現(xiàn)代醫(yī)學研究的信息資源與管理 ppt課件
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現(xiàn)代醫(yī)學研究的信息資源與管理,1,§1 制定檢索策略與文獻信息查詢,選題立題之初,應(yīng)—— 圍繞研究目的,檢索所有相關(guān)文獻信息, 全面剖析研究背景、現(xiàn)狀以及存在問題。,2,查詢哪些醫(yī)學信息源? 可及的信息資源或文獻數(shù)據(jù)庫又有哪些? 能否做到查新查全? 要回答這些問題,需要事先做好一系列籌劃設(shè)計,包括—— 構(gòu)建可查詢的檢索問題, 確定檢索范圍和文獻信息資源庫, 制定檢索策略 評估檢索結(jié)果等。,3,一、制定檢索策略 常由PECOT內(nèi)容組成: 人群或病人(population/patients)、 暴露或干預(yù)因素( exposure/intervention)、 比較(comparison), 結(jié)果(outcomes) 時間( time)等要素。 分解多個獨立詞匯,作為初始檢索用詞。 參考檢索數(shù)據(jù)庫詞典,選擇與初始檢索用詞最接近的標準檢索詞。,4,根據(jù)檢索目的和范圍,合理選用—— 檢索用詞(包括主題詞和副主題詞), 與邏輯運算符(如邏輯和“AND”,邏輯或“OR”,邏輯非“NOT”)、位置運算符(如WITH,NEAR,IN)、范圍運算符(“一”,“>”,“<”等)、截詞符(“*”)以及通配符(“?”)等。,5,制定檢索策略時應(yīng)同時兼顧檢索的敏感性(sensitivity)和特異性(specificity)。 若提高查全率,要制定高敏感性的檢索策略,擴大檢索范圍,如選用“邏輯或”、截詞符等; 若要提高查準率,需制定高特異性的檢索策略,縮小檢索范圍,提高相關(guān)文獻的檢出率,如選用“邏輯和”、位置運算符等。,6,二、文獻信息檢索 選擇信息資源庫與檢索工具: MEDLINE(美國“醫(yī)學索引在線PubMed”) EMBASE、 中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫(Chinese Biomedical Literature Database,CBM)等。 特點: 收錄文獻范圍廣、包羅萬象、條目數(shù)量龐大, 收錄互有交叉、質(zhì)量不一。,7,圖4-1 文獻信息檢索流程,8,三、檢索過程與結(jié)果評價 全面評價檢索質(zhì)量,避免漏檢或誤檢。 應(yīng)對檢索策略、檢索過程以及文獻信息檢索結(jié)果的完整性、真實性和重要性等進行綜合評價。,9,四、文獻信息檢索流程實例演示 1.提出一個可用于檢索的研究問題。如:“降壓治療能否降低Ⅱ型糖尿病伴有高血壓病人的病殘率和病死率?”。在該研究問題中,病人( patients)為“Ⅱ型糖尿病伴有高血壓病人”,干預(yù)(intervention)為“降壓治療”,比較(comparison)為“與未降壓組相比”,結(jié)果(outcomes)為“病殘率和病死率”。,10,2.制定檢索策略,實施檢索。 (1)選擇一個文獻檢索數(shù)據(jù)庫:如PubMed。 (2)確定檢索主題詞,設(shè)計檢索策略。 #1 "diabetes type 2/hypertension"[MeSH] Limits:Clinical Trial, Human #2 hypertensive Type 2 diabetic[MeSH] Limits: Clinical Trial, Human #3 "management" OR "therapeutic" #4 "mortality" OR "mobility" #5 (#1 0R #2) AND #3 AND #4,11,(3)檢索結(jié)果:52篇相關(guān)文獻(截至2007年7月) 1) Erdmann E,Dormandy JA, Charbonnel B, Massi-Benedetti M, Moules IK,Skene AM; PROactive Investigators. The effect of pioglitazone on recurrent myocardial infarction in 2445 patients with type 2 diabetes and previous myocardial infarction: results from the PROactive (PROactive 05) Study.J Am Coll Cardiol. 2007 May l;49 (17):1772-1780. Epub 2007 Apr 16. PMID: 17466227 [PubMed-indexed for MEDLINE];,12,2) Weber MA, Bakris GL, Dahlof B,Pitt B,Velazquez E, Gupte J,Lefkowitz M, Hester A. Shi V, Weir M, Kjeldsen S,Massie B,Nesbitt S,Ofili E, Jamerson K. Baseline characteristics in the Avoiding Cardiovascular events through Combination therapy in Patients Living with Systolic Hypertension (ACCOMPLISH) trial:a hypertensive population at high cardiovascular risk. Blood Press. 2007; 16 (1): 13-19. PMID:17453747 [PubMed-indexed for MEDLINE]; ……,13,3.檢索結(jié)果與文獻信息評價需對獲取文獻的質(zhì)量、時效性等展開嚴格評價。注意所獲得文獻信息一般有3~6個月的滯后期。,14,§2 常見的醫(yī)學信息資源,發(fā)展中國家的臨床研究者,在查詢文獻信息時,經(jīng)常會遇到截然相反的兩種困境。一方面是有用或高質(zhì)量信息不足或缺乏。由于經(jīng)費缺乏或其他條件限制,大量文獻原文無法獲取,形成“信息孤島”;另一方面則是信息泛濫問題,大量雜亂的灰色信息無處不在。研究者又面臨著如何從海量的信息資源中提取有價值信息的困境。 為此,了解現(xiàn)有醫(yī)學信息資源的類別與分布,掌握一些基本的查詢方法,學會利用互聯(lián)網(wǎng)或其他電子信息資源,將有助于及時追蹤研究領(lǐng)域的最新進展,全面了解專業(yè)學科的最新發(fā)展動態(tài)。,15,,一、常見的醫(yī)學信息源種類與分布 醫(yī)學信息來源很廣,包括電子文獻檢索數(shù)據(jù)庫(如MEDLINE),課題研究進展報告,學術(shù)會議資料,引文索引,論著和教科書以及個人經(jīng)驗交流等。在圖4-2中,主要醫(yī)學信息源若按照可及數(shù)量和關(guān)聯(lián)度大小排列,就形成了金字塔狀的分布結(jié)構(gòu)。其中與研究問題高度相關(guān)的信息源主要是電子文獻檢索數(shù)據(jù)庫,這些數(shù)據(jù)庫以固定的標準詞匯建立索引,利用索引可以進行精確的檢索。在圖4-2金字塔中,越向下的部分,與研究問題相關(guān)的文獻分布密度越低,塔底為WWW來源信息,密度最低,大部分為躁度信息或灰色文獻。但若只查詢高密度醫(yī)學信息源,可能會漏掉部分有用文獻信息,但要查全這部分信息,則又可能花費大量的時間和人力,得不償失。因此需要結(jié)合檢索目的,在兩者之間進行權(quán)衡。,16,圖4-2醫(yī)學文獻信息金字塔,17,,醫(yī)學信息級別分布,呈金字塔狀—— 高級別文獻信息數(shù)量少,分布在塔尖, 低級別文獻信息數(shù)量龐大,分布在塔底。 一般來講高級別文獻信息是由低級別信息綜合提煉加工而成,例如—— 臨床實踐指南 評價查詢結(jié)果時,應(yīng)判斷獲取的文獻信息類型、級別分布是否呈金字塔狀。,18,二、電子文獻檢索數(shù)據(jù)庫 指南、 系統(tǒng)評價、 RCT試驗研究 其他計量研究等。 全文數(shù)據(jù)庫則收錄了原始文獻的全部內(nèi)容,如Cochrane系統(tǒng)評價數(shù)據(jù)庫。,19,,電子文獻數(shù)據(jù)庫允許綜合應(yīng)用邏輯、位置運算符等制定檢索策略。 尋求圖書管理員的幫助,利用熟悉的檢索方法,實現(xiàn)快速有效的檢索。,20,,表4-1 電子文獻數(shù)據(jù)庫一覽,21,,三、灰色文獻資源庫 電子文獻數(shù)據(jù)庫是臨床研究的主要醫(yī)學信息源,但大多只能得到摘要,無法獲取文獻全文。 存在發(fā)表性偏倚。 大約25%臨床研究在10年內(nèi)并無文獻發(fā)表,因無法被電子文獻數(shù)據(jù)庫收錄而出現(xiàn)缺失。 論文發(fā)表年限平均為5年;倘若得到陰性結(jié)果,則很少被發(fā)表, 如公開發(fā)表文獻中有85%報告結(jié)果有統(tǒng)計學意義,一些主要醫(yī)學雜志(如BMJ、JAMA和柳葉刀雜志)只有10%陰性結(jié)果的論文被發(fā)表。,22,,另外文獻的收錄也存在地域性偏倚。 如在一個收錄了3000~4000種雜志的文獻數(shù)據(jù)庫中,只有2%的文獻來自中低收入的發(fā)展中國家, 發(fā)表在這些國家國內(nèi)雜志上的文獻超過90%并沒有被主要電子檢索數(shù)據(jù)庫收錄。 為彌補電子文獻數(shù)據(jù)庫的上述缺陷,可查閱一些灰色文獻數(shù)據(jù)庫作為重要補充。 灰色文獻對臨床研究也很重要。如有研究表明,系統(tǒng)評價和Meta分析中若不考慮灰色文獻,將可能導(dǎo)致效應(yīng)量被高估10%以上。,23,,灰色文獻—— 是指由各級政府部門、學術(shù)機構(gòu)、商業(yè)與其他機構(gòu)生產(chǎn)的,不以贏利為目的的印刷品和電子產(chǎn)品。 形式多種多樣,可以是各種報告(進展報告、技術(shù)報告、統(tǒng)計報告、市場研究報告),也可以是論文,討論進展,技術(shù)說明與標準,非營利性的譯文,著作,技術(shù)與商業(yè)文件,非營利性的官方文件等等。 這些文獻信息未經(jīng)過嚴格評價,缺乏可信度,所以稱為灰色文獻。,24,,較為常用的灰色文獻數(shù)據(jù)庫—— 國家圖書數(shù)據(jù)庫與目錄庫、 相關(guān)學術(shù)組織或機構(gòu)網(wǎng)頁及鏈接數(shù)據(jù)庫等。 包括數(shù)量龐大的、有潛在價值的網(wǎng)頁,這些網(wǎng)頁是由一些小的或不知名的機構(gòu)、非政府組織(NGO)、學術(shù)研究中心、私人公司及咨詢公司等創(chuàng)建。,25,,(一)國家圖書數(shù)據(jù)庫與目錄 建立與發(fā)展國家圖書數(shù)據(jù)庫與目錄,對國內(nèi)外研究者均很重要。例如,我國出版了科學論文文摘與索引,收錄的文獻,大部分以中文發(fā)表。表4-2列出了一些國家級圖書數(shù)據(jù)庫。,26,,表4-2國家文獻數(shù)據(jù)庫一覽,27,,國家圖書數(shù)據(jù)庫與目錄可能無網(wǎng)絡(luò)版和光盤版,檢索需要付費,檢索系統(tǒng)也需要進一步完善,如增加一些檢索輔助功能等。,28,,(二)相關(guān)組織機構(gòu)網(wǎng)頁 一些組織機構(gòu),如國際發(fā)展研究中心( IDRC)、世界銀行、衛(wèi)生研究發(fā)展委員會(COHRED)或衛(wèi)生研究世界論壇(GFHR)等正逐步將其內(nèi)部文件、報告發(fā)布到網(wǎng)上。對此類組織機構(gòu)網(wǎng)頁查詢,可分類進行檢索。,29,,1.發(fā)展組織機構(gòu)類,如世界銀行、USAID、CIDA、DFID、WHO、UN、AusAID和歐盟等。這些機構(gòu)因是大量衛(wèi)生研究的資助方,定期會將研究進展、技術(shù)報告等發(fā)布在網(wǎng)頁。 2.專業(yè)組織機構(gòu)類,如國際HIV/AIDS聯(lián)盟,瘧疾國際基金會,國際抗結(jié)核和肺病聯(lián)合會等。這些組織和機構(gòu)隨時發(fā)布與疾病有關(guān)的最新信息以及研究進展報告等。 3.國家級研究機構(gòu)類,如非洲醫(yī)學研究基金會,印度醫(yī)學研究會等。這些研究機構(gòu)也會定期發(fā)布資助項目的研究報告。,30,,(三)WWW網(wǎng)頁鏈接查詢 互聯(lián)網(wǎng)目前已有超過500億個人網(wǎng)頁,可用Google和Yahoo等搜索引擎檢索。最近在對7個Cochrane系統(tǒng)評價進行再評價的一項研究中,通過檢索WWW網(wǎng)頁查詢未公開發(fā)表文獻,結(jié)果共耗時21小時評價了429個相關(guān)網(wǎng)頁,從中新發(fā)現(xiàn)了9個臨床試驗。 由于缺乏索引,同時搜索范圍廣,涉及整個Internet網(wǎng),查詢很費時,即使有檢索策略,WWW檢索結(jié)果的精度仍很差,會得到大量無關(guān)文獻。,31,- 1.請仔細閱讀文檔,確保文檔完整性,對于不預(yù)覽、不比對內(nèi)容而直接下載帶來的問題本站不予受理。
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