穩(wěn)態(tài)特征時(shí),我們要注意到只有當(dāng)給予生物體的刺激處于雙穩(wěn)態(tài)區(qū)間時(shí),生物體才有記憶功能。在此次論文中,通過(guò)研究我們發(fā)現(xiàn)給予生物體刺激處于0.23到0.29之間時(shí),生物體的記憶功能才比較明顯。 2.3生物記憶的形成 生物記憶的形成,在生物學(xué)上是一個(gè)復(fù)雜的過(guò)程。我們這里把它轉(zhuǎn)化為物理模型來(lái)研究,就簡(jiǎn)單了很多。當(dāng)給予生物體一個(gè)刺激時(shí),生物體就會(huì)產(chǎn)生不同的反應(yīng)。隨著刺激的增強(qiáng),生物體的記憶效
14、果會(huì)有不同。同時(shí)在增加噪聲的情況下,生物體記憶也會(huì)有不同表現(xiàn),并且噪聲不同時(shí),生物體記憶也不同。 3.噪聲對(duì)生物記憶功能影響 給予生物較小刺激時(shí)的記憶 在下圖中,我們給予生物一個(gè)較小的刺激,在沒(méi)有噪聲的影響下,我們可以看到生物隨著時(shí)間的變化。在圖中在5432s后,但刺激撤銷后,生物依然存在記憶。 給予生物較大刺激時(shí)的記憶 在沒(méi)有噪聲影響的前提下,我們給予生物一個(gè)較大刺激,這時(shí)我們可以看到生物記憶隨著時(shí)間的變化。 給予生物較大刺激時(shí)的記憶 在沒(méi)有噪聲影響的前提下,我們給予生物一個(gè)較大刺激,這時(shí)我們可以看到生
15、物記憶隨著時(shí)間的變化。 3.2有噪聲的生物記憶 噪聲比較小時(shí)的生物記憶 下面,我們主要分析在有噪聲的情況下,生物記憶隨著時(shí)間的變化。首先我們限制了刺激大小,給予生物體一個(gè)噪聲比較小的環(huán)境。我們?cè)O(shè)置beta=0.01.設(shè)置刺激s=0.02.發(fā)現(xiàn)生物體是有記憶的。 噪聲中等的生物記憶 下面呢,我們給予生物體一個(gè)噪聲中等的環(huán)境,而刺激大小不變,研究生物的記憶狀況。 在次圖中,我們?cè)O(shè)置噪聲參數(shù)beta=0.02,而刺激大小不變,為s=0.2,我們發(fā)現(xiàn)了在5200s之
16、后生物體是有記憶的。 噪聲較大的生物記憶: 當(dāng)給予生物體一個(gè)較大的噪聲環(huán)境時(shí),我們可以看到生物體依然具有記憶功能。并且能發(fā)現(xiàn)生物體的記憶隨時(shí)間的變化。再此圖中,我們?cè)O(shè)置噪聲參數(shù)為0.04,設(shè)置刺激參數(shù)為s=0.2,發(fā)現(xiàn)生物體這時(shí)也是有記憶的。 噪聲最大的生物記憶 下面主要是在刺激不變的前提下給予生物體一個(gè)很大的噪聲環(huán)境,可以看到這時(shí)生物體基本上沒(méi)有了記憶功能!在下面圖形中,我們把噪聲參數(shù)設(shè)置為beta=0.06,可以發(fā)現(xiàn)生物體基本上已經(jīng)
17、沒(méi)有了記憶功能!在圖中我們明顯看到從零時(shí)刻起,噪聲就達(dá)到了最大值。所以這是生物已經(jīng)失去了記憶功能!
噪聲強(qiáng)度與時(shí)間差的關(guān)系
在這個(gè)論文中,我們利用origin 軟件可以得到噪聲強(qiáng)度的數(shù)字表格,然后把它們畫圖,整理可以得倒如下圖形:
3.相關(guān)計(jì)算機(jī)c++程序
沒(méi)有噪聲時(shí)生物記憶反饋回路的程序:
#include
18、.141592654 // 參數(shù)定義 double lamda=1.12,s=0.25,k1=0.1,k2=0.3,k=0.5,kmin=0.01,kon=1,koff=0.3; double kminout=0.003,taua=2,taub=200; double time_step,real_time; double a,b,cout,a0,b0,cout0; FILE *fp0; double *m; double aright(double a0, double b0, double cout0) { double result; result=((k
19、1*s+k2*cout*cout*cout*cout/(cout*cout*cout*cout+k*k*k*k)) *(1-a)-lamda*a+kmin)/taua; return result; } double bright(double a0, double b0, double cout0) { double result; result=((k1*s+k2*cout*cout*cout*cout/(cout*cout*cout*cout+k*k*k*k))
20、 *(1-b)-lamda*b+kmin)/taub; return result; } double coutright(double a0, double b0, double cout0) { double result; result=kon*(a+b)*(1-cout)-koff*cout+kminout; return result; } int main() { long i=0,j=0,k1=0; time_step=0.001; real_t
21、ime=0.0; //D2=0.1; fp0=fopen("data.dat","wb"); //D1=100; a=0.1;b=0.05;cout=0.1; k1=0; real_time=0.0; while(real_time<=20000.0) { if(real_time>=4000&&real_time<=6200)s=0.5; else s=0.20; a0=a;b0=b;cout0=cout; a=a0+time_step*aright(a0,b0,cout0); b=b0+time_step*brig
22、ht(a0,b0,cout0);
cout=cout0+time_step*coutright(a0,b0,cout0);
real_time+=time_step;
if(k1%4000==0)fprintf(fp0,"%f %f\n",real_time,cout);
k1++;
}
return 0;
}
有噪聲時(shí)的生物記憶反饋回路程序:
#include
23、 #define PI 3.141592654 // 參數(shù)定義 double lamda=1.12,s=0.2,k1=0.1,k2=0.3,k=0.5,kmin=0.01,kon=1,koff=0.3; double kminout=0.003,taua=2,taub=200; double time_step,real_time; double a,b,cout,a0,b0,cout0,rd1,rd2,rd3,rd4,alpha,beta; FILE *fp0; double *m; double ran1(long *idum) { int const IA=1
24、6807; long const IM=2147483647; double const AM=1.0/IM; long const IQ=127773; int const IR=2836; int const NTAB=32; long const NDIV=1+(IM-1)/NTAB; double const EPS=1.2e-7; double const RNMX=1.0-EPS; int j; long k; static long iy=0; static long
25、 iv[NTAB];
double temp;
if (*idum <=0 || !iy) {
if (-(*idum)<1) *idum=1;
else *idum =-(*idum);
for (j=NTAB+7; j>=0; j--) {
k=(*idum)/IQ;
*idum=IA*(*idum-k*IQ)-IR*k;
if (*idum<0) *idum+=IM;
if (j 26、(*idum-k*IQ)-IR*k;
if (*idum<0)*idum+=IM;
j=iy/NDIV;
iy=iv[j];
iv[j]=*idum;
if ((temp=AM*iy)>RNMX) return RNMX;
else return temp;
}
double ran2(long *idum1)
{
long const IM1=2147483563;
long const IM2=2147483399;
double const AM=1.0/IM1;
long const IMM1=IM1-1;
int co 27、nst IA1=40014;
int const IA2=40692;
int const IQ1=53668;
int const IQ2=52774;
int const IR1=12211;
int const IR2=3791;
int const NTAB=32;
long const NDIV=(1+IMM1/NTAB);
double const EPS=1.2e-7;
double const RNMX=1.0-EPS;
int j;
long k;
28、static long idum2=123456789;
static long iy=0;
static long iv[NTAB];
double temp;
if (*idum1<=0)
{
if (-(*idum1)<1)*idum1=1;
else *idum1=-(*idum1);
idum2=(*idum1);
for (j=NTAB+7; j>=0; j--)
{
k=(*idum1)/IQ1;
*idum1 =IA1*(*idum1-k*IQ1)-k*IR1;
if (*idum1 29、<0) *idum1+=IM1;
if (j 30、f ((temp=AM*iy)>RNMX) return RNMX;
else return temp;
}
double aright(double a0, double b0, double cout0)
{
double result;
result=((k1*s+k2*cout*cout*cout*cout/(cout*cout*cout*cout+k*k*k*k))
*(1-a)-lamda*a+kmin)/taua;
return result;
}
dou 31、ble bright(double a0, double b0, double cout0)
{
double result;
result=((k1*s+k2*cout*cout*cout*cout/(cout*cout*cout*cout+k*k*k*k))
*(1-b)-lamda*b+kmin)/taub;
return result;
}
double coutright(double a0, double b0, double cout0)
{
double 32、result;
result=kon*(a+b)*(1-cout)-koff*cout+kminout;
return result;
}
int main()
{
long i=0,j=0,k1=0;
long *idum1;
long *idum2;
long *idum3;
long *idum4;
long i1=100;
long i2=12;
long i3=1011;
long i4=20;
i1=10+21;
i2=12+10*21;
i3=101+21*5;
33、i4=2+21*100;
idum1=&i1;
idum2=&i2;
idum3=&i3;
idum4=&i4;
time_step=0.001;
real_time=0.0;
//D2=0.1;
fp0=fopen("data.dat","wb");
//D1=100;
beta=0.02;//噪聲強(qiáng)度
a=0.1;b=0.05;cout=0.1;
k1=0;
real_time=0.0;
while(real_time<=20000.0)
{
if(real_time>=4000&&r 34、eal_time<=6200)s=0.5;
else s=0.4;
a0=a;b0=b;cout0=cout;
// rd1=sqrt(-4.0*alpha*time_step*log(ran1(idum1)))*cos(2.0*PI*ran2(idum2));
// rd2=sqrt(-4.0*alpha*time_step*log(ran1(idum3)))*cos(2.0*PI*ran2(idum4));
rd3=sqrt(-4.0*beta*time_step*log(ran1(idum1)))*cos(2.0*PI*ran2(idum2));
rd4= 35、sqrt(-4.0*beta*time_step*log(ran1(idum3)))*cos(2.0*PI*ran2(idum4));
a=a0+time_step*aright(a0,b0,cout0)
// +(k1/(taua))*(1-a)*rd1-(k1/(2*taua))*(1-a)*rd1*rd1
-a*rd3/taua+0.5*a*rd3*rd3/taua;
b=b0+time_step*bright(a0,b0,cout0);
// +(k1/(taub))*(1-a)*rd2-(k1/(2*taub))*(1-a)*rd2*rd 36、2
-b*rd4/taub+0.5*b*rd4*rd4/taub;
cout=cout0+time_step*coutright(a0,b0,cout0);
real_time+=time_step;
if(k1%4000==0)fprintf(fp0,"%f %f\n",real_time,cout);
k1++;
}
return 0;
}
4. 總結(jié)
生物記憶反饋回路是生物研究中的重要一部份。在這些細(xì)胞結(jié)構(gòu)中自由鈣離子擔(dān)任響應(yīng)一系列刺激的第二信使。因此它們通過(guò)影響酶的功能以及基因表達(dá)來(lái)直接控制生物體的一些功能。研究細(xì)胞中 37、鈣離子的濃度變化規(guī)律對(duì)于了解生物細(xì)胞的生命活動(dòng)具有很重的意義。 本文通過(guò)建立的細(xì)胞內(nèi)鈣離子振蕩模型,進(jìn)行了相關(guān)的計(jì)算觀察到:
(1)模型選取不同的參數(shù)時(shí),生物記憶反應(yīng)也不同。
(2)在研究噪聲對(duì)生物記憶作用時(shí)發(fā)現(xiàn)在不同的噪聲作用下生物記憶程度不同,在較大噪聲時(shí)生物記憶最好。
(3)利用噪聲大小變化,而刺激大小不變,對(duì)生物記憶定量實(shí)驗(yàn),在不同噪聲作用下的規(guī)則性時(shí),發(fā)現(xiàn)生物記憶隨噪聲變化的曲線在某一中等噪聲條件下出現(xiàn)峰值,表明噪聲對(duì)生物記憶影響比較大。
我們可以看到,在本次論文中,主要應(yīng)用非線性物理學(xué),計(jì)算物理學(xué),統(tǒng)計(jì)物理學(xué)相關(guān)知識(shí)對(duì)于這個(gè)生物記憶反饋回路的動(dòng)力學(xué)行為進(jìn)行研究。除此之外, 38、采用C語(yǔ)言,F(xiàn)ortran等程序設(shè)計(jì)語(yǔ)言來(lái)分析和求解生物模型。最終通過(guò)回路模型的動(dòng)力學(xué)行為研究,我理解了該系統(tǒng)中生物記憶實(shí)現(xiàn)的機(jī)制,以及各種因素對(duì)于生物記憶的影響。
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43、011907—
英文原文
中文譯文
相通的雙反饋回路可以提高魯棒性的隨機(jī)性和持久性記憶
保羅A甲氨蝶呤,,和約翰拜恩
神經(jīng)生物學(xué)和解剖學(xué)系,凱克中心學(xué)習(xí)和記憶的神經(jīng)生物學(xué),
美國(guó)德克薩斯 休斯敦德克薩斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院,郵政信箱20708,休斯敦77225
2008年6月19;一月 2009修訂稿收到9;4日2009出版
多個(gè)相互關(guān)聯(lián)的積極反饋回路形狀的刺激反應(yīng)的各種生化系統(tǒng),如細(xì)胞周期或細(xì)胞內(nèi)鈣釋放。最近的研究與簡(jiǎn)化模型確定了2優(yōu)點(diǎn)是耦合快速和慢速反饋回路。這雙結(jié)構(gòu)使快速反應(yīng) 44、而增強(qiáng)抗性反應(yīng)和雙穩(wěn)態(tài)刺激噪聲。我們現(xiàn)在發(fā)現(xiàn),1雙時(shí)間結(jié)構(gòu)同樣賦予抵抗內(nèi)部聲由于分子數(shù)的波動(dòng),和2模型變種篡改耦合,更好地代表一些特定的生化系統(tǒng),共享所有以上優(yōu)勢(shì)。我們還開(kāi)發(fā)了一種類似雙穩(wěn)態(tài)模型與耦合快速自動(dòng)活化循環(huán)慢回路。該模型的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)提出了積極的反饋建議中發(fā)揮作用的長(zhǎng)期突觸增強(qiáng)長(zhǎng)時(shí)程增強(qiáng)。具有快速反應(yīng)和抗噪音也存在于這個(gè)自身活化模型。實(shí)證,長(zhǎng)時(shí)程增強(qiáng)開(kāi)發(fā)抗逆轉(zhuǎn)了1小時(shí)模型顯示,這種阻力可能由于增加了大量的突觸蛋白激酶參與積極的反饋。
簡(jiǎn)介
許多生物系統(tǒng)有積極的反饋為核心調(diào)控元件產(chǎn)生陡峭,甚至swit chlike,反應(yīng)分級(jí)刺激1–6。充分研究案件包括肌醇1 , 4 , 5-三磷酸 45、肌醇,誘導(dǎo)釋放鈣離子從內(nèi)質(zhì)網(wǎng)爾7,觸發(fā)細(xì)胞有絲分裂8、9,和成熟的爪蟾卵母細(xì)胞11。通常,雙正反饋回路相輔相成其他。例如,快速積極的反饋,鈣提高自身釋放雌是由鋼筋緩慢上升,細(xì)胞內(nèi)鈣離子涌入由于質(zhì)膜。涌入介導(dǎo)鈣池操縱的鈣通道激活以下枯竭的鈣離子在。多積極的反饋循環(huán)已假設(shè)有助于形成和維持長(zhǎng)時(shí)程增強(qiáng)長(zhǎng)時(shí)程增強(qiáng)突觸聯(lián)系。同樣,在無(wú)脊椎動(dòng)物,多個(gè)積極的反饋循環(huán)已被假定為長(zhǎng)期促進(jìn)突觸乳鐵蛋白14。在軟體動(dòng)物海兔,一個(gè)積極的反饋回路涉及轉(zhuǎn)錄因子發(fā)揮重要作用乳鐵蛋白編號(hào)15。最近的研究使用簡(jiǎn)單,通用模型研究如何生物體可能獲得優(yōu)勢(shì)利用加強(qiáng)積極的反饋循環(huán)。布蘭曼等人。2考慮一種雙穩(wěn)態(tài)模型中,物種和乙合作,提高生產(chǎn) 46、的輸出相加物種的法院。電容反饋增加生產(chǎn)一個(gè)和B的情況下一個(gè)過(guò)程,小的時(shí)間為適應(yīng)變化,法院,和二循環(huán)緩慢,以緩慢的時(shí)間常數(shù)為二調(diào)整法庭,兩者的優(yōu)勢(shì)被發(fā)現(xiàn)。快速循環(huán),使快速反應(yīng), 與法院迅速上升的刺激后。緩慢的循環(huán)增加反應(yīng)振幅和魯棒性形狀。其緩慢的時(shí)間常數(shù)過(guò)濾刺激波動(dòng),減少波動(dòng)計(jì)算。這樣一個(gè)fast-loop–slowloop安排被稱為一個(gè)雙系統(tǒng)。以下刺激去除,緩慢關(guān)閉退出生產(chǎn)觀察這一單穩(wěn)態(tài)模型,速度是由慢時(shí)間常數(shù)的可變。張等人。16研究了類似,雙模式展品雙穩(wěn)態(tài)和滯后由于較強(qiáng)的正反饋從法院的合成和B,法院仍然升高后刺激終止。這種雙穩(wěn)態(tài)模型是一個(gè)開(kāi)關(guān),一個(gè)簡(jiǎn)短的刺激可以引起持久狀態(tài)的變化。快速積極的 47、反饋回路是再次發(fā)現(xiàn)驅(qū)動(dòng)快速刺激的反應(yīng),和緩慢的循環(huán)的穩(wěn)定增加基底和高架狀態(tài)對(duì)刺激的波動(dòng)。在基因調(diào)控,雙穩(wěn)態(tài)交換機(jī)已假設(shè)轉(zhuǎn)換成簡(jiǎn)短的刺激持久狀態(tài)的改變,如細(xì)胞分化4或持久性基因的激活6,17。在上述模型,而加在一起增加生產(chǎn)分值。類似的通用模型可以描述聯(lián)鎖反饋回路與其他拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)。比如說(shuō)呢。甲乙會(huì)加倍增加生產(chǎn)分值。此乘法情況似乎更好地描述了一些生化系統(tǒng)看見(jiàn)討論。本研究探討如何在乘法生產(chǎn)法院的影響刺激的反應(yīng)。此外,本研究探討魯棒性的刺激的反應(yīng)和穩(wěn)定狀態(tài)對(duì)內(nèi)部系統(tǒng)噪聲隨機(jī)波動(dòng)的拷貝數(shù)的分子。內(nèi)部噪聲可以破壞雙穩(wěn)系統(tǒng),造成國(guó)家之間的隨機(jī)跳躍18,6。布蘭曼等人。不檢查是否有雙建筑賦予抵抗內(nèi)部噪聲。添加劑和 48、乘法生產(chǎn)縣分享常見(jiàn)的“收斂”拓?fù)鋱D1一,甲乙收斂生產(chǎn)清點(diǎn)。
我們還研究了動(dòng)態(tài)的一種疾病,但類似的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu),快速變第—圖1。色在線動(dòng)力學(xué)耦合的快速和慢速的積極反饋回路。一示意圖的耦合模型布蘭曼等人。2,張等人。16。速度的合成“輸出”是成正比的,“輸出”反哺提高合成一個(gè)與夏令時(shí)間常數(shù),和提高合成與緩慢的時(shí)間常數(shù)B圖還介紹了耦合乘法7情商。乙反應(yīng)一個(gè)刺激脈沖模式的均衡器。1–3輸出合成取決于+乙或模型的情商。1,2,和7輸出的合成取決于刺激振幅參數(shù)是的零直到=6.7分鐘,此時(shí)的設(shè)置為1.5或2.5。在=15分鐘的重置為零。噪聲是高斯刺激總是與標(biāo)準(zhǔn)偏差為0.15和更新時(shí)間步驟1號(hào)模型參數(shù)的 49、環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。1–37和情商。標(biāo)準(zhǔn)值后提高了其自身的形成和一慢變量B乙方進(jìn)一步增強(qiáng)形成的這種“自動(dòng)活化”拓?fù)鋭?dòng)機(jī)是積極的反饋的假設(shè)作出貢獻(xiàn)長(zhǎng)時(shí)程增強(qiáng)和/或乳鐵蛋白,其中具體激酶CaM KII,蛋白激酶提高自身的活動(dòng)直接或間接地。一些假定循環(huán)參與長(zhǎng)時(shí)程增強(qiáng)或乳鐵蛋白,依賴激酶磷酸化和激活,可能有更多的快速時(shí)間常數(shù)比其他循環(huán)依賴在翻譯和轉(zhuǎn)錄看到結(jié)果與討論循環(huán)詳情。因此,這種自動(dòng)活化新型雙時(shí)間??熳兞繉?duì)應(yīng)的水平的積極激酶和變對(duì)應(yīng)水平的總蛋白。模型的布蘭曼等人。2,張等人。
反饋修改以便與繁殖
我們發(fā)現(xiàn),雙建筑了賦予抗刺激噪聲。下列刺激,無(wú)論是快或慢打開(kāi)清點(diǎn)生產(chǎn)能獲得,取決于參數(shù)。該模型 50、的張等人。16,魯棒性增強(qiáng)的內(nèi)部噪聲雙體系結(jié)構(gòu)。作為一個(gè)回路時(shí)間常數(shù)增加,平均所需時(shí)間的分子數(shù)波動(dòng)的破壞穩(wěn)定狀態(tài)迅速增加。與自身活化模型的優(yōu)點(diǎn),一快速對(duì)刺激的反應(yīng),和乙電阻的雙穩(wěn)態(tài)刺激噪聲的再次出現(xiàn)。魯棒性的內(nèi)部噪聲提高了慢回路。下面簡(jiǎn)要規(guī)定激酶激活,總蛋白量提高到一個(gè)新的高原,在那里只有一個(gè)穩(wěn)定的,高,溶液激酶活性。隨后簡(jiǎn)短的刺激可以不誘導(dǎo)狀態(tài)過(guò)渡到低激酶活性。這些動(dòng)態(tài)提出一個(gè)解釋發(fā)展性長(zhǎng)時(shí)程增強(qiáng)突觸傳遞去看討論。
方法
數(shù)值方法
模擬不明確,外部噪聲源無(wú)花果。2和5向前歐拉方法用于整合微分方程,一個(gè)時(shí)間步長(zhǎng)為5毫秒。仿真驗(yàn)證了進(jìn)一步的時(shí)間步長(zhǎng)的減少并沒(méi)有顯著提高精度。為了進(jìn)一步驗(yàn)證的 51、準(zhǔn)確性,
模擬圖5乙重復(fù)使用二階
龍格-庫(kù)塔積分法19。無(wú)顯著性差異觀察。之前的任何刺激,變量值確定了平衡的至少一個(gè)模擬一天,建立穩(wěn)態(tài)濃度水平或分子數(shù)字的。再平衡并沒(méi)有顯著改變這些水平。該模型是在爪哇和編程模擬的奔騰3微機(jī)69。分岔分析研究了穩(wěn)態(tài)水平一個(gè)變量,乙,法院取決于力量恒定應(yīng)用刺激,增加生產(chǎn)速度的matcont分岔軟件使用。
模擬刺激噪聲和隨機(jī)波動(dòng)
在拷貝數(shù)刺激噪聲進(jìn)行了模擬,大大在張等鋁。16。高斯白噪聲條件均值為零是添加到確定性的刺激變量。標(biāo)準(zhǔn)的偏差為15%–20%刺激振幅,具體值中的文字或圖例。波動(dòng)帶的負(fù)面價(jià)值重置秒=0。常微分方程方程被用來(lái)與嘈雜的刺激詞。算法的b 52、ox-mueller19產(chǎn)生高斯術(shù)語(yǔ)。每個(gè)時(shí)間步長(zhǎng),噪音被更新。噪聲長(zhǎng)期的形式= s 0 +?2在U因?yàn)?是哪里你應(yīng)該和均勻分布的隨機(jī)數(shù)。一個(gè)一點(diǎn)不討論布蘭曼等人?;?張等。16是波動(dòng)幅度為模型變量取決于所選擇的時(shí)間步長(zhǎng)之間的更新噪聲長(zhǎng)期。產(chǎn)量顯著波動(dòng)的快速變一但不是在慢變量,噪聲時(shí)間步雙反饋回路,相對(duì)較小的時(shí)間常數(shù),但不相對(duì)于時(shí)間常數(shù)A圖1乙,噪音時(shí)間是1秒,滿足這一條件。
隨機(jī)模擬,波動(dòng)的拷貝數(shù)一,二,和計(jì)算模擬與吉萊斯皮演算法。該算法變步長(zhǎng),并在每一時(shí)間步,一個(gè)反應(yīng)的發(fā)生。什么類型的反應(yīng)發(fā)生的概率是隨機(jī)確定的,每個(gè)反應(yīng)式比例的確定性率表達(dá)。為進(jìn)一步細(xì)節(jié)見(jiàn)吉萊斯皮20 , 2 53、1。在均衡器。1–9,每學(xué)期的右手邊對(duì)應(yīng)于一個(gè)不確定性的反應(yīng)速率。這些比率被用來(lái)直接在吉萊斯皮算法。隨機(jī)模擬,分子數(shù)量規(guī)模的使用量的因素。增加對(duì)應(yīng)數(shù)量不斷增加,同時(shí)保持平均拷貝數(shù)每單位體積相同。zeroorder速率常數(shù),如基底率合成一個(gè)分子,乘以,如米凱利斯或常數(shù)。一階速率常數(shù)是不改變。二階速率常數(shù)除以。固定上界為分子數(shù)量乘以。有單位米?轉(zhuǎn)換成1濃度的分子數(shù)。參見(jiàn)圖傳說(shuō)中的具體細(xì)節(jié)。
結(jié)果雙時(shí)間,乘法的積極反饋展品刺激噪聲電阻和可變的反應(yīng)動(dòng)力學(xué)該模型的布蘭曼等人。2,張等人。16圖式在圖1一。該方程如下:布蘭曼等人。2今后mod-b05表示,3在法院被視在關(guān)閉的分值,并較低的狀態(tài) 54、mod-b05。為mod-b05-mult,其較低的狀態(tài)接近0,只有小波動(dòng)計(jì)算的觀察。因此,模型展覽抗刺激時(shí)的噪音我們正接近其邊界值0或1。
在圖1乙,mod-b05展品快速打開(kāi)的刺激。反饋回路中產(chǎn)快速時(shí)間常數(shù)=1而循環(huán)中退出激活生產(chǎn)緩慢乙=100??焖僬T導(dǎo)一個(gè)刺激驅(qū)動(dòng)的快速轉(zhuǎn)變的法院。刺激后清除,一個(gè)迅速下降 任然很高,保持高標(biāo)準(zhǔn)輸出。我們慢慢地返回其衰變基礎(chǔ)價(jià)值。布蘭曼等人。2建議mod-b05-mult要表現(xiàn)出相反的動(dòng)態(tài)mod-b05。與mod-b05-mult,緩慢打開(kāi)一個(gè)刺激脈沖應(yīng)其次是快速關(guān)閉后,刺激。在圖1乙,為mod-b05-mult和=1.5,雙相打開(kāi)我們看到最 55、初的緩慢增加=7分鐘到10分鐘表示圖1中的乙,其次是迅速增加。對(duì)于一個(gè)
更大的刺激=2.5,我們看到更快的增長(zhǎng)。因此,為mod-b05-mult,動(dòng)力學(xué)計(jì)算感應(yīng)變化大大的刺激。因?yàn)楦袘?yīng)速度快強(qiáng)烈的刺激,這些動(dòng)力學(xué)是不一般的對(duì)面
對(duì)快速打開(kāi)我們看到mod-b05。然而,該關(guān)閉縣刺激后持續(xù)快速的去除。圖2說(shuō)明了一個(gè)分岔圖的雙穩(wěn)態(tài)為mod-z07和mod-z07-mult。對(duì)于每一個(gè)圖表+乙為mod-z07,一乙mod-z07-mult有一系列刺激強(qiáng)度支撐穩(wěn)定的解決方案的濃度對(duì)法院,一個(gè),并為每一圖,雙穩(wěn)態(tài)一系列的雙膝之間,或唱片極限點(diǎn)。本上部和
下部的穩(wěn)定狀態(tài)穩(wěn)定的小電容擾動(dòng)和分離的一個(gè)不穩(wěn) 56、定的中間穩(wěn)定狀態(tài)。mod-z07-mult傾向于支持更廣范圍的雙穩(wěn)態(tài)。研究性的上部和下部穩(wěn)定狀態(tài)刺激噪聲,mod-z07和mod-z07-mult受到高斯噪聲刺激。平均值的0.14在雙穩(wěn)態(tài)區(qū)域圖2一,該標(biāo)準(zhǔn)偏差為0.15。
雙反饋回路授予抗刺激響應(yīng)內(nèi)部隨機(jī)噪聲隨機(jī)波動(dòng)分子復(fù)制號(hào)碼是無(wú)處不在的內(nèi)部噪聲在生物系統(tǒng)。一雙結(jié)構(gòu)賦予抵抗這種噪音?我們審查是否穩(wěn)態(tài)mod-z07是強(qiáng)大的內(nèi)部噪聲平均分子數(shù)100–300。吉萊斯皮算法是用來(lái)方法。平均分子數(shù)成比例的變化體積因子。圖2乙說(shuō)明,=400,上下穩(wěn)定狀態(tài)是穩(wěn)定的內(nèi)部噪聲。本平均分值”的時(shí)間當(dāng)然是一般的刺激反應(yīng)超過(guò)20模擬。在每個(gè)模擬,是在其基 57、礎(chǔ)值,0.1=33分鐘,是增加0.5回,0.1=40分鐘=0.5的對(duì)雙穩(wěn)態(tài)范圍的情商。4–6。因此,本新型過(guò)渡到上穩(wěn)定狀態(tài)。在所有20個(gè)模擬,該系統(tǒng)開(kāi)始在一個(gè)穩(wěn)定的,波動(dòng)的狀態(tài)下,結(jié)束在一個(gè)穩(wěn)定的較高境界。然而,穩(wěn)定的狀態(tài)得到了一個(gè)快速循環(huán)和慢乙環(huán)時(shí)間過(guò)程中,法院和較慢的時(shí)間過(guò)程中,=2,乙=200的和兩個(gè)循環(huán)快速疊加時(shí)間過(guò)程乙速度波動(dòng),=乙=2。因此,這些模擬沒(méi)有表明一個(gè)緩慢二環(huán)路授予額外的穩(wěn)定性。穩(wěn)定的穩(wěn)態(tài)作為一個(gè)功能的乙探討此外,模擬相似在張等人。16。mod-z07初始化的低狀態(tài)。一個(gè)常數(shù),相對(duì)較低的刺激適用=0.14。分岔分析表明,一個(gè)穩(wěn)定的上國(guó)家存在的這種價(jià)值號(hào)為樂(lè)團(tuán)1000模擬, 58、時(shí)間演化的部分系統(tǒng)圖2。色在線分叉模型的張等人。16。一分岔圖的雙穩(wěn)態(tài)變種的模型圖1的一。穩(wěn)定的國(guó)家的法院是追查作為一個(gè)功能的一個(gè)恒定值S方程4–6與標(biāo)準(zhǔn)值被用來(lái)計(jì)算“+”曲線。4,5,和7用于“”曲線。“唱片”是指一個(gè)極限點(diǎn)這一穩(wěn)定狀態(tài)消失。參數(shù)標(biāo)準(zhǔn)值。
乙穩(wěn)態(tài)的模型,張等人。16保存內(nèi)部隨機(jī)噪聲。方程4–6使用。體積因子=400。選擇之前,所有參數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)價(jià)值只有在=1.2米–1–1,kmin =0.005米,kmin=0.001的1?。零級(jí)速率常數(shù)kmin,kmin出和山常數(shù)乘以。上界的一個(gè),乙,和縣,這是1式。4–6,乘以。本二階速率常數(shù)插分。雙穩(wěn)態(tài)一快速2和乙型慢200秒。 59、該模型是在初始化的下?tīng)顟B(tài)=0.1。在=33分鐘,是增加至0.5,7 min新型過(guò)渡到上穩(wěn)定狀態(tài)。法院的時(shí)間當(dāng)然是在20個(gè)模擬。乙型肝炎,兩年的時(shí)間課程表明。時(shí)間課程乙顯示乙型慢200和乙快2秒。丙模擬過(guò)程中的時(shí)間波動(dòng)引起的逃離較低的狀態(tài)的狀態(tài)。每次課代表進(jìn)化該部分ftrans模擬,過(guò)境,至少一次上的狀態(tài),一個(gè)樂(lè)團(tuán)1000模擬。模型參數(shù)在乙除了不同乙。甲氨蝶呤,百特拜恩物理評(píng)論,79,031902,2009031902—經(jīng)歷了一個(gè)自發(fā)的,波動(dòng)引起的過(guò)渡上州之后。在一個(gè)小時(shí)的時(shí)間尺度,這分?jǐn)?shù)指數(shù)上升到1ftrans。圖2丙地塊課程的時(shí)間ftrans作為一個(gè)功能的時(shí)間常數(shù)B乙快2或中間20,ftra 60、ns相對(duì)提高快點(diǎn)。但對(duì)較大的值,乙,增加ftrans慢得多,這表明大量增加穩(wěn)定的狀態(tài)下在補(bǔ)充組模擬,與=0.14和初始化分子數(shù)字上的狀態(tài),穩(wěn)定上的狀態(tài)也增加了乙未顯示。因此,這些樂(lè)團(tuán)模擬成功地表現(xiàn)出更大的穩(wěn)定性穩(wěn)定狀態(tài)時(shí),乙環(huán)是緩慢的。并行關(guān)聯(lián)反饋回路的不快反應(yīng)阻力和噪音我們考慮在何種程度上耦合回路重要的反應(yīng)性能和抗噪聲。一個(gè)快速反饋回路中,激活自己的生產(chǎn)是一個(gè)緩慢的反饋回路平行放置其中乙激活自己的生產(chǎn)。
如上所述,生產(chǎn)速度我們的是驅(qū)動(dòng)由一筆或產(chǎn)品和B然而,法院不影響生產(chǎn)的任何一個(gè)B .模型圖3中的一個(gè)圖式。為例這里生產(chǎn)的法院是由加權(quán)總和的一而且,該方程dt= SA1 ? A 61、? B標(biāo)準(zhǔn)參數(shù)值=2,乙=100,kminout =0.001米的?1,科夫卡=0.3?1,kmin =0.01米,今敏=0.3米?1?1。值為1和2,,提供如下在傳奇圖3。圖3乙表明在一個(gè)反應(yīng)動(dòng)力學(xué)一個(gè)應(yīng)用,方波的增加從0到1.5,與高斯噪聲刺激如圖1乙??焖僮円粋€(gè)迅速增加,波動(dòng)的高原。由于速度快,噪音大的波動(dòng)的驅(qū)動(dòng)當(dāng)收益的0,一個(gè)很迅速返回基底價(jià)值觀。變量更逐漸增加的高原,因其時(shí)間常數(shù)較長(zhǎng),噪聲的驅(qū)動(dòng)器只有小波動(dòng)B耦合的強(qiáng)度計(jì)算,給出了參數(shù)1式10,以及之間的耦合計(jì)算并給出了2。如果12,我們將改變主要的變化所驅(qū)動(dòng)的,而如果21,我們將主要是由我們認(rèn)為2例:11 =1.6,2=0.4和2 62、1 =0.4,2=1.6。為12,該響應(yīng)縣刺激相似,一個(gè)快速增加,大幅度波動(dòng)在一個(gè)高原,和圖3。色在線動(dòng)態(tài)解耦并行反饋循環(huán)的。一模型示意圖。率合成分值比例無(wú)論是總結(jié)或產(chǎn)品的反饋和b提高了自身的綜合與夏令時(shí)間常數(shù),和飼料提高回自己的合成與緩慢的時(shí)間常數(shù)B乙模擬反應(yīng),刺激。在=12分鐘,是從0增加到1.5,和仍然升高,直到=38分鐘,在這時(shí)間返回0。高斯噪聲是目前具有刺激0.3的標(biāo)準(zhǔn)偏差和更新的時(shí)間步長(zhǎng)為1秒增加高原大的波動(dòng),而增加緩慢小波動(dòng)。Cl模擬響應(yīng)縣的刺激變化在1 =1.6,2=0.4。緩慢的時(shí)間過(guò)程,我們是主要的變化在1 =0.4,2=1.6。芹菜響應(yīng)模擬對(duì)法院的刺激乙與B系統(tǒng)不再是敏感 63、的差別變化的耦合強(qiáng)度的2循環(huán)的。相通的雙反饋回路以……物理評(píng)論79,0319022009031902—快速下降的觀察圖3Cl。為12,該響應(yīng)縣相似,乙,只顯示小波動(dòng)緩慢退出時(shí)間過(guò)程,圖3Cl。在兩案例,是動(dòng)態(tài)類似于圖1或乙布蘭曼等人。2。相結(jié)合的快速增加法院和一個(gè)緩慢的下降是不遵守。當(dāng)我們做迅速增加,我們是巨大的緩慢波動(dòng)時(shí)間過(guò)程,圖3Cl,所以結(jié)合的快速增加和抗噪音也沒(méi)有觀察。我們也視情況與生產(chǎn)縣成正比產(chǎn)品和B,在這種情況下,抗噪聲也是沒(méi)有得到,因?yàn)榫徛亩h(huán)路噪聲不能潮濕法院。該產(chǎn)品使用一個(gè)乙防止耦合的法庭被小。我們是波動(dòng)驅(qū)動(dòng)波動(dòng)甚至不斷乙圖3芹菜。
上述模擬表明,獲得在音樂(lè) 64、會(huì)動(dòng)態(tài)要素迅速增加,清點(diǎn),電阻噪音,和一個(gè)緩慢下降清點(diǎn),反饋回路不可解耦在圖3一和環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。8–10。相反的,
循環(huán)必須加上標(biāo)準(zhǔn)輸出回饋增加生產(chǎn)和B一個(gè)簡(jiǎn)單的,雙穩(wěn)態(tài)雙模式代表方面的
誘導(dǎo)和鞏固長(zhǎng)時(shí)程增強(qiáng)長(zhǎng)時(shí)程增強(qiáng)誘導(dǎo)和鞏固已提議包括積極的反饋回路中,激酶等鈣調(diào)蛋白激酶ⅡCaM KII或絲裂原活化蛋白激酶激酶直接或間接地提高自身磷酸化和活動(dòng)。持續(xù)的蛋白激酶磷酸化和活動(dòng)可能是由相互激活蛋白激酶及其上游激酶或蛋白激酶22 , 23和蛋白激酶來(lái)。自我維持的磷酸化和激活Ⅱ可能發(fā)生26 , 27。抑制蛋白激酶28塊長(zhǎng)時(shí)程增強(qiáng)。一個(gè)反饋回路中,激酶直接或間接增強(qiáng)自身磷酸化和激活可以表示為變量,一般 65、激活自己的生產(chǎn)。一是積極的數(shù)額激酶。時(shí)間尺度這一環(huán)是假定要快相對(duì)轉(zhuǎn)錄或翻譯??偨痤~激酶可能是由一個(gè)變量,在這種情況下數(shù)額積極將由B微分方程的一個(gè)可寫,類似于張等人。16,并代表一個(gè)與自身活化上限乙,在耦合,雙拓?fù)?,正慢反饋回路是假定的積極激酶行為增加總蛋白B的增加,總蛋白,在反過(guò)來(lái),往往會(huì)進(jìn)一步增加數(shù)額積極激酶通過(guò)大規(guī)模行動(dòng)。它必要的考慮如何增加積極激酶可以增加總蛋白。蛋白激酶可上調(diào)在神經(jīng)元仿真過(guò)程可以CaM KII31。確實(shí)。合成CaM KII在突觸可塑性分岔圖說(shuō)明了一系列的穩(wěn)態(tài)該模型。圖4乙表明,不斷刺激振幅從負(fù)到0.2,穩(wěn)定低和上國(guó)甲乙并存和分隔中東不穩(wěn)定的穩(wěn)定狀態(tài)。在模型中,代表激活信 66、號(hào)通路的蛋白激酶級(jí)聯(lián),與=0代表沒(méi)有激活。因此,負(fù)價(jià)值對(duì)不被視為生理。在以往的模型,緩慢的反饋回路長(zhǎng)乙賦予抵抗刺激噪聲。在一個(gè)集合的100個(gè)模擬與嘈雜的刺激,該模型是初始化在較低的穩(wěn)定狀態(tài)。嘈雜的刺激與常平均0.15模型參數(shù)的應(yīng)用,如圖4乙。高斯噪聲標(biāo)準(zhǔn)差為30%的意思是應(yīng)用。時(shí)間步長(zhǎng)是1號(hào)這噪聲噪聲的更新不穩(wěn)定的狀態(tài)下,但抗失穩(wěn)迅速增加而增加B乙快1秒,時(shí)間為半合奏運(yùn)輸?shù)妮^低的狀態(tài)T 0.5只有0.1小時(shí)乙=10,T 0.5是1小時(shí)乙=100和乙=1000,分別,只有11在100和3的100個(gè)模擬被破壞噪聲在6小時(shí)。甲氨蝶呤,百特拜恩物理評(píng)論,79,031902,2009圖4。雙穩(wěn)態(tài)簡(jiǎn)化模型代表假定反饋循環(huán)中的長(zhǎng)時(shí)程增強(qiáng)和乳鐵蛋白誘導(dǎo)和鞏固。一模型示意圖。在一個(gè)相對(duì)快速反饋回路時(shí)間常數(shù)的一,一激酶催化直接或間接自身磷酸化和活化。一個(gè)的金額是指積極激酶。外部的刺激,如鈣離子涌入一個(gè)神經(jīng)元,將提供最初的激酶激活。在另一緩慢的反饋回路時(shí)間常數(shù)乙,提高生產(chǎn),形成的能代表總款額激酶無(wú)效+主動(dòng)。乙分岔圖說(shuō)明穩(wěn)定一個(gè)國(guó)家,作為一個(gè)功能的不斷刺激強(qiáng)度。
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