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科學(xué)知識(shí)圖譜方法與應(yīng)用繪制圖譜的主要軟件操作侯海燕博士大連理工大學(xué)人文社會(huì)科學(xué)學(xué)院科技倫理與科技管理研究中心網(wǎng)絡(luò)-科學(xué)-信息-經(jīng)濟(jì)計(jì)量實(shí)驗(yàn)室WISELAB2009年9月12日,講座提綱,科學(xué)知識(shí)圖譜的主要研究方法科學(xué)知識(shí)圖譜的主要數(shù)據(jù)來源科學(xué)知識(shí)圖譜的主要應(yīng)用軟件繪制圖譜的軟件操作演示,科學(xué)知識(shí)圖譜的主要研究方法Methods,共引分析Co-citationanalysisJournalco-citationanalysis(JCA)期刊共引分析Authorco-citationanalysis(ACA)作者共引分析Documentco-citationanalysis(DCA)文獻(xiàn)共引分析共詞分析Co-wordanalysis關(guān)鍵詞共詞分析Co-wordanalysisofkeywords主題詞共詞分析Co-wordanalysisoftitlewords多元統(tǒng)計(jì)分析方法因子分析（主成分分析）factoranalysisPCA多維尺度分析MDS-multidimensionalscaling聚類分析Clusteranalysis詞頻分析方法Frequencyanalysisofwords社會(huì)網(wǎng)絡(luò)分析方法Socialnetworkanalysis,科學(xué)知識(shí)圖譜的主要數(shù)據(jù)來源Data,主要數(shù)據(jù)來源：WebofScience科學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)：《科學(xué)引文索引》數(shù)據(jù)庫(SCI)《社會(huì)科學(xué)引文索引》數(shù)據(jù)庫(SSCI)專利文獻(xiàn)數(shù)據(jù)：德溫特創(chuàng)新索引DerwentInnovationsIndex國際會(huì)議文獻(xiàn)數(shù)據(jù)：ConferenceProceedingsCitationIndex-Science(CPCI-S)分析的基本數(shù)據(jù)單元：作者author標(biāo)題title關(guān)鍵詞keywords摘要Abstract引文citedreferences(被引作者、被引期刊、被引文獻(xiàn)）作者地址（機(jī)構(gòu)合作、國家合作）,應(yīng)用的主要軟件Software——共引分析、共詞分析軟件,Bibexcelhttp://www.umu.se/inforsk/Bibexcel/---afree-wareon-linedevelopedbyOllePerssonbibliometricscitationanalysisco-citationanalysisbibliographiccouplingclusteranalysis,SPSS多元統(tǒng)計(jì)分析及可視化軟件Correlationanalysis,PCA(factoranalysis),MDS,clusteranalysisWordsmithTools詞頻分析軟件Frequencyanalysisofwords,應(yīng)用的主要軟件Software,科學(xué)計(jì)量學(xué)主要的分支學(xué)科及其代表人物圖3-1科學(xué)計(jì)量學(xué)學(xué)科結(jié)構(gòu)知識(shí)圖譜，1978-2004,科學(xué)計(jì)量學(xué)在親本學(xué)科——科學(xué)學(xué)中的位置,科學(xué)計(jì)量學(xué)與相鄰學(xué)科關(guān)系圖3-4科學(xué)計(jì)量學(xué)與相鄰學(xué)科關(guān)系知識(shí)圖譜,科學(xué)計(jì)量學(xué)主流研究領(lǐng)域知識(shí)圖譜，1978-2004,科學(xué)計(jì)量學(xué)研究領(lǐng)域的演變圖4-81978-1986年科學(xué)計(jì)量學(xué)主流研究領(lǐng)域知識(shí)圖譜,科學(xué)計(jì)量學(xué)研究領(lǐng)域的演變圖4-101987-1995年科學(xué)計(jì)量學(xué)主流研究領(lǐng)域知識(shí)圖譜,科學(xué)計(jì)量學(xué)研究領(lǐng)域的演變圖4-121996-2004年科學(xué)計(jì)量學(xué)前沿研究領(lǐng)域知識(shí)圖譜,PajekSocialnetworkanalysisUCINETSocialnetworkanalysis,應(yīng)用的主要軟件Software——社會(huì)網(wǎng)絡(luò)分析軟件、可視化軟件,UCINET,最流行的社會(huì)網(wǎng)分析軟件，其中包括一維與二維數(shù)據(jù)分析的NetDraw，同時(shí)集成了Pajek用于大型網(wǎng)絡(luò)分析的免費(fèi)應(yīng)用軟件程序。不同的社會(huì)網(wǎng)軟件的文件都具有自己的格式，但是也可以自由轉(zhuǎn)換。譬如，利用UCINET軟件可以讀取文本文件、KrackPlot、Pajek、Negopy、VNA等格式的文件。,Pajek,Pajek(ProgramAnalysisforLargeNetwork),由盧布爾雅那大學(xué)的VladimirBatagelj和AndrejMrvar于1997年1月15日正式發(fā)布0.1版，是一項(xiàng)基于Windows的免費(fèi)社會(huì)科學(xué)軟件，主要用于社會(huì)網(wǎng)絡(luò)分析，特點(diǎn)是可視化。該軟件可以提供非商業(yè)應(yīng)用的免費(fèi)下載，下載網(wǎng)址:http://vlado.fmf.uni-lj.si/pub/networks/pajek/CreatPajek可以把excel格式的文件轉(zhuǎn)換為Pajek格式的軟件。,科學(xué)計(jì)量學(xué)合作網(wǎng)絡(luò)知識(shí)圖譜，1978-2004,科學(xué)計(jì)量學(xué)合作網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的演變圖5-4科學(xué)計(jì)量學(xué)合作網(wǎng)絡(luò)的微觀結(jié)構(gòu)圖譜，1978-1986,科學(xué)計(jì)量學(xué)合作網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的演變圖5-5科學(xué)計(jì)量學(xué)合作網(wǎng)絡(luò)的微觀結(jié)構(gòu)圖譜，1987-1995,科學(xué)計(jì)量學(xué)合作網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的演變圖5-6科學(xué)計(jì)量學(xué)合作網(wǎng)絡(luò)的微觀結(jié)構(gòu)圖譜，1996-2004,應(yīng)用的主要軟件Software——多視角共引分析可視化軟件,citespace---afree-wareon-linedevelopedbyChaomeiChen1、通過引文網(wǎng)絡(luò)分析，找出學(xué)科領(lǐng)域演化的關(guān)鍵路徑2、找出學(xué)科領(lǐng)域演化的關(guān)鍵點(diǎn)文獻(xiàn)（知識(shí)拐點(diǎn)）3、分析學(xué)科前沿?zé)狳c(diǎn)4、探測(cè)學(xué)科知識(shí)基礎(chǔ),文獻(xiàn)共引圖譜,,國際納米研究領(lǐng)域的主要期刊分布圖譜,,,物理期刊,化學(xué)期刊、納米期刊、及其他,,,期刊共引圖譜,物理期刊,化學(xué)期刊、納米期刊、及其他,期刊共引圖譜,期刊共引圖譜,作者共引圖譜,,,作者合作網(wǎng)絡(luò)圖譜,,2納米粒子,,,,,,1納米薄膜、納米晶體、納米線、納米結(jié)構(gòu)、碳納米管,4納米管吸附、納米硅,6納米棒陣列、氧化鋅納米線,,,3光譜分析、納米金、納米簇,5納米復(fù)合材料、納米輸運(yùn)、納米器件、納米技術(shù)、納米場效應(yīng)晶體管,7碳納米管場發(fā)射機(jī)理,8納米傳感器、蛋白質(zhì)納米技術(shù),,,圖9國際納米研究熱點(diǎn)知識(shí)圖譜,共詞圖譜,,2納米粒子,,,,,1納米薄膜、納米晶體、納米線、納米結(jié)構(gòu)、碳納米管,4納米管吸附、納米硅,6納米棒陣列、氧化鋅納米線,,,3光譜分析、納米金、納米簇,5納米復(fù)合材料、納米輸運(yùn)、納米器件、納米技術(shù)、納米場效應(yīng)晶體管,7碳納米管場發(fā)射機(jī)理,,,圖9國際納米研究熱點(diǎn)知識(shí)圖譜,,8納米傳感器、蛋白質(zhì)納米技術(shù),共詞圖譜,,CiteSpace軟件介紹,學(xué)科領(lǐng)域圖譜,TheCiteSpaceHomepagehttp://cluster.cis.drexel.edu/~cchen/citespace,CiteSpace始開發(fā)于2004年9月13日，于2007年3月20日最近更新(CiteSpace2.0.11b)由美國德雷克塞爾大學(xué)（費(fèi)城）信息科學(xué)與技術(shù)學(xué)院（TheCollegeofInformationScienceandTechnology,DrexelUniversity）ChaomeiChen教授研究開發(fā)。,ChaomeiChen教授研究的InformationVisualization–CiteSpace是近幾年來在全美信息分析中最具有特色和影響力的可視化信息軟件。從2000年至今，在這一研究領(lǐng)域中ChaomeiChen教授發(fā)表了研究論文65篇，出版了6部研究專著。現(xiàn)擔(dān)任美國《InformationVisualization》期刊的總編。,CiteSpace是Java的應(yīng)用程序，可免費(fèi)獲得使用。http://cluster.cis.drexel.edu/~cchen/citespace/download.html它要求JRE1.4.2或是更高的版本作為運(yùn)行環(huán)境。盡管CiteSpace能夠通過PubMed或者大量的網(wǎng)絡(luò)服務(wù)獲取額外的信息，但是互聯(lián)網(wǎng)對(duì)CiteSpace而言并不是必須的。,citespace輸入的數(shù)據(jù)文件應(yīng)該是ISI輸出的格式，即從webofscience下載的格式。citespace帶有一個(gè)數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換器，可以將從網(wǎng)絡(luò)上保存的數(shù)據(jù)進(jìn)行轉(zhuǎn)換。,軟件運(yùn)行之前的基本步驟：1.為citespace準(zhǔn)備數(shù)據(jù)。將數(shù)據(jù)文件放在一個(gè)文件夾。每個(gè)數(shù)據(jù)文件名必須以“download”開頭，并以“.txt”結(jié)尾，例如“download-mass-extinction-2006.txt”2.開始用citespace創(chuàng)建一個(gè)新的項(xiàng)目之前，你需要具體制定兩個(gè)路徑，一個(gè)是數(shù)據(jù)存儲(chǔ)路徑，一個(gè)是項(xiàng)目存儲(chǔ)路徑，在項(xiàng)目存儲(chǔ)路徑可以找到你保存的圖譜和輸出文件。3.根據(jù)相應(yīng)的時(shí)間分段調(diào)整timeslicing。4.按“GO”按鈕，你就會(huì)看到軟件處于運(yùn)行狀態(tài)，當(dāng)運(yùn)行過程結(jié)束的時(shí)候你會(huì)發(fā)現(xiàn)彈出一個(gè)新的窗口。,CiteSpace相關(guān)名詞術(shù)語,Thresholds–selectioncriteriausedbyCiteSpace–itemsmusthavemeasuresabovethresholdvaluestobeincludedinmodelingandvisualizationprocesses.Timeslicing–adivide-and-conquerstrategythatdividesaperiodoftimeintoaseriesofsmallerwindows.Betweennesscentrality–ametricofanodeinanetworkthatmeasureshowlikelyanarbitraryshortestpathinthenetworkwillgothroughthenode.Burstterms–singleormulti-wordphrasesextractedfromthetitle,abstract,orotherfieldsofabibliographicrecordandthefrequencyofthetermbursts,i.e.sharplyincreases,overaperiodoftime.Citation–aninstancethatapublicationreferencestoanotherpublication.,Co-authors–authorswhoappearintheauthorfieldofthesamebibliographicrecord.Co-citation–aninstanceinwhichtwoitems,suchasauthors,documents,orjournals,thatarecitedbyapublication.Time-zoneview–arestrictedviewinwhichthemovementofnodesislimitedtoverticaltimezonescorrespondingtothetimeoftheirpublication.Turningpoints–nodesofhighbetweennesscentralities(>1.00).Suchnodestendtobecriticalinnetworktransitionsfromonetimeslicetoanother.Clusterview–anetworkisvisualizedinamodifiedspring-embeddernodeplacementalgorithm.Pathfindernetworkscaling–anetworkscalingalgorithmthatremoveslinksthatviolatetriangleinequalityconditionssoastosimplifyanetworkbyretainingsalientlinksandpathsonly.,CiteSpace的簡要操作步驟,1.Access/ObtainCiteSpaceandhowtorun獲取和運(yùn)行TheCiteSpaceHomepagehttp://cluster.cis.drexel.edu/~cchen/citespace兩種方法運(yùn)行citespacea.UseJavaWebStartdirectly通過網(wǎng)絡(luò)直接啟動(dòng)b.下載citespace.jar文件（網(wǎng)頁download）方法a：能保證始終用到最新版本，且運(yùn)行速度快,2.PrepareBibliographicDataFiles準(zhǔn)備文獻(xiàn)數(shù)據(jù)從webofscience檢索和保存數(shù)據(jù)方法：a.MakeageneralsearchinWebofScienceb.Markallsearchresultsc.Savetherecords,includingCitedReferences,infieldtaggedformat.d.Nameyourfilesasdownload*.txtE.g.downloadScience1999a.txt,download2004.txte.Savealldatafilesinafolderonyourcomputer.,3.WhatinformationinbibliographicdataisusedbyCiteSpace?CiteSpace使用下載數(shù)據(jù)的那些信息？A:Authors作者B:Title,Descriptors,Identifiers,Abstract題目、主題詞、關(guān)鍵詞、摘要C:CitedReferences引用的參考文獻(xiàn)D:TimesCited引用次數(shù)E:YearofPublication發(fā)表年份,,,,,,,,,BLAZERDG,1994,AMJPSYCHIAT,V151,P979EATONL,2001,NYTIMES1116,A1FOTHERGILLA,1999,DISASTERS,V23,P156FULLERTONCS,1999,AVIATSPACEENVIRMD,V70,P902GINEXIEM,2000,AMJCOMMUNPSYCHOL,V28,P495GOENJIANAK,2001,AMJPSYCHIAT,V158,P788GREENBL,1990,JAPPLSOCPSYCHOL,V20,P1033HANSONRF,1995,JCONSULTCLINPSYCH,V63,P987HARVEYAG,1999,JCONSULTCLINPSYCH,V67,P985KAWACHII,2001,JURBANHEALTH,V78,P458KESSLERRC,1995,ARCHGENPSYCHIAT,V52,P1048KILPATRICKDG,1987,CRIMEDELINQUENCY,V33,P479MADAKASIRAS,1987,JNERVMENTDIS,V175,P286MAZURECM,2000,AMJPSYCHIAT,V157,P896NORTHCS,1999,JAMA-JAMMEDASSOC,V282,P755ORTEGAAN,2000,AMJPSYCHIAT,V157,P615POLEN,2001,JNERVMENTDIS,V189,P442RESNICKH,1999,JANXIETYDISORD,V13,P359RESNICKHS,1993,JCONSULTCLINPSYCH,V61,P984ROTHBAUMBO,1992,JTRAUMASTRESS,V5,P455RUBONISAV,1991,PSYCHOLBULL,V109,P384RUEFAM,2000,CULTURALDIVERSITYE,V6,P235SHAHB,1997,SUDAANUSERSMANUALSHALEVAY,1998,AMJPSYCHIAT,V155,P630SHALEVAY,2000,JCLINPSYCHIATS5,V61,P33SHERBOURNECD,1991,SOCSCIMED,V32,P705SHOREJH,1989,JNERVMENTDIS,V177,P681TUCKERP,2000,JBEHAVHEALTHSERR,V27,P406NR32TC179PUMASSACHUSETTSMEDICALSOC/NEJMPIWALTHAMPAWALTHAMWOODSCENTER,860WINTERST,,WALTHAM,MA02451-1413USASN0028-4793J9NENGLJMEDJIN.Engl.J.Med.PDMAR28PY2002VL346IS13BP982EP987PG6SCMedicine,GeneralNATIONALCOMORBIDITYSURVEY;MAJORDEPRESSION;NATURALDISASTER;SOCIALSUPPORT;OKLAHOMA-CITY;PREVALENCE;PSYCHOPATHOLOGY;SURVIVORS;SYMPTOMSABBackground:ThescopeoftheterroristattacksofSeptember,A,B,C,D,E,,,,11,2001,wasunprecedentedintheUnitedStates.Weassessedtheprevalenceandcorrelatesofacutepost-traumaticstressdisorder(PTSD)anddepressionamongresidentsofManhattanfivetoeightweeksaftertheattacks.Methods:Weusedrandom-digitdialingtocontactarepresentativesampleofadultslivingsouthof110thStreetinManhattan.Participantswereaskedaboutdemographiccharacteristics,exposuretotheeventsofSeptember11,andpsychologicalsymptomsaftertheattacks.Results:Among1008adultsinterviewed,7.5percentreportedsymptomsconsistentwithadiagnosisofcurrentPTSDrelatedtotheattacks,and9.7percentreportedsymptomsconsistentwithcurrentdepression(with``current``definedasoccurringwithintheprevious30days).AmongrespondentswholivedsouthofCanalStreet(i.e.,neartheWorldTradeCenter),theprevalenceofPTSDwas20.0percent.…………,AUGalea,SAhern,JResnick,HKilpatrick,DBucuvalas,MGold,JVlahov,DTIPsychologicalsequelaeoftheSeptember11terroristattacksinNewYorkCity.SONEWENGLANDJOURNALOFMEDICINELAEnglishDTArticleIDPOSTTRAUMATIC-STRESS-DISORDER;NATIONALCOMORBIDITYSURVEY;MAJORDEPRESSION;NATURALDISASTER;SOCIALSUPPORT;OKLAHOMA-CITY;PREVALENCE;PSYCHOPATHOLOGY;SURVIVORS;SYMPTOMSABBackground:ThescopeoftheterroristattacksofSeptember,,,,,co-authorship,co-occurringburstterms,,,,,,A,B,B,B,,CR2001,NYTIMES1226,B2*AMPSYCHASS,1994,DIAGNSTATMANMENT*DEPHLTHHUMANSE,1999,MENTHLTHREPSURGG*USBURCENS,2000,STF3ADEPCOMMBURCBLAZERDG,1994,AMJPSYCHIAT,V151,P979EATONL,2001,NYTIMES1116,A1FOTHERGILLA,1999,DISASTERS,V23,P156FULLERTONCS,1999,AVIATSPACEENVIRMD,V70,P902GINEXIEM,2000,AMJCOMMUNPSYCHOL,V28,P495GOENJIANAK,2001,AMJPSYCHIAT,V158,P788GREENBL,1990,JAPPLSOCPSYCHOL,V20,P1033HANSONRF,1995,JCONSULTCLINPSYCH,V63,P987HARVEYAG,1999,JCONSULTCLINPSYCH,V67,P985KAWACHII,2001,JURBANHEALTH,V78,P458KESSLERRC,1995,ARCHGENPSYCHIAT,V52,P1048KILPATRICKDG,1987,CRIMEDELINQUENCY,V33,P479MADAKASIRAS,1987,JNERVMENTDIS,V175,P286MAZURECM,2000,AMJPSYCHIAT,V157,P896NORTHCS,1999,JAMA-JAMMEDASSOC,V282,P755ORTEGAAN,2000,AMJPSYCHIAT,V157,P615POLEN,2001,JNERVMENTDIS,V189,P442RESNICKH,1999,JANXIETYDISORD,V13,P359RESNICKHS,1993,JCONSULTCLINPSYCH,V61,P984ROTHBAUMBO,1992,JTRAUMASTRESS,V5,P455RUBONISAV,1991,PSYCHOLBULL,V109,P384RUEFAM,2000,CULTURALDIVERSITYE,V6,P235SHAHB,1997,SUDAANUSERSMANUALSHALEVAY,1998,AMJPSYCHIAT,V155,P630SHALEVAY,2000,JCLINPSYCHIATS5,V61,P33SHERBOURNECD,1991,SOCSCIMED,V32,P705SHOREJH,1989,JNERVMENTDIS,V177,P681TUCKERP,2000,JBEHAVHEALTHSERR,V27,P406,,,,,documentco-citation,,,,,authorco-citation,,,,,journalco-citation,ACA/DCA/JCA,C,,,NR32TC179PUMASSACHUSETTSMEDICALSOC/NEJMPIWALTHAMPAWALTHAMWOODSCENTER,860WINTERST,,WALTHAM,MA02451-1413USASN0028-4793J9NENGLJMEDJIN.Engl.J.Med.PDMAR28PY2002VL346IS13BP982EP987PG6SCMedicine,General&InternalGA534UYUTISI:000174608600006ER,D,E,4.GetstartedwithCiteSpace（開始使用citespace）數(shù)據(jù)導(dǎo)入(datedirectory)：直接選定數(shù)據(jù)存放的文件夾，注意不要進(jìn)入文件夾。,5.ChooseNetworkAnalysis（選擇分析方法）：CitedAuthor:AuthorCo-CitationAnalysis(ACA)CitedReference:DocumentCo-CitationAnalysis(DCA)CitedJournals:JournalCo-CitationAnalysis(JCA)Authors:Co-AuthorsTerms:Co-Terms,ACA,DCA,Co-Authorship,JCA,Co-Term(Burst),CiteSpace軟件特色及原理,1、原始數(shù)據(jù)不需要轉(zhuǎn)化為矩陣的格式，可以將WOS及PubMed等數(shù)據(jù)庫的原始數(shù)據(jù)格式直接導(dǎo)入CiteSpace進(jìn)行運(yùn)算及作圖。2、對(duì)于同一數(shù)據(jù)樣本，可以進(jìn)行多種圖譜的繪制，從不同角度展現(xiàn)數(shù)據(jù)演化特征。3、軟件通過為節(jié)點(diǎn)和連線標(biāo)記不同顏色，清晰地展現(xiàn)出文獻(xiàn)數(shù)據(jù)隨時(shí)間變化的脈絡(luò)。4、節(jié)點(diǎn)的彩色年輪表示法清晰展現(xiàn)了不同時(shí)間段的引證情況。5、連線的顏色代表了該連接共引次數(shù)最早達(dá)到所選擇閾值的時(shí)間。,特色：,,圖譜繪制的具體操作演示,謝謝大家,